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胰岛素类药物的钱事今生
作者:德尔塔 日期:2022-04-18
导读: 胰岛素类药物在当今医药界,真可谓是明星家族,虽不如现如今红得发紫的“麦博士(Mabs)”,但无论是按照其适应症I型糖尿病的全球病患基数,还是其高昂的药价,以及全球主要胰岛素类药物生产企业高额的销售数字,都值得我们密切关注。那么今天我们就聊聊胰岛素药物的“‘钱’ 事今‘生’”,和大家共同探讨胰岛素类药物为什么那么贵( ‘钱’ 事),这些昂贵的药物是如何被生产出来的呢(今‘生’ )? 最近,一篇名为《美 国 有 药 神》的文章在朋友圈被热转,使胰岛素类药物的曝光率大大提高,文中讲述的故事与2018年徐峥主演的电影《我不是药神》情节类似,只不过,这次的主角救命药不是**白血病的格列卫,而是**I型糖尿病的胰岛素,而发生地是在发达资本主义老大哥美国。 如X博士《美国有药神》文中所述,每支胰岛素几百美刀的高昂价格,让很多人承受不起,因为I型糖尿病患者,对胰岛素类药物注射是高度依赖性的,一旦到了注射胰岛素的程度,基本就是终生需要,另外使用频率也很高,注射频率从每天注射到每餐注射不等,这么贵的药物,再乘以这么高的使用频率,可不是每个人都能承受的起这种高消费,也就无怪乎有人跨国买药乃至以此牟利了。 虽然身边的朋友也有糖尿病患者,需要打胰岛素,但是以前还真没关注过具体价格,上文中的文章给了点提示,但是网上搜一搜价格,却还是吓了一跳。国内胰岛素类药物价格虽然没有前面文章中写的美国那么高,但也绝非便宜,以每天需要注射一次的长效胰岛素的甘精胰岛素为例,赛诺菲安万特的来得时单支售价在170元以上,甘李药业的长秀霖单支售价也接近150元。再看需要餐前注射的速效胰岛素——重组人胰岛素为例,诺和诺德的诺和灵R和珠海联邦的优思灵价格(下图来源连接)都在60元以上。仔细算下账,无论长效速效,一周注射一支短效或者20天左右一支长效胰岛素类药物,150到180元的胰岛素药品钱是必定要付出的了,区别在于一天注射一次还是注射三次,以及所带来的痛苦程度。 胰岛
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微射流超高压均质机工作原理简介
作者:德尔塔 日期:2022-04-18
微射流超高压均质机(Microfluidizer Ultra High Pressure Homogenizer )目前市面上主要有两种类型:一种以BEE为代表使用喷嘴+乳化腔的均质核心组合(在乳化腔内回弹的射流与新进入乳化腔的液流对射),另一种是以Microfluidics与Genizer为代表,配备第二代金刚石交互容腔的微射流超高压均质机。有研究对比各种类型的超高压均质机均质核心的剪切效率,结果显示第二代金刚石交互容腔具有相对更高的均质剪切效率。 本文将简介MFIC与Genizer微射流超高压均质机的工作原理。 微射流超高压均质机可分为2部分:1)动力单元+2)均质核心金刚石交互容腔(Diamond Interaction Chamber),动力单元为物料进入高压缸、加压、进入反应核心的提供动力;固液或液液混合物料,加压后经过百微米级的不锈钢孔道,形成超音速射流(可>500m/s),在金刚石交互容腔内壁处产生剧烈的剪切、碰撞、空穴以及另一端的对射作用,双股射流对射瞬间相对速度加倍,产生对射爆炸效应。物料间的相互碰撞,大大降低了物料对交互容腔腔体的磨损、剪切,延长了腔体使用寿命;微射流高压均质技术集合了微射流、撞击流和传统高压均质技术的优势于一体,具有更高的均质效率。 图 微射流高压均质机工作原理示意图 均质核心:金刚石交互容腔是保证微射流高压均质反应的核心元件,对射作用的原理示意如下图, 图 金刚石交互容腔对射作用原理示意图 温控:微射流金刚石交互容腔可通过夹套,以及物料换热器,连接温控装置来调控温度 图 带夹套温控型金刚石交互容腔构造示意图 图 物料换热器 微射流高压均质机其他特点: 1. PLC数控,通过触摸屏调控压力、反应体积、反应时间 图 PLC触控压力、反应体积、反应时间 实验型微射流超高压均质机最小反应体积5ml,不做任何处理情况下,死体积约1ml。
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首个核内DNA感受器hnRNPA2B1
作者:德尔塔 日期:2022-04-18
