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分子垂钓技术要点与应用实例
作者:德尔塔 日期:2022-04-14
就是这么简单!Octet和分子垂钓! 分子垂钓是生命科学研究中的常用手段,简单来说就是从一个分子库里(比如某个细胞裂解液的粗样品)钓取可以与已知生物分子相结合的配体分子。一般先将这个已知分子偶联在固相上面,然后和细胞裂解液里的物质结合,最终将洗脱下样品交由质谱进行鉴定。 一个成功的垂钓实验会涉及到几个重要因素 1 将已知分子牢固地偶联到固相上,并保持其生物活性; 2 尽量减少混合样品和固相之间的非特异性结合; 3 确保洗脱的物质有足够的量来做质谱(浓度尽可能高,避免浓缩处理导致的损耗); 4 对垂钓鉴定结果进行验证。应用经纯化的样品,再次通过分子互作技术进行表征鉴定。 目前最常用的垂钓方法是Pull-Down,但是其缺点是非特异性高,操作麻烦。现在基于生物层干涉技术(BLI)的Octet分子互作仪器以及传感器,针对这几个问题进行了积极的优化和改进,成为做分子垂钓的新方法。 今天陈老湿给大家介绍一篇文章,来自于意大利国家研究委员会下属的生物结构和生物成像研究所的。他们在研究中发现了针对某一肿瘤标志物的抗体,并成功应用BLI技术垂钓和鉴定出这个抗体的表位(抗体结合位点)【1】。 来自意大利科学家的BLI垂钓案例经典技术路线 Preferentially Expressed Antigen in Melanoma (PRAME,黑色素瘤特异性抗原) 是重要的肿瘤标志物和**靶点。科学家通过研究,发现了针对这个抗原的高亲和力抗体。接下来的工作就是希望通过分子垂钓技术,对该抗体的识别表位开展鉴定工作。 下图是做表位垂钓和鉴定的技术路线 1 先用BLI鉴定抗体与抗原结合。用胺基偶联传感器固化抗体,通过与抗原进行结合解离得到的数据,确认该抗体与抗原的结合亲和力较高; 2 将抗原用胰蛋白酶消化成多肽,并用质谱开展鉴定。通过同蛋白序列的分析对比,发现这些多肽序列的覆盖率很高,从而确认抗原预处理是成功的; 3 应用Octet AR2G(胺基偶联传感器)固化抗体,抓取
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对医疗器械进行手动目视检查的挑战与解决方案(下)
作者:德尔塔 日期:2022-04-14
如何借助数字化增强解决方案克服这一挑战(下) 使用数字化增强检查解决方案,克服这些挑战 尽管医疗器械的手动目视检查存在许多严峻的挑战,但我们可以采取另一种解决方案帮助客户解决这些困难,即借助Exalta设备建立的数字化增强检查解决方案。该解决方案可为质量经理和操作员带来以下优势。 通过进行数字化增强检查,可以减少由于长时间使用目镜进行手动检查而产生的疲劳和压力。这是由于数字化增强检查使用了配备有数码相机的显微镜以及监视显示器,还可使用具有分析功能的软件。 Exalta智能设备,配备S APO Greenough立体显微镜和FLEXACAM C1显微镜摄像头,用于追溯显微镜检查。 经理可以逐步确定数字化作业指导并迅速加以执行,从而使所有显微镜工作站都能按照作业指导进行检查,进而有助于确保检查工作按照既定标准规程进行。即使是在多名操作员检查同一部件或不同部件时,这也有可能实现,从而提高了缺陷检查的一致性。此外,该设备还为缺陷分析过程提供指导,包括缺陷识别、测量和计数,从而可对缺陷进行更准确的评估。基于以上优势,可以为客户大幅节约在新操作员培训方面投入的时间和精力。 同时,该设备使用易于显示的缺陷参考图像并进行叠加,以便快速进行比较。通过将检查结果与既定规格进行自动比较,有助于操作员快速做出通过/未通过决定,提高缺陷检查和评估的一致性。该数字化增强解决方案可实现检查数据的自动储存,例如从缺陷评估到数据自动传输至数据库。该功能有助于减少诸如记录检查结果和传输数据等手动任务,可提高检查结果的直接可追溯性以及报告的生成和批准。 数字化增强检查解决方案工作流程 总结及结论 对医疗器械进行手动目视检查效率低下,并且检查结果可能不一致。由于既定标准操作规程可能不会得到严格遵循,不同操作员得出的结果就会有所不同。此外,还存在许多耗时的手动步骤,例如记录检查结果和将数据传输至数据库。我们可借助Leica Microsystems制造的用于可追溯显
