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靶标代谢流解决方案介绍与应用
作者：德尔塔 日期：2022-04-13
基于13C或者15N标记的靶标代谢流分析能够系统地定量细胞或者组织内特定代谢通路代谢网络的流量分布及各代谢途径的相对贡献，其优点是可以利用细胞内代谢物的质量同位体信息的分析方法，不但在很多情况下能够直观地表明代谢流量的整体走向，而且通过计算能够准确定量地揭示细胞内各个代谢反应的活性，以及深入理解平行反应、可逆反应等多种复杂的细胞内代谢过程，直观揭示细胞胞内的主要活性途径及各个途径的相对贡献及其分布变化特点，从而鉴定出相关疾病发生发展过程的早期诊断的标志物及其关键的主要代谢通路，并揭示其相互调控规律，为疾病发生的临床早期诊断、药物靶点**和预后判断提供强有力的科学依据。 Ex vivo and in vivo stable isotope labelling of central carbon metabolism and related pathways with analysis by LC-MS/MS 一、靶标代谢流解决方案 BIOTREE能量代谢之靶标代谢流解决方案：主要集中在能量代谢明星通路精细化代谢速率研究， 包含糖酵解途径、三羧酸循环、磷酸戊糖途径。 糖酵解途径(EMP)是指糖原或葡萄糖分子分解至生成丙酮酸的阶段，是体内糖代谢最主要途径。此途径在动植物和许多微生物中普遍存在。在需氧生物中，糖酵解途径是葡萄糖氧化生成二氧化碳和水的前奏。糖酵解生成的丙酮酸可进入线粒体，通过三羧酸循环(TCA)及电子传递链彻底氧化成二氧化碳和水，并生成腺嘌呤核苷三磷酸。 代谢流-糖酵解途径（部分物质） 三羧酸循环是(TCA) 需氧生物体内普遍存在的代谢途径，是生物机体获取能量的主要方式，是糖，脂肪和蛋白质三种主要有机物在体内彻底氧化的共同代谢途径，是体内三种主要有机物互变的中心枢纽 代谢流-三羧酸循环（部分物质） 磷酸戊糖途径(PPP) 是葡萄糖氧化分解的一种方式，在动物、植物和微生物中普遍存在。在生物体内磷酸戊糖途径(PPP)除了提供能量外，主要是为合成代谢提供多种原料。如为脂肪酸、胆固醇的生物合成提供还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷磷酸
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Treg三种表型中有抗肿瘤活性的部分解析
作者：德尔塔 日期：2022-04-13
前言：调节性T细胞（regulatory T cells ，Treg）在我们的潜意识中成了免疫抑制，促进肿瘤的“坏细胞”。但其实不然... 调节性T细胞及其稳定性 Treg作为免疫系统的调节因子，维持内稳态，防止自身免疫性疾病发生发展。 Treg抑制功能通过多种机制发挥作用： 分泌抑制性细胞因子：IL10、IL35、TGFβ 产生CD39、CD73、腺苷产生或IL2剥夺，破坏代谢 通过颗粒酶B直接溶解免疫细胞 通过LAG3和CTLA-4调节DC的发育和功能等 肿瘤微环境(TME)的独特之处在于它营养不良、缺氧和酸性，对于效应T细胞(Teffs)非常不友好，因为其依赖糖酵解提供能量。与此相反，Treg依赖于氧化磷酸化，并被认为在缺氧、酸性环境中具有增殖和功能优势。 Treg的稳定性被定义为Foxp3的持续表达，CNS2位点的低甲基化，并维持抑制功能。现在这些观点在逐渐改变，Treg不稳定性最初被定义为细胞中Foxp3表达的缺失，随后抑制功能的丧失，最近几年，研究者发现另外一群脆弱型Treg, 表达Foxp3，但是没有抑制功能。 调节性T细胞的三种表型 Cancer Immunol Res; 6(8) August 2018 根据Treg是否表达Foxp3以及是否具备抑制功能，将其分为三类 稳定型Treg: 表达Foxp3，具有抑制功能 脆弱型Treg：表达Foxp3, 但IL-10等抑制因子表达下降，无/低抑制功能，分泌IFN-γ，具有抗肿瘤活性 不稳定Treg：不表达Foxp3，无抑制功能 Foxp3表达缺失部分原因是由于Foxp3基因某些位点缺乏去甲基化。该位点的去甲基化于2007年首次被描述，Foxp3位点的5’UTR中发现了一个保守的去甲基化CpG基序的区域(称为TSDR/CNS2)。这种去甲基化模式在小鼠和人类外周血的胸腺和成熟的周围Treg中均可观察到。相比之下，CNS2在效应CD4+T细胞中被甲基化。 Foxp3位点的低甲基化被认为是Treg稳定性所必需的，但它不依赖于Foxp3的上调而发生。 抗肿瘤活性-脆弱型Treg Cell 169, 1130–1141.e11 (2017). 多种因素对Treg脆性很重要，包括Nrp1、Foxo1和Eos。 Nrp1缺