病毒入侵宿主时,宿主表达的模式识别受体(Pattern recognition receptors,PRRs)可以识别病毒,激发适应性免疫以清除病原体,此为固有免疫。在PRRs中,胞质DNA感受器(包括cGAS,DDX41,DAI,AIM2,IFI16等)研究较为广泛[1-4],特别是陈志坚教授及其团队发现的cGAS酶[1],可以识别外源的双链DNA(如病毒),催化生成环鸟腺苷酸分子(cGAMP),激活干扰素刺激蛋白STING,从而激发细胞的免疫和炎症反应,这就是目前免疫研究领域炙手可热的明星通路cGAS-STING。 以上所说免疫反应发起点发生在细胞质中,当病原性DNA入核之后,是否存在类似的DNA感受器可以感知外源性DNA以激活免疫反应仍然长期充满争议。 就在2019年7月18日,Science在线发表了南开大学曹雪涛院士团队的科研成果“Nuclear hnRNPA2B1 initiates and amplifies the innate immune response to DNA viruses”。 该研究发现了细胞核内的新型DNA感受器——hnRNPA2B1,它可以在核内识别病原性DNA,形成同源二聚体,被脱甲基酶JMJD6去甲基后,易位到细胞质中,进而激活TBK1-IRF3信号通路,促使IFN-α/β的产生。 在此过程中同时还会促使免疫关键因子cGAS,IFI16和STING的mRNA的N6-甲基腺苷(m6A)修饰,翻译及核质转移,进一步确保IFN-α/β的活化。 南模生物为该研究构建了关键的Hnrnpa2b1fl/fl小鼠模型 研究人员首先从被HSV-1(Herpes simplex virus-1,单纯孢疹病毒)感染的AW264.7细胞核提取物中沉淀出HSV-1基因组DNA结合蛋白,通过质谱分析获得潜在的23个候选蛋白,通过siRNA功能实验,筛选出所谓的DNA感受器蛋白——hnRNPA2B1。 在Hnrnpa2b1-KO的AW264.7细胞中,被HSV-1感染后,干扰素Ifnb1的表达明显降低,且同时HSV-1的复制能力增强。 除了体外实验,研究人员还构建了Hnrnpa2b1骨髓细胞特异性敲除小鼠(Hnrnpa2b1fl/fl;Lyz2-Cre+/–),发现在被HSV-1感染后,其原发性腹膜巨噬细胞(PMs)中IFN-β的转录水平及分泌能力都显著下降,同时伴随着脑内更
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看不见的模式生物-秀丽隐杆线虫
作者:德尔塔 日期:2022-04-18
曾经的你,是不是有这样的经历: 在小鼠中怎么没找到我研究的人的同源基因呢? 还有没有其他的模式动物既能阐明我的科学问题,又能得到同行的认可呢? 费了九牛二虎之力终于找到了它们,线虫或者斑马鱼!哎呀!对于它们不了解啊,肿么办??? 别害怕,别害怕,南模生物来了!为了节省大家的时间去做更有意义的事情,小编今天就先来给大家介绍一下作为模式生物的秀丽隐杆线虫。 秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)是第一个被完整测序的多细胞真核生物。成虫体长1-2毫米左右,身体半透明,在20℃的实验室条件下,线虫的世代周期为3天,平均寿命约3周左右。 在其近2万个蛋白编码基因中,有60-80% 与人类基因同源,细胞凋亡、RNAi 和 microRNA 等生命现象和机制都是首先在线虫中被阐明的。 秀丽隐杆线虫是目前唯一所有体细胞发育谱系均被研究清楚的多细胞模式生物,加之其生活周期短、结构简单,因此已成为基因功能研究的新宠,尤其在细胞命运决定、器官发生、衰老与寿命等研究领域得到了广泛的应用。 小小线虫与诺贝尔奖 1 这三位科学家在观察线虫的细胞生长分化过程中,发现了多个能够调控器官发育与细胞程序性死亡的基因,并且在人类等高等生物体内也找到了相对应的同源基因。 2 这两位科学家通过显微注射线虫发现,双链RNA能够高效特异地阻断相应基因的表达,进而阐明了RNA干扰(RNA interference, RNAi)的机制。 3 这三位科学家在绿色荧光蛋白(GFP)的发现和应用方面所做出了杰出贡献,并且首次利用线虫证明了GFP在多细胞生物中的应用前景,向人们展示了绿色荧光蛋白作为发光的遗传标签的作用。 南模生物线虫平台 既然这么厉害,我们南模生物肯定要利用它们为大家服务了! 南模生物于2011年建立线虫平台,经过几年的发展,目前已拥有一流的科研团队和技术平台。目前可以为大家提供的服务有: 如果您有这些方面的需求,扫描下方二维码可以随时联系我们哦!