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实验室纯水系统维护很重要,定期“体检”是关键
作者:德尔塔 日期:2022-04-14
实验室的工作人员面临的危险无处不在,一个不小心就可能会引发严重的实验室安全事故,往往带来的损失都不小。实验室安全工作必须遵循“安全第一、预防为主”的原则,防微杜渐。尤其是无情的水火,一般在仪器设备的使用过程中应多加注意,便可防患于未然。 这里,我们来谈谈实验室用水的安全小常识。 实验室用水安全,除了常规的用水输送管路外,另一个需要关注的对象就是实验室纯水机。用户对纯水机安装,性能安全系数给予的关注较多,但往往会忽略一点 —— 纯水机管路的老化问题!服务年限超过5年的纯水机,由于管路及一些塑料件的老化,更容易带来漏水风险。这些看似非核心的“小细节”,在纯水机系统里,占比还不少。一旦出现问题,会带来很严重的损失! 例如: · 房屋损毁:房间墙面、屋顶大面积渗水、发霉,甚至变形脱落。 · 仪器设备故障:仪器设备进水损毁,也可能导致电源短路。 · 影响实验:正在进行的实验可能得不到实验结果,而且短期内可能无法正常开展实验。 现实工作中的很多麻烦,其实就是这种容易被忽略的小细节引起的。所以,实验室纯水机的供应商会建议用户定期给自己使用的纯水机做体检,尤其是查看纯水机内、外的管路和接头等配件。随着时间的推移,这些塑料材质的管接件逐渐老化,失去原有的韧性,出现裂纹裂缝在所难免,是漏水问题的元凶。 如何避免实验室纯水机漏水现象的发生? 1. 水机定期维护。特别要关注使用超过5年以上的纯水机,其管路、接头应及时更换。 管路、接头老化导致漏水的原因: ① 纯水机进水管与水龙头连接,其内部一直承受水压,时间久了管路容易老化后出现裂痕; ② 放置在实验室的纯水机,环境中挥发的酸碱、氧化试剂也会加速进水管的老化; ③ 阳光照射也是加速水管老化的一个因素。 定期检查纯水机并及时更换老化的管接件,可以有效避免实验室水灾的发生。 乐枫为自己的水机提供专门的维护套件,需要的话可以随时联系客服人员(纯水热线:400-
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阳离子纳米脂质体介导基因转移的机理推测及实际应用
作者:德尔塔 日期:2022-04-14
截至目前为止关于纳米脂质体-基因复合物被细胞摄取的机理及复合物在细胞内的转运过程尚未完全阐明。自1987年应用阳离子纳米脂质体转移基因取得成功以来已经过去了34年,有关于阳离子纳米脂质体介导基因转移的研究虽然取得了一系列的进展,但还未完全阐明,但其可能的机理是: 其可能的机理是: 首先,阳离子纳米脂质体与带负电的基因通过静电作用形成纳米脂质体-基因复合物,此复合物因阳离子纳米脂质体的过剩而带正电;带正电的纳米脂质体-DNA复合物由于静电作用吸附于带负电的细胞表面,然后通过与细胞膜融合或细胞的内吞作用进入靶细胞。在细胞内,阳离子纳米脂质体-基因复合物发生分离,基因进一步被转运到细胞核内,并在细胞核内转录和翻译,产生目的基因编码的蛋白质。 阳离子脂质体可用于介导许多组织细胞的基因转移,既可转染体外培养细胞,也可转染体内组织细胞。DC-Chol/DOPE脂质体和DMRIE/DOPE脂质体在美国和英国已用于基因**的临床试验。 目前阳离子纳米脂质体-DNA复合物的实际应用课题主要有肿瘤、神经系统疾病、肺部和呼吸道疾病、炎症等方面。 1、肿瘤方面的应用 阳离子纳米脂质体已用于介导肿瘤的基因**,动物实验或临床实验都取得了一定的效果。 2、肺部和呼吸道疾病中的应用 肺有一个很大的上皮表面,在阳离子纳米脂质体体内基因转移过程中,肺是目的基因表达水平较高的靶器官。气管内滴注或气雾剂给药可绕过内皮屏障,使基因与呼吸道上皮细胞直接接触,转移给靶细胞。以肺与呼吸道为目标的基因**逐步引起了人们的重视。 | 中文名称:DLin-MC3-DMA | 商品名:DLin-MC3-DMA | 化学名称:4-(N,N-二甲基氨基)丁酸(二亚油基)甲酯(6Z,9Z,28Z,31Z)-heptatriacont-6,9,28,31-tetraene-19-yl 4-(dimethylamino)butanoate | 分子式:C43H79NO2 | 生产商/manufacturer艾伟拓(上海)医药科技有限公司/ AVT (Shanghai) Pharmaceutical Tech Co,. Ltd. | CAS号:1224606-06-7 | 用途:阳离子脂