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最接近生物表型的组学：代谢组学介绍与分析流程
作者：德尔塔 日期：2022-04-13
■ 什么是代谢组学 在基于基因组-转录组-蛋白质组-代谢组的系统生物学框架内，代谢组学 (metabolomics/metabonomics) 处于最下游，最接近生物表型，主要通过考察生物体系在某一特定时期内受到刺激或扰动前后所有小分子代谢物 (分子量小于 1500 Da) 的组成及含量变化，寻找代谢物与生理病理变化的相对关系。 图 1. 基于基因组-转录组-蛋白质组-代谢组的系统生物学 ■ 代谢组学的优点 1、代谢组处于系统生物学的最下游，基因组和蛋白质组的细微功能变化可以在代谢层面上放大，检测更容易； 2、植物、动物、微生物的代谢物数量远远少于基因和蛋白质，且常见的代谢物在不同生物体系中很相似，所以代谢组学可适用不同的生物体系； 3、可与生物表型变化建立直接相关性。 ■ 代谢组学的常见类型 图 2. 常见的代谢组学的分类 ■ 非靶向代谢组学检测的案例 肝细胞癌 (HCC) 是全球第三大致死性癌症，目前常采用影像学方法 (如 CT、B 超等) 和血清生物标志物 (甲胎蛋白) 来筛查和诊断 HCC，但是敏感性仍然很低，该研究旨在寻求新的 HCC 早期生物标志物。 在这篇研究中，从多个临床中心共纳入 1448 名受试者，包括健康对照、慢性乙型肝炎患者、肝硬化患者和 HCC 患者，首先作者团队采用 LC-MS/MS 法对受试者的血清样本进行生物标志物的筛选和验证 (图 3)。 图 3. 实验设计 发现阶段 (发现候选生物标志物)，测试阶段 (验证上述发现的候选生物标志物) 和验证阶段 (确定最终生物标志物) 最终研究者确定了一组新型的血清标志物：苯丙酰色氨酸和甘氨胆酸盐 (图 4)。在高危肝硬化人群中，该标志物组合表现出比甲胎蛋白更好的诊断能力。若与甲胎蛋白联用可以更好的预测临床前 HCC。 图 4. 一组新型的血清标志物的确定 综上，该研究团队发现并验证的这一组血清生物标志物，对早期 HCC 具有很好的诊断能力，有望成为肝癌临床前预测的新指标。 MCE 代谢组学服务 MCE 代谢组学技术服务主要包括非靶向代谢组学和靶
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Plant Phenomics | 园艺植物表型组学研究应用文章合集
作者：德尔塔 日期：2022-04-13
Plant Phenomics | 基于光流法分析水分胁迫条件下番茄叶片萎蔫与茎直径变化的关系 Optical Flow-Based Analysis of the Relationships between Leaf Wilting and Stem Diameter Variations in Tomato Plants Kazumasa Wakamori and Hiroshi Mineno https://doi.org/10.34133/2019/9136298 Plant Phenomics | 利用体内表型分析进行番茄干旱胁迫的早期检测 In Vivo Phenotyping for the Early Detection of Drought Stress in Tomato Michela Janni, Nicola Coppede, Manuele Bettelli, et al. https://doi.org/10.34133/2019/6168209 新方法！预测芸薹属植物花期耐热抗旱性的无损表型测量方法 | Article Nondestructive Phenomic Tools for the Prediction of Heat and Drought Tolerance at Anthesis in Brassica Species Sheng Chen, Yiming Guo, Xavier Sirault, et al. https://doi.org/10.34133/2019/3264872 来阵风，就知道！一种植物无损快速振动表型分析方法 | Aticle Nondestructive and Fast Vibration Phenotyping of Plants E. de Langre, O. Penalver, P. Hémon, et al. https://doi.org/10.34133/2019/6379693 利用机器视觉量化葡萄白粉病严重程度的高通量表型系统 | PPhenomics Article A High-Throughput Phenotyping System Using Machine Vision to Quantify Severity of Grapevine Powdery Mildew Andrew