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光谱分析仪的谱图分析
作者:德尔塔 日期:2022-04-18
x射线荧光光谱仪主要由X光管、探测器、CPU以及存储器组成,由于其便携具有高效、便携、准确等特点,使其应用非常广泛,在合金、矿石、环境、消费品等领域被大量使用。 便携式x射线对金属不锈钢材料的谱图分析非常清晰, 检测数据: 便携式x射线荧光光谱仪检测元素:可同时分析40个元素,合金专用版分析软件,采用智能一键测试,拥有500多种牌号的智能合金库EXPLORER 5000 可准确检测各种贵金属合金、高低合金钢、不锈钢、工具钢、铬/钼钢、镍合金、钴合金、镍/钴耐热合金、钛合金、铜合金、青铜、锌合金、钨合金等,无损检测,1秒钟即可知晓材料的成分及合金牌号。还可对铝、镁轻合金牌号进行快速鉴定,并可对材料进行可靠性鉴别(PMI)和确认,精确掌控材料品质。
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斑马鱼基因敲除是怎么做的
作者:德尔塔 日期:2022-04-18
一、基因敲除的设计方案 1.1 基因的基本信息 确认斑马鱼基因的基本信息,包括名称ID号等,一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域 通过综合考虑,设计最佳的KO靶点。 1.4 分析并设计CRISPR,分析其效率及脱靶的情况 一般使用CCTOP,少数物种如没有可找其它专业网站。 二、CRISPR活性验证 2.1 分析并确认基因组序列 设计Genotyping引物,确认实际基因组序列与理论匹配情况,如CRISPR靶点验证与理论序列存在出入,需回到1.4重做。 该步骤还需要确认引物扩增条件,以备后用,如不能正常扩增需要重新设计,并且不能进行下一步操作。 2.2 合成sgRNA 使用Thermo转录试剂盒转录,完成后需测定浓度(不得低于400 ng/μl) 和OD值(260/280需在1.8~2.2)。 2.3 显微注射 将上述合成好的sgRNA按照一定的比例与Cas9蛋白预混,使用显微注射技术将其注入斑马鱼早起胚胎中。 2.4 活性验证 随机选取8~24 hpf的8枚注射后的胚胎通过PCR后将其产物送商业公司sanger测序,需要看到至少有一组在靶向位置存在Indel突变。 如有,挑取存在Indel突变的亚克隆确认; 如没有,回到2.3或2.2或1.4(具体回到哪一步需要根据实际情况决定) 三、突变体制备及确认 3.1 F0饲养 如2.4验证有活性,一般需要显微注射400~500枚胚胎作为F0(一般由胚胎发育至成体有10~20%),至少需要40尾以上的F0。 3.2 F0可遗传突变的确认 将上述F0亲本与野生型杂交(或者自交),将所产胚胎随机选取8枚经测序确认,如存在Indel突变,则该F0亲本即为可遗传突变体。以此方法至少鉴定出3尾可遗传的F0。 3.3 F1饲养 将3.2至少3尾亲本经交配,每组一般15~25尾,一般总量需到达40~50尾。 3.4 F1确认 将3.3的F1饲养至2~2.5月龄,获得其尾鳍基因组,通过PCR后测序确认其具体基因型(要求必须是移码突变或出现提前终止密码子的突变)。 四、最终交付产品 至少获得3尾以上移码突变F1代斑
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微流控阻抗流式细胞仪:一种新的花粉活力测量技术
作者:德尔塔 日期:2022-04-18
有效、可靠的评估植物细胞活性,尤其是花粉活性,对于育种研究和农业生产来说是非常重要的环节。目前花粉活力研究的传统方法,如染色法和体外萌发法,均存在可靠性差、分析速度慢、有物种依赖性等诸多不足。在过去的几十年中,基于细胞介电特性分析单细胞状态的微流控阻抗流式细胞仪(IFC)已逐渐成为微生物学和医学上的常规检测方法,而本文研究旨在证明IFC法在花粉活力分析中的潜能。 本文的研究中,Heidmann I等同步利用微流控阻抗流式细胞法、传统染色法、灭活对照法、花粉萌发测定法测量了不同发育阶段、不同热处理下的花粉活力、发育状态及萌发能力,并将IFC法测量结果与染色法和萌发法测量结果进行相关性分析。