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在细胞疗法CAR-T靶点同质化激烈竞争中突围的NK细胞免疫疗法
作者:德尔塔 日期:2022-04-14
6月22日,NMPA公示,复兴凯特CD19靶点自体CAR-T细胞**产品阿基仑赛注射液正式获批,这意味着我国迎来首款获批上市的CAR-T细胞**产品。 Insight数据库显示,目前有20多家企业布局“重押”CAR-T疗法,包括药明巨诺、科济制药、传奇生物、上海优卡迪生物、恒润达生生物、驯鹿医疗等,已进入临床阶段的项目36个,但CAR-T疗法布局的靶点主要聚焦在CD19、BCMA,CAR-T靶点同质化程度较为严重,如何在细胞疗法CAR-T靶点同质化激烈竞争的格局中突围呢? 今天,我们就来聊聊CAR-T细胞疗法的“姊妹“—NK细胞免疫疗法。 NK细胞可非特异性直接杀伤肿瘤细胞,这种天然杀伤活性无MHC限制,不依赖抗体,也不需要抗原致敏,NK细胞还具有很强的免疫调节功能,与机体其他多种免疫细胞相互作用,调节机体的免疫状态和免疫功能。NK细胞疗法作为一种可行的**策略,逐渐成为仅次于T细胞疗法的免疫新星。 NK细胞的抗肿瘤途径 NK细胞与T细胞、B细胞不同,NK细胞不需要特异性的抗原致敏刺激就可识别并杀伤靶细胞。可通过多种途径抑制肿瘤细胞的生长和扩散: 1)在肿瘤微环境趋化因子和黏附因子的引导下,NK细胞募集到肿瘤发生的部位,促使肿瘤组织中NK细胞浸润程度增加,使得NK细胞表面活化受体识别肿瘤细胞表面相应配体,释放穿孔素、颗粒酶等杀伤介质,直接杀伤肿瘤细胞; 2)活化的NK细胞可表达死亡诱导配体-Fas配体(FASLG,又称 TNFSF6),可与肿瘤坏死因子相关诱导凋亡配体(TNF related apoptosis inducing ligand,TRAIL)结合,诱导肿瘤细胞凋亡; 3)通过抗体依赖性细胞介导的细胞毒作用(antibody dependent cell-mediated cytotoxicity,ADCC),NK细胞通过细胞表面的FcγRIII(CD16)和肿瘤抗原特异性抗体Fc段结合,识别并杀伤肿瘤细胞; 4)NK细胞通过产生细胞因子(IFNγ、TNFα、IL1、IL10、GM-CSF等)和趋化因子(CCL3、CCL4)将其他免疫细胞募集到炎症部位,诱导其活化,并增殖产生固有和适应性免疫应答。 图1|NK 细胞
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MDCK细胞的生物反应器微载体培养方法
作者:德尔塔 日期:2022-04-14
MDCK细胞属于动物细胞一般采用Cytodex 作为微载体Cytodex 主要有两个系列 即:Cytodex 和 Cytopore ,其中 Cytodex 1适合大多数的贴壁细胞。 采用Cytodex 微载体的优势主要有以下几点: 1. Cytodex 微载体的表面比较适宜细胞的粘附和延展。 2. 优化后的大小和密度对于细胞悬浮较为有利,适宜细胞的生长和高产。 3. 这类细胞的细胞基质具有一定的生物惰性,可以减少搅拌培养过程中的剪切力损害。 4. Cytodex 微载体具有较好的可放大性。试验证明,良好的培养环境下采用搏旅悬浮细胞培养生物反应器可达 15,000 L产量规模,而采用贴壁细胞微载体培养生物反应器可达 6,000 L 左右的规模。 MDCK细胞的生物反应器微载体培养方法主要有以下几个步骤: 一、微载体的前处理: 用pH为7.4的PBS缓冲液将Cytodex系列微载体浸泡3~24H;反复清洗后用高压进行灭菌,冷却。并用含牛血清的培养基清洗后并加入同体积的培养基备用。2) 二、MDCK种子细胞的解冻复苏: 取出冻存中MDCK细胞,置于37℃-39℃的恒温水浴振荡器中进行解冻复苏,再植入细胞培养瓶中进行细胞培养。 三、细胞的转瓶扩培 当细胞培养瓶中的细胞生长到90%密度时用细胞消化液处理细胞,并接入摇瓶进行分瓶培养,当细胞生长到同样密度时,用培养基稀释接入生物反应器进行扩培。 四、生物反应器微载体培养: MDCK细胞接种可以依照 比例为2-25g微载体/L(培养基)、5-50个细胞/载体的比例接入生物反应器中进行扩大培养。具体详尽参数可以根据相关的《胞培养操作说明》进行设定调整。 五、病毒的感染接种: 当生物反应器内培养的MDCK细胞90%在微载体表面形成致密层后,应当停止搅拌,当微载体沉淀于生物反应器的地步是,更新培养基,按照TPCK胰酶1-20μg/ml、病毒感染复数0.01-1接种病毒培养2h后,补充培养基与原来的量相一致; 六、病毒收获 当病毒接种10H后,需要每小时取样观察细胞的病变效应及CPE值,当CPE值大达80%以上时,即可进行病毒收获、分析测定等操作环节,结合分
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化学发光免疫分析诊断技术(CLIA)的浅析及前景
作者:德尔塔 日期:2022-04-14
化学发光免疫诊断技术的实质是利用免疫反应中的化学试剂和酶激发出可见光并由配套设备采集处理其反应过程中所释放的可见光,来进行免疫诊断测定的技术。 化学发光免疫分析技术由于其灵敏度较高,特异性较强,准确率高等特点在临床应用中广泛推广,作为酶联免疫的有效替代技术逐渐成为免疫分析领域的主流技术。市场占有率达61%以上。 化学发光免疫诊断技术(CLIA)主要分为两大类: 根据抗原与抗体包埋方法的不同可以分为微孔板式和微粒式两种。 1. 微孔板式技术是ELISA 酶联免疫与和化学发光免疫诊断技术间的一个过渡产品,这种技术由于检测灵敏度低,特异性较低、实验成本低廉,配套试剂成本低的特点在我国发光技术初期备广泛使用,直到现在许多生命科学实验室仍采用是微孔板式技术进行实验。 2.微粒式化学发光根据技术等级可以分为磁微粒式发光和非磁微粒式发光。 磁微粒化学发光是利用快速自动化的磁性分离技术的、高灵敏度的化学发光技术和特异性免疫分析技术相结合的电化学发光免疫诊断技术。微粒式化学发光是当今免疫诊断的主流技术。根据标记物的不同可以将化学发光分为直接化学发光、化学发光酶发光技术和电化学发光三种。 直接化学发光 直接化学发光是利用化学发光剂来标记抗体或抗原,加入特定的发光试剂的进行发光检测的一种免疫测定方法,这种发光体系相对简便、快捷,实验成本也较低。 间接化学发光 以辣根过氧化物酶或碱性磷酸酶标记来标定抗体/抗原加入氧化还原剂、化学发光增强剂等是化学试剂来进行免疫诊断的技术。 化学发光免疫诊断技术(CLIA)目前已基本取代酶联免疫诊断成为当代主流免疫诊断技术,检测范围包括肿瘤、传染病、甲状腺功能、肾功能、产育、产前筛查、内分泌激素等各个方面。微粒式化学发光(管式发光技术)则主要用于传染病、肿瘤、甲状腺功能检测、体内激素检测等,这些检测项目占测试总量的75-80%以上,占市场总额的60%左右。从临床检测量来看,肿瘤诊断和甲状腺
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几种基因敲除细胞株构建方法的介绍与比较
作者:德尔塔 日期:2022-04-14
众所周知,CRISPR-Cas9作为一项基因编辑技术,目前已经是生命科学领域家喻户晓的技术了。但虽说这项技术非常火爆,仍有许多同学对基因编辑技术存在理解偏差,比如最常见的,在应用CRISPR-Cas9构建基因敲除(KO)细胞系,到底采用质粒法、病毒法还是有其他更好的方法呢? 说到这个问题,就不得不提当初CRISPR-Cas9技术刚兴起时,所展现的切割效率和敲除成功率极大的吸引了科研界的关注,但是科研人员进行相关实验时经常会遇到:“一学就会,一做就废”的问题。他们发现,完全按照文献的方法进行基因敲除,成功率并没有想象的高,且还存在对细胞转染效率低的问题。