结果表明,IFC法可以快速检测并量化花粉发育阶段、失活或活性状态,且与传统FDA染色法测量结果有很高的相关性。此外,IFC法还可以将具有活跃萌发潜力的花粉从失活和有活力但未萌发的类群中区分出来。 图1. 烟草花粉发育阶段分析 采集不同生长阶段的烟草花蕾(花芽)分别用染色法(DAPI)、淀粉积累法(卢戈尔液)以及IFC法(0.5和12MHz)测定花粉的发育阶段。上图所示花粉发育阶段(I-VIII)分别为,I:四分体时期;II:单核时期;III:晚期单核时期;VI-VII:双核时期;VIII:成熟花粉粒。 图2. IFC法区分活性及失活花粉 分别用IFC法和FDA染色法测量了黄瓜(绿色),甜椒(蓝色)和番茄(红色)的花粉活性,并进行了热处理对比分析以及加热灭活对照。A:新鲜的番茄花粉(左)和热灭活后的番茄花粉(右);B:花粉活力随温度的变化(IFC法,*p ≤ 0.05);C:IFC法与FDA染色法相关性分析 图3. 检测热处理花粉的状态(萌发法及IFC法) A:萌发法检测新鲜花粉和热处理后的花粉萌发状态,黄瓜(绿色),甜椒(蓝色)和番茄(红色),*p =
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纳入2020版药典预稿的黄原胶粘度测试
作者:德尔塔 日期:2022-04-18
黄原胶作为一种性能优良的生物高分子材料,在药物制剂方面具有较强的应用潜力。黄原胶 有良好的黏合作用,可与淀粉、壳聚糖、槐豆胶等多种辅料配伍制备不同黏度、硬度、溶出 速率的缓释片,对水溶性与非水溶性药物都适宜,解热药、镇痛药、抗炎药、维生素类等药 物都可与黄原胶混合制备缓释片。 黄原胶浓度多少是适合的呢?可以与黏蛋白作用,进而起到生物黏附作用,如果较高的黏度 会使患者感觉不适。通过超声预处理黄原胶溶液,破坏黄原胶分子结构,既可以促进其与黏 蛋白反应,又能降低其黏度,提高患者的顺应性。所以药物研究中,对于黄原胶的粘度测试 是很有必要的,对于影响到药物药效药性起到关键因素之一。 根据 2020 版药典预稿中,黄原胶的粘度测试方法如下 取水 250ml,置烧杯中,调节低螺距型搅拌器或磁力搅拌器的转速为每分钟 800 转,边搅拌 变缓缓加入本品 3.0g(按干燥品计)和氯hua钾 3.0g 的混合物,继续搅拌 10 分钟,边搅拌边用 水 44ml 冲洗烧杯杯壁,停止搅拌,快速振摇烧杯,使烧杯上的颗粒完全浸入溶液中,调节 温度至 25±1℃ 继续以每分钟 800 转搅拌 2 小时(搅拌过程中可适当旋摇烧杯,以避免样品分层,每次旋摇 时间控制在 30 秒内,如供试品难以混合均匀,可适当延长搅拌时间)作为供试品溶液。 取供试品溶液适量,置桶内直径为 25mm,外筒直径为 27mm 的同轴圆筒旋转粘度计中,内 筒浸入样品的深度为 42mm,以内分钟 18 转的转速或 1.885rad.的角速度(或选择适宜的测 试条件,使剪切速率为 24),依法测定(通则 0633 第三法 1),在 25℃时的动力粘度应不 小于 0.6Pa.s。 推荐测试粘度计 BROOKFIELD 同轴圆筒形粘度计,满足测试要求型号为 RVDV2T,SSA,SC4-18 转子、TC-550MX, 可选配带审计追踪功能软件。 该粘度计优势在于 1)带嵌入式温度探针的标准样品杯,可以直接测量样品的温度 2)用于控温的恒温循环水浴 3)小量样品适配器具在指定的剪切率下进行准确粘度测量 东南科仪du家代理
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作物水分胁迫测量研究全面解决方案
作者:德尔塔 日期:2022-04-18