因此有一些课题组就尝试通过慢病毒转染的方式进行敲除,提高转染效率的同时,将Cas9蛋白基因整合到基因组中,通过提高增加Cas9蛋白和sgRNA的作用时间来提高细胞敲除效率。 ★ 慢病毒法 ★ 但是,慢病毒感染存在着两个比较关键的问题: 1. 利用慢病毒法转染Cas9会在敲除靶基因的同时引入新的基因,而且慢病毒转染的外源基因是随机整合,存在影响其他基因表达的风险。 2. CRISPR-Cas9编辑过程存在脱靶效应,慢病毒法会持续表达Cas9蛋白,长期存在的Cas9蛋白会对这种脱靶效应有累积效应,最终影响实验的严谨性。 图1. 慢病毒感染进行基因敲除 ★ 质粒法 ★ 为了降低这种脱靶效应,采用的策略是减少Cas9蛋白与sgRNA复合物在细胞中的存留时间,因此我们还可以采用质粒法进行KO细胞的构建。即通过将Cas9和sgRNA表达载体瞬时转染到目的细胞中,从而在细胞内表达Cas9蛋白和gRNA,由于质粒整合到基因组的概率极低,随着细胞传代质粒载体的逐渐消失,再经过PCR验证和测序筛选出纯合的敲除细胞。但质粒法也存在一个较大的问题,即感染效率较低。 ★ RNP法 ★ 与质粒法不同的是,RNP法是通过电刺激转染的方法直接将Cas9蛋白和sgRNA复合物转染到细胞中。由于Cas9蛋白是不带电荷的,而sgRNA是带电荷的,因此只有当Cas9与sgRNA结合后,才能更高效的将两者转染到
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Hoxb8基因及拔毛癖简介与模式小鼠的应用
作者:德尔塔 日期:2022-04-14
“秃”如其来是不少人的烦恼。然而,令大部分人没想到的是,我们惜“发”如命,有人却薅头发上瘾。这其实是一种由遗传及心理因素共同作用下引起的疾病——拔毛癖。小鼠敲除Hoxb8基因变得过分的爱梳理自己,并形成毛发秃斑以及皮肤创伤。这种行为类似于患有拔毛癖的人类的行为。今天我们就一起来了解拔毛癖和研究其的Hoxb8基因编辑小鼠。 拔毛癖 拔毛癖最早由法国医生Hallopeau于1889年报道,是一种人为导致的外伤性脱发。我国的发病率不详,美国的发病率约1%。据估计,女性一生中发生拔毛癖的机率为0.6%~3.4%,而男性为0.6%~1.5%。 拔毛癖 (TTM) 的特征是从不同部位反复拔毛,导致明显的脱发。TTM 在 DSM-IV 中被归类为冲动控制障碍,但现在被归类到 DSM-5 的强迫症相关障碍部分。[2] 其中个体无法抵抗拔掉自己头发的冲动,已证实, 拔毛癖患者更容易罹患强迫症(OCD), 且可能同时患有进食障碍和躯体变形障碍。尽管尚未进行全面、大规模的流行病学研究,但据较小规模的研究估计,TTM 会影响 1-3.5% 的晚期青少年和年轻成人;不幸的是,年幼儿童的发病率仍然未知。在整个发育范围内,患者可能会出现医疗并发症,例如牵拉部位的皮肤刺激、感染和重复使用手部受伤。[3] Hoxb8基因编辑小鼠表型 家系研究提示拔毛癖具有家族遗传性,拔毛癖患者一级亲属的终生患病率可达5%。基因敲除的动物模型提示,HoxB8、SAPAP3及SliTrk5基因与模拟拔毛行为相关,但拔毛癖的致病基因或易感基因尚需深入研究。 Hoxb8基因是Antp homeobox家庭的成员,编码具有homeobox DNA 结合域的核蛋白。编码的蛋白质作为参与发育的序列特异性转录因子起作用。该基因的表达增加与结直肠癌有关。 Vol.1 Hoxb8基因敲除小鼠 1. 打靶策略 通过在2号外显子内插入loxP-Neo-loxP导致Hoxb8基因被破坏(Hoxb8-Neo),从而丧失基因功能,也可通过Cre重组酶去除Neo盒,只残留loxP位点在基因座中(Hoxb8-lox)。[1] 图1. Hoxb8基因敲除小鼠打靶策略[1] 2. 表型 敲
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文献解读:脑瘫的复杂分子病因学研究
作者:德尔塔 日期:2022-04-14