在全球变暖与水资源枯竭的背景下,作物水分有效利用与水分胁迫成为作物表型分析、遗传育种、灌溉管理等重要的研究课题。易科泰生态技术公司提供作物水分胁迫研究全面技术方案,包括光合作用测量与叶绿素荧光技术、Thermo-RGB技术及CWSI成像技术等。 光合作用测量与叶绿素荧光技术: 有关仪器技术包括英国ADC公司生产的LC系列便携式光合仪及iFL光合荧光测量系统(可测量gs、gm等)、光合作用与叶绿素荧光监测系统、FluorCam叶绿素荧光成像技术及FluorPen手持式叶绿素荧光测量仪等。 Thermo-RGB成像技术: 冠层温度是测量监测土壤水分状态、做完健康状态及水分和盐分胁迫的重要指标。一般的冠层温度测量监测会受到土壤等“非冠层”部分的影响和冠层阴影部分的影响,只有太阳光照射到的冠层部分才能反映真实的水分胁迫状况。Thermo-RGB成像技术将红外热成像与可见光成像融合分析,以区分土壤、阳光照射叶片和阴影叶片的覆盖度和温度情况(最高温度、最低温度、平均温度),并可进行ROI选区分析、颜色分析、温度频率直方图及温度线性分析等 CWSI成像技术 由捷克Workswell公司与中欧领先的生命科学研究机构作物研究所和捷克布拉格生命科学大学历经数年合作开发的世界首款作物水分胁迫成像仪,由LWIR长波红外传感器(640×512)和10倍光学变焦RGB镜头(1920×1080)组成,可直接测量得到作物水分胁迫指数图及高清RGB图,通过这些信息可用于确定产量分布、优化灌溉或控制水管理等补救措施,为精准农业研究提供非常重要的技术支撑,革新了农业和生命科学领域的研究手段 易科泰公司凭借多年在农业、林业、生态环境领域仪器技术研发集成及推广经验,结合CWSI成像仪的优势特点,率先将该相机引入EcoDrone专业无人机遥感平台和陆基水分胁迫测量监测平台,通过选配多光谱、高光谱及叶绿素荧光成像技术,并配合土壤水分、空气温湿度、茎流等监测网络,组成完整的陆空双基作物数字化系统,为野外大田作物水分胁迫监测
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氧电极Nature发文光合碳同化关键酶Rubisco相变机制重要突破
作者:德尔塔 日期:2022-04-18
欢迎关注「汉莎科技集团」微信公众号! **23 January 2019;DOI:https://doi.org/10.1038/s41586-019-0880-5** 核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶(Rubisco)是光合作用碳同化关键酶,在藻类、植物以及部分光合细菌中保守存在。Rubisco是植物叶片中含量最丰富的蛋白质,也是地球上含量最多的蛋白质。Rubisco固碳效率非常低,是光合作用的限速酶,而藻类和少数植物可以利用二氧化碳浓缩机制(CO2-concentrating mechanism, CCM)以提高碳同化效率。 蓝细菌的α-和β-羧酶体含有由八个大亚基(RbcL)和八个小亚基(RbcS)组成的Rubisco以及碳酸酐酶复合物。由于HCO3-可以通过扩散进入羧酶体外壳而CO2不能,碳酸酐酶复合物因此可以产生高浓度的CO2用于Rubisco的碳固定。羧酶体外壳还可以防止还原剂进入,产生并保持内部的氧化环境。β-羧酶体的形成涉及由CcmM蛋白介导的Rubisco聚集。 CcmM蛋白以两种形式存在:其一为M58,发现于细胞聚球蓝细菌中全长的CcmM,N端包含有碳酸酐酶样(carbonicanhydrase-like,CA)结构域,随后是三个通过柔性linker连接Rubisco小亚基样(Rubisco small subunit-like,SSUL)模块;另一种为M35缺乏碳酸酐酶样(CA)结构域(图2g)。一直以来,人们认为SSUL模块通过替换RbcS与Rubisco相互作用。但是,真实的情况和具体的分子机制并不清楚。 近期,德国马普生化所Manajit Hayer-Hartl课题组在Nature杂志在线发表了题为Rubiscocondensate formation by CcmM in β-carboxysome biogenesis的研究论文,报导了Rubisco-CcmM复合物结构,并且通过生理实验验证了Rubisco在β-羧酶体生物发生过程中由CcmM介导的相变过程的分子机制。 此前有文章报道细胞通过一些使酶区域化的机制,作为调节代谢途径和提高其效率的策略。近期研究的热点相变是这个区域化作用的一种突出体现。 在这篇文章中,Hayer-Hartl课题组的研究人员不仅重组了Rubisco-CcmM复合物,解析了它的结构,还观测到了Rubisco相变过
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Leica:您的样本诊断流程小贴士来啦!