脑性瘫痪(脑瘫,CP)是由于控制肌肉运动的脑部区域(运动区)畸形或损伤而引起的一组症状。主要表现为中枢性运动障碍和姿势异常,还伴有智力障碍、癫痫、视力和听力问题、语言障碍等。全球有2000多万名脑瘫患者,给家庭和社会带来沉重负担。 脑瘫的病因有很多种,包括分娩期间缺氧、新生儿感染等。然而,三分之二的脑瘫患者是足月出生的,分娩期间缺氧仅能解释不到10%的脑瘫病例。近八成的病例还无法确定病因。近年来,越来越多的证据表明遗传因素与CP相关。不过,人们对脑瘫的遗传和分子机制知之甚少,这阻碍了脑瘫的预防、诊断和**。 对此,广州市妇女儿童医疗中心的研究团队历时五年,对120个特发性脑瘫家庭开展深入的临床和分子分析,鉴定出潜在的有害的遗传变异。这项研究成果于6月初发表在Brain杂志上。通讯作者为儿科研究所胡昊研究员和韩丁丁副研究员、康复科徐开寿主任,以及南通大学刘东教授。 国际权威神经病学期刊Brain创刊于1878年,是久负盛名的神经病学权威期刊,一个半世纪以来报道过很多神经病学发展的里程碑工作,在国际医学界和学术界有很高的声望。此次研究得到Brain主编和审稿人的高度评价,称赞其为“an impressive piece of work, with major scientific merits and important clinical implications”。 120个脑瘫家庭的遗传分析 研究人员总共招募了120个脑瘫家庭。大多数患者属于痉挛型脑瘫,其次是运动障碍和共济失调型脑瘫。他们通过多个平台对患者进行了全面的遗传评估,包括靶向PCR分析、线粒体基因组测序(6000X)、细胞遗传学芯片分析、全外显子组测序(600X)和全基因组测序(36X)(图1)。 图1. 脑瘫队列研究信息 他们发现,45%的脑瘫患者携带了相关的致病变异。其中,生殖系错义点变异(germline missense SNVs)最为常见,其他类型生殖系变异如插入缺失型变异(indels)、无义点变异(nonsense SNVs)和大片段拷贝数变异(CNVs)均有检出。研究首次发现脑瘫患者中
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极致周期!带你感受什么是“高速”代谢组学
作者:德尔塔 日期:2022-04-14
近年来,代谢组学相关的研究越来越多,如何在百花齐放、竞争日益激烈的科研环境下,发表高质量的代谢组学科研成果,快速拿到分析结果显得至关重要!时间就是速度,效率就是生命! 最近,很多趣粉们来问小趣,BIOTREE的非靶标代谢组学检测分析服务能否缩短项目周期。当然可以啦。铛铛铛铛~BIOTREE“高速”代谢组学隆重登场! “高速”=高质量+速度快 高质量-Biotree6D质控体系 Biotree创建了基于QC和IS两大核心的6D质控体系,可严格把控实验的各个环节。* 内标峰高差在30%内;* 空白样本无明显内标检出;* QC样本聚集程度;* QC样本分布在2std以内;* 批次内QC相关性;* QC内标峰面积RSD。 速度快-完善的项目流程管理系统 项目从寄样到交付,其中的每一个步骤都通过公司信息化系统LIMS2进行操作,收样、实验、分析等的每个环节都确保高效率和可追溯性,实现快速的结果交付。 活动详情 技术平台:QE-HFX非靶标代谢组学检测平台 适用产品:UHPLC-QE HFX非靶标代谢组学、外泌体非靶标代谢组学、肠道菌群非靶标代谢组学、发现代谢组学部分产品(新品) 项目周期:液体样本15天交付结果;固体样本20天交付结果。(注意:项目周期以样本到我司开始计算;200样本以上项目,周期需要和当地销售工程师具体沟通) 送样时间:8月31日前送样 咨询方式 和BIOTREE全国各地办事处的销售工程师直接联系咨询; 直接在本文或微信公众号后台留言“姓名+单位+电话+高速代谢组学”,我们将尽快与您取得联系; 致电400-664-9912进行咨询; 请发送邮件至marketing@biotree.cn,我们会尽快与您电话取得联系。标题“高速代谢组学”,正文包含姓名、电话及单位名称。
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中国“优薯计划”与欧洲“ADAPT”谁将胜出?表型技术或是关键
作者:德尔塔 日期:2022-04-14