作者:德尔塔 日期:2022-04-18
第1-11步 徕卡101 样本的接收和转移 从患者到病理学家,准备样本进行诊断需要细心、经验以及合理的流程。 徕卡特地为大家整理了取材、组织处理、包埋、切片以及染色等(常规、特殊、IHC以及FISH)101步操作流程,帮助大家更有效、更简单地获得实验方案,避免错误的发生。 步骤一 避免机械性损伤 🙆 正确:小心移动组织,避免机械损伤。外科以及解剖过程中,在任何需要新鲜组织的情况下,都必需非常小心地采集组织样本; 🙅 错误:组织在固定前由于挤压和撕裂引起的机械损伤。 淋巴组织:典型的人为挤压引起的损伤。在图中表现为暗而变形的细胞核,以致其中一些细胞拉长而呈强的嗜碱性。 步骤二 避免样本干燥 🙆 正确:避免样本在固定前干燥。如果不能马上进行固定的话,使用含生理盐水的湿纱布覆盖避免干燥; 🙅 错误:组织在固定前在吸水的材料表面放置一段时间。 这块新鲜的组织刚从患者的体内取出。由于它被放在托盘中而且环境温度较高,如果不马上进行固定的话就会迅速变干引起组织损伤。 步骤三 避免热损伤 🙆 正确:尽可能避免样本局部过热引起的损伤(一些灼烧损伤可能是没法避免的); 🙅 错误:一些不必要的局部过热引起组织损伤,新鲜组织特别容易因此受损。 乳腺组织边缘部分区域的细胞呈强嗜酸性并已丢失细胞核和细胞质详情。其原因在于采集样本过程中, 灼烧引起局部过热而导致损伤,相邻的腺体组织没有受到影响。 步骤四 避免化学损伤 🙆 正确:外界化学物质(如:消毒剂)对新鲜组织的污染; 🙅 错误:还没有经过固定的组织很容易被外界化学物质浸润和破坏。 Monsel溶液(碱式硫酸铁溶液)是一个典型的止血剂,用于控制活检组织粘膜的血液流动,它能够引起粘膜表面的血液凝固与细胞坏死。如果应用在活检,则容易引起局部嗜碱性以及早期坏死的现象,从而导致病理改变。Monsel溶液损伤,常见于重新进行活检取材或者手术切除后。图A:H&E染色后的宫颈活检图以及图B:
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关于肝损伤修复及其分子调控机制
作者:德尔塔 日期:2022-04-18
肝脏被称为人体的“生命塔”,承担着代谢,解毒,免疫,消化等重要的人体机能。肝脏拥有强大的代偿功能,一般轻伤不下火线。但当今社会快速的工作节奏和不规律的生活习惯,使得肝损伤在现代人群中成为一种常态,因此,关于肝损伤修复及其分子调控机制一直是学术研究热点。 最近几年利用谱系示踪技术发现,肝脏损伤后主要是通过肝细胞重编程的方式实现肝细胞的再生(并非来源于干细胞分化),即肝细胞在受到门静脉肝脏损伤时,肝细胞去分化成肝祖细胞样细胞(LPLCs),促进肝脏的再生。 但是关于肝细胞发生重编程的分子基础,尤其是表观遗传调控机制,目前仍然不清楚。 7月3日,国际学术期刊Cell Stem Cell 在线发表了题为A Homeostatic Arid1a-Dependent Permissive Chromatin State Licenses Hepatocyte Responsiveness to Liver-Injury-Associated YAP Signaling 的研究论文。该研究成果由中国科学院分子细胞科学卓越创新中心/生物化学与细胞生物学研究所惠利健组与中国科学院上海营养与健康研究所李亦学组合作完成。 研究发现:染色体重塑调控蛋白Arid1a维持一系列与干性和再生相关基因染色质呈开放的状态,当肝细胞受到损伤时,可帮助肝脏损伤活化的转录因子Yap入核,结合到染色质呈开放状态的靶基因上,激活肝细胞重编程相关基因的表达,进而促进肝细胞去分化的发生。 本研究中发现的表观遗传修饰和转录因子活性协同调控细胞命运的机制,对于研究其它组织再生修复具有重要意义。 南模生物为该研究构建了Arid1a3xflag 和Yap3xflag小鼠模型。 该研究中,科研人员发现SWI/SNF复合物的关键组分Arid1a可特异的调控肝细胞重编程。若在肝细胞中特异性敲除Arid1a基因,会抑制肝脏门静脉损伤所诱导的肝细胞去分化,导致肝脏的损伤修复出现缺陷。 Fig.1 门静脉周围损伤时,肝细胞向肝祖细胞样细胞转化所需的Arid1a 那Arid1a蛋白是如何在损伤再生的肝细胞中发挥作用呢? 鉴于Arid1a是染色质重塑复合体的重要组分
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斑马鱼平台助力HSP发病机理研究
作者:德尔塔 日期:2022-04-18
遗传性痉挛性截瘫(HSP)又称家族性痉挛性截瘫,是一种神经系统退行性变性疾病。其病理改变主要是脊髓中双侧皮质脊髓束的轴索变性或脱髓鞘,以胸段最重。 临床表现为双下肢肌张力增高,腱反射活跃亢进,病理反射阳性,呈剪刀步态。2018年5月11日,中国国家卫生健康委员会等5部门联合制定了《第一批罕见病目录》,遗传性痉挛性截瘫(HSP)被收录其中。 2019年6月15日,南模生物斑马鱼平台与福建医科大学附属第一医院神经内科陈万金与王柠教授团队合作在全球临床神经学顶级杂志《Brain》在线发表了题为“Stop-gain mutations in UBAP1 cause pure autosomal-dominant spastic paraplegia”的研究长文。 该研究不仅丰富了HSP致病基因谱,为基因诊断奠定了基础;而且所发现的致病基因UBAP1编码蛋白参与内体转运装置复合物I(ESCRT-I)的组成,其介导的核内体相关转运障碍可导致多种神经退行性疾病(如阿尔茨海默病、帕金森病等),因此也为该类疾病的发病机制提供了新的线索。 Fig.1 4个常染体显性的HSP家系中,发现了UBAP1基因的无义突变。 通过靶向测序作者首先在112个HSP家庭中,发现了74个家庭中含有能够引起HSP的常见79个基因突变。为了更系统的寻找一些未知突变基因,作者通过家系四个病人(图1A)的全外显子测序并通过一定的标准筛选到5个能引起HSP的杂合突变基因:UBAP1 (c.247_248insGTGAATTC), ARMC12 (c.274C4T), CRISP2 (c.320G4C), ZNF735 (c.1010C4T), and DNAH1 (c.2391+5g4a)。 通过对(图1B-D)HSP病人的全外显子测序,发现只有UBAP1基因的突变同时出现在四个家系中, 并且都导致了UBAP1蛋白翻译的提前终止。接着作者做了4个家系UBAP1基因位点的全测序,并进行了共分离分析。 以上这些数据有力的证明了UBAP1基因4个位点的无义突变可能引起了常染色体显性遗传痉挛截瘫(HSP)。 由于UBAP1基因在人,斑马鱼和小鼠中是保守的,因此作者希望通过斑马鱼和小鼠模式生物进一步研究UBAP1基因在HSP发
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识别田间条件下小麦的穗区域的表型分析方法
作者:德尔塔 日期:2022-04-18
2019年6月,Plant Phenomics刊发了由来自英国诺里奇研究所(Norwich Research Park)的Tahani Alkhudaydi等人撰写的题为An exploration of deep-learning based phenotypic analysis to detect spike regions in field conditions for UK bread wheat的研究论文,介绍了基于深度学习的识别田间条件下英国面包小麦的穗区域的表型分析方法。英国诺里奇研究所/南京农业大学的周济教授和英国诺里奇研究所的Beatriz de la Iglesia为本文通讯作者。 小麦是世界上的主要农作物之一,到2050年,全球小麦需求预计将达到8.5亿吨,明显超过目前的供应量。