马铃薯是世界上最重要的块茎类粮食作物,全球有13亿人口以马铃薯为主食。在我国,马铃薯也被称为仅次于水稻、小麦和玉米的“第四主粮”。 为了培育更优良的马铃薯品种并彻底解决马铃薯产业面临的问题,在农业农村部、中国农科院和深圳市政府的支持下,中国农业科学院深圳农业基因组研究所黄三文研究员联合云南师范大学等国内外优势单位发起了“优薯计划”,即运用“基因组设计”的理论和方法体系培育杂交马铃薯。 2021年6月24日,《Cell》 在线发表了黄三文团队题为Genome design of hybrid potato的研究论文,报道了该团队在杂交马铃薯育种领域的最新研究成果,这是“优薯计划”实施以来取得的里程碑式突破。 在欧洲,2020年由维也纳大学、波恩大学、乌得勒支大学、瓦赫宁根大学、杜伦大学、PSI公司(植物表型组学仪器技术研发与生产商,易科泰生态技术公司表型组学研究技术国际合作伙伴)、欧盟马铃薯贸易联合会、梅耶尔马铃薯公司等马铃薯相关研究与产业机构,联合展开了“Accelerated Development of multiple-stress tolerAnt PoTato”(加速开发多胁迫抗性马铃薯)简称ADAPT项目,目标是通过基因组学和表型组学研究,利用现代先进育种技术与表型组学研究技术,培育可抵抗多种胁迫的高抗性马铃薯品种,以应对全球气候变化造成的高热、干旱、水淹等挑战性生长条件。ADAPT项目已获得欧盟地平线2020研究与创新计划500万欧元资助。 采用高通量表型分析技术(High Throughput Phenotyping,HTP)进行表型组学研究、抗性筛选是ADAPT项目成功的关键。植物表型技术主要由4大模块组成: 模块名称 技术种类 功能 光学表型成像传感器技术 RGB彩色图像技术 叶绿素荧光成像技术 高光谱成像技术 红外热成像技术等 各种表型组学成像数据的获取与测量 自动化样品传送技术 Plant-to-Sensor(PTS) Sensor-to-P
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利用微生物发酵罐进行种子制备的方法
作者:德尔塔 日期:2022-04-14
我们知道酵母菌、曲霉菌、醋酸杆菌等微生物菌种常常通过人工被筛选扩培后用在发酵、酿造、食品添加剂等工业化生产工艺中。利用微生物发酵罐进行菌种扩培可以在短时间内提供发酵 产物高、菌群稳定、数量庞大且纯正的有效菌种 。 一、菌株的筛选工艺 菌株筛选简单地说就是通过菌种分离、菌种初筛和菌种复筛等方法挑选出需要的有效菌种的过程。由于这个工序比较耗时,且产量相对较低。所以多数企业工厂进行大规模发酵生产时都会省去这一环节,直接采购相应发酵类型的原菌株进行菌种扩培制备。 二、 种子制备工艺 种子制备是把培养基上的霉菌孢子或菌体转移到液体培养基中进行增殖扩培的过程。 主要分为两个阶段: ⑴ 实验室中的种子制备:由于刚培养的菌株或孢子数量较少,需要将其接入摇瓶中培养当数量有所增加后,再进入第二阶段的扩培。 ⑵微生物发酵罐中的种子制备: 用于微生物菌种制备的发酵罐也被称为“种子罐”.经摇瓶培养的一级种子接入体量较小的发酵罐(比如:搏旅系列的2-15L的台式微生物发酵罐)内进行扩培形成的种子称为二级发酵。将二级发酵的种子菌群接入体积较大的发酵罐中再次扩培就会进入三级发酵,多数菌种通过三级发酵后数量基本已满足工业生产需要,在有些抗生素制药工艺中,比如用放线菌生产链霉素,由于菌种本身生长缓慢,不得不采用四级发酵的方式进行种子扩增。 三、菌种扩培工艺 大型制药企业、酿酒制造企业、调味品制造企业往往需要的发酵种子菌的数量巨大,因为工艺生产中提高接入种子菌的数量是缩短发酵时间、提高发酵效率的有效途径。所以,对于扩大培养菌种来说不仅要培养出纯壮的个体菌株,还需要培养规模化的茁壮菌群。由此可见,种子菌的制备也是发酵生产工艺中的重要环节。 生产工艺中大型微生物发酵罐常用这一环节中,来进行种子的后期扩大培养。根据不同产品的发酵过程,所使用的发酵级别也不尽相同。一般来说,放线菌的菌体生长速度相对较慢,多采用三级发酵的方
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抗体的六种分类方式和具体介绍
作者:德尔塔 日期:2022-04-14