由于气候条件波动,世界人口不断增长,维持小麦产量的持续压力要求育种家在不同环境中提高产量和产量稳定性。本文作者正努力将深度学习与基于田间的表型分析相结合,以协助育种家进行这项工作。 本研究利用了分布式表型分析工作站-CropQuant收集的小麦图像,这些工作站用于不同的英国面包小麦品种的多年田间试验。基于这些图像系列,本文开发了一种基于深度学习的分析管道,用于复杂背景的穗区分割。 本文提出了一种有前景的方法作为田间关键产量性状稳健性测定的第一步,其采用全卷积网络(FCN)对图像进行语义分割以分割小麦穗区域。本文还通过使用从其他图像数据集获得的参数来证明迁移学习的优势。本文发现FCN架构在验证数据上的平均分类准确度(MA)> 82%,在测试数据上> 76%,在验证数据上平均交联值(MIoU)> 73%,在测试数据集中> 64%。 通过这一表型组学研究,研究者相信其尝试很可能在提取单位面积穗数和每穗小穗数等与产量相关的关键性状方面奠定了良好的基础,可为今后以产量为中心的小麦育种目标提供帮助。 在这项研究中,研究人员探索了一种结合深度学习和计算机视觉的方法,该方法通过基于像素的分割来识别小麦生长图像上的小麦穗区域。该方法是使用Python和TensorFlow后端实现的,后者为研究人员建立FCN架构提供了框架。然后,研究人员将工作从训练阶段
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肥料和土壤调理剂 水分含量、粒度、细度的测定
作者:德尔塔 日期:2022-04-18
肥料和土壤调理剂 水分含量、粒度、细度的测定 NY/T 3036-2016 肥料和土壤调理剂 水分含量、粒度、细度的测定 范围 本标准规定了肥料和土壤调理剂真空烘箱法、烘箱法、卡尔·费休法测定水分(游离水)含量的试验方法,以及试验筛重量法测定固体肥料和土壤调理剂粒度、细度的试验方法。 真空烘箱法适用于测定固体肥料和土壤调理剂水分含量;烘箱法适用于测定农林保水剂水分含量;卡尔·费休法适用于用二氧六环萃取后采用卡尔·费休试剂滴定测定肥料和土壤调理剂水分含量。真空烘箱法和烘箱法不适用于在干燥过程中能产生非水分挥发性物质的肥料和土壤调理剂水分含量的测定。 水分含量的测定 真空烘箱法 测定 称取约2g(精确至0.0001g)试样于预先干燥至恒重的称量瓶中,置于(50±2)°C,通干燥空气调节真空度为6.4✕104Pa~7.1✕104Pa的电热恒温真空干燥箱中干燥2h±10min,取出,在干燥器中冷却至室温,称量。 烘箱法 测定 称取约2g(精确至0.001g)试样于预先干燥至恒重的称量瓶中,置于(150±2)°C恒温干燥箱中干燥2h±10min,取出,在干燥器中冷却至室温,称量。 卡尔·费休法 原理 试样中的游离水与已知水的滴定度的卡尔·费休试剂进行定量反应,从而求出游离水的含量。反应式如下: H2O + I2 + SO2 + 3C5H5N = 2C5H5N·HI + C5H5N·SO3 C5H5N·SO3 + CH3OH = C5H5NH·OSO2OCH3 仪器 通常实验室仪器。 卡尔·费休直接电量滴定仪器,按照 GB/ T 6283 的规定配备。 GB/T 6283-2008 化工产品中水分含量的测定 卡尔·费休法(通用方法) 离心机: 转速0r/min~4000r/min。 分析步骤 卡尔·费休试剂的标定 按照 GB/ T 6283 规定进行,用二水合酒石酸钠(或水)标定。 试样的制备 样品缩分至约100g,将其迅速研磨至全部通过0.50mm孔径试验筛(如样品潮湿,可通过1.00mm孔径试验筛),混合均匀,置于洁净、干燥容器中。 测定 称取1.5g~2.5g(精确至0.002g)游离水含量不大于150mg的试样于125mL带盐水瓶橡胶塞的锥形瓶中,盖上瓶塞,用移液管注入50mL二氧六