抗体(antibody)指机体的免疫系统在抗原刺激下,由B淋巴细胞或记忆细胞增殖分化成的浆细胞所产生的、可与相应抗原发生特异性结合的免疫球蛋白。主要分布在血清中,也分布于组织液及外分泌液中。抗体有如下六种分类方式 一、按作用对象 按作用对象,可将其分为抗毒素、抗菌抗体、抗病毒抗体和亲细胞抗体(能与细胞结合的免疫球蛋白,如1型变态反应中的lgE反应素抗体,能吸附在靶细胞膜上) 二、动物抗体功能 根据注入细菌或病毒的不同,以及注射到不同种类的动物体内,得到不同免疫性能的抗病毒血清抗体。根据河南顺鑫动物血液制品有限公司的市场调研,市场上动物血清抗体大致分为以下几类抗体: 1、猪抗体:猪瘟抗体,猪蓝耳抗体,猪圆环病毒抗体,猪伪狂犬抗体,猪细小病毒抗体,猪口蹄疫抗体,猪流感抗体等。 2、禽抗体:小鹅瘟抗体,鸭肝抗体抗体,鸭浆膜炎抗体,禽流感抗体,新城疫抗体等 3、牛抗体:牛口蹄疫抗体,奶牛乳房炎抗体,牛流行热抗体,牛病毒性腹泻抗体,牛出血性败血症抗体等 4、羊抗体:羊痘抗体,羊口蹄疫抗体,羊小反刍兽疫抗体,羊快疫抗体,羊肠毒血症抗体,羊猝疽抗体,羊黑疫抗体等 5、犬抗体:犬狂犬病抗体、犬瘟热抗体、犬副流感抗体、犬腺病毒抗体与犬细小病毒病抗体,狐貉水貂的伪狂犬抗体、细小病毒抗体、乙脑抗体等 三、按理化性质 按理化性质和生物学功能,可将其分为IgM、IgG、IgA、IgE、IgD五类。 IgM抗体是免疫应答中首先分泌的抗体。它们在与抗原结合后启动补体的级联反应。它们还把入侵者相互连接起来,聚成一堆便于巨噬细胞的吞噬; IgG抗体激活补体,中和多种毒素。IgG持续的时间长,是唯一能在母亲妊娠期穿过胎盘保护胎儿的抗体。他们还从乳腺分泌进入初乳,使新生儿得到保护; IgA抗体进入身体的黏膜表面,包括呼吸、消化、生殖等管道的黏膜,中和感染因子。还可以通过母乳的初乳把这种抗体输送到新生儿的消化道黏膜中,是在母乳中含量最多,最为重要的一类抗体;
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CLSI M100 2020文件:抗菌药物药敏试验折点变化解析
作者:德尔塔 日期:2022-04-14
CLSI M100 2020文件关于抗菌药物药敏试验折点的变化有哪些? 1、新折点和修正折点 首先是头孢地尔,这个药在国内还没有上市,国外也才刚刚开始,确定了它对肠杆菌目、铜绿假单胞菌、不动杆菌属和嗜麦芽窄食单胞菌纸片扩散法研究性折点;确定了黏菌素和多黏菌素B对肠杆菌目的MIC折点 (之前为ECV) ;确定了达托霉素仅对屎肠球菌的MIC折点。并修订黏菌素和多黏菌素B对铜绿假单胞菌、不动杆菌属MIC折点;达托霉素对非屎肠球菌的其他肠球菌属的MIC 折点。 2、更新的指导 在更新的指导里面,特别是对于粘菌素有两个重要的实验,第一个是琼脂实验,第二个是肉汤纸片洗脱实验。这两个实验确定的是粘菌素对于肠杆菌目和铜绿假单胞菌的效果,只适用于这两种菌,对于鲍曼不动杆菌是不适用的。 肺炎链球菌增加了一种培养基——MHF培养基。规定了头孢地尔的检测是要用乏铁的肉汤CAMHB来进行检测的。 拓展的一些更新定义里面,除了中介还有SDD。这一次还增加I^ 的解释分类,这是以前版本里从来没有过的。 除此之外,还有增加了剂量依赖性敏感解释分类的定义,整个表1重新进行了排版,并给出了粘菌素和多粘菌素B在检测和报告时应该注意的事项。 3、修订建议 进行肠杆菌目和头孢他定/阿维巴坦药敏时,应进行MIC确认试验的抑菌圈直径标准;环丙沙星和大肠埃希菌ATCC® 25922的纸片扩散法QC范围; 特地唑胺和金黄色葡萄球菌ATCC ® 25923;对于嗜麦芽窄食单胞菌,目前米诺环素和左氧氟沙星列在检测/报告A组。 修订术语:将凝固酶阴性葡萄球菌(CoNS) 称为 “其他葡萄球菌” 。肠杆菌科改为肠杆菌目。 4、新药和不常用药物药敏产品的选择 头孢地尔在国内还没有上市,国外也才刚刚开始,2015年2月美国FDA批准新型抗生素药头孢他啶/阿维巴坦在美国上市,我国是2019年9月份才开始再国内上市。头孢地尔药敏纸片、头孢地尔MIC药敏条、头孢他啶/阿维巴坦药敏纸片、头孢他啶/阿维巴坦MIC药敏条、黏菌素药敏纸片等个别小品种药敏纸片,目