Bierman, Tim LaPlumm, Lance Cadle-Davidson, et al. https://doi.org/10.34133/2019/9209727 Plant Phenomics | 潜在空间表型：用于抗性研究的自动化图像表型 Latent Space Phenotyping: Automatic Image-Based Phenotyping for Treatment Studies Jordan Ubbens, Mikolaj Cieslak, Przemyslaw Prusinkiewicz, Isobel Parkin, Jana Ebersbach, and Ian Stavness https://doi.org/10.34133/2020/5801869 Plant Phenomics | 使用高通量表型技术评估拟
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UGDH通过增加SNAI1 mRNA的稳定性促进肿瘤转移
作者：德尔塔 日期：2022-04-13
UDP-glucoseaccelerates SNAI1 mRNA decay and impairs lung cancer metastasis. Doramapimod purchased from MCE. 癌症转移是肿瘤发病率和死亡率的主要原因，占癌症相关死亡的 95%。癌细胞经常重新调整它们的新陈代谢来有效地支持细胞增殖和存活。然而，在很大程度上，肿瘤的这些代谢变化是否以及如何促进肿瘤细胞的迁移仍不清楚。UDP-glucose6-dehydrogenase ((UGDH)是糖醛酸途径中的关键酶，将糖醛酸转化为糖醛酸。研究发现，EGFR 激活后，UGDH 在人肺癌细胞中被酪氨酸 473 磷酸化。磷酸化的 UGDH 与 Hu 抗原 R (HuR)相互作用，将 UGDH-葡萄糖转化为 UGDH -葡萄糖醛酸，减弱了UGDH -葡萄糖介导的抑制 HuR 与 SNAI1 mRNA 的结合，从而增强了 SNAI1 mRNA的稳定性。增强 SNAL 的表达启动了上皮-间质间的转化，因此促进了肿瘤细胞的迁移和肺癌的转移。此外，UGDH 在酪氨酸 473 位点的磷酸化与肺癌转移复发和预后不良有关。研究人员的研究显示 UDP-葡萄糖在肺癌转移中的抑癌作用，揭示了 UGDH 通过增加 SNAI1 mRNA 的稳定性促进肿瘤转移的机制。 UDP-glucose6-dehydrogenase (UGDH) is a key enzyme in the uronic acid pathway, and converts UDP-glucose to UDP-glucuronic acid. Afteractivation of EGFR, UGDH is phosphorylated at tyrosine 473 in human lung cancer cells. Phosphorylated UGDH interacts with Hu antigen R and converts UDP-glucose to UDP-glucuronic acid, which attenuates the UDP-glucose-mediated inhibition of the association of HuR with SNAI1 mRNAand therefore enhances the stability of SNAI1 mRNA. Increase dproduction of SNAIL initiates the epithelial–mesenchyme transition, thus promoting the migration of tumor cells and lung cancer metastasis. Researchers’findings reveal a tumor-suppressive role of UDP-glucose in lung cancer metastasis and uncover a
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注射剂与药用玻璃相容性研究的目的意义、步骤及法规要求
作者：德尔塔 日期：2022-04-13
一、注射剂与药用玻璃相容性研究的目的和意义 药品的包装材料和容器是药品的“第二生命”，它伴随药品的生产、流通、使用全过程，是药品不可分割的一部分，其质量关乎着药品的疗效与人体安全健康。 药用玻璃因其高阻隔性、耐高温、易消毒、成本低、可回收、环境污染相对较小等优点，被广泛应用于各类注射针剂、生物制品、血液制品及输液制品等。尤其在注射剂药品包装中，占小容量注射剂药品包装的绝大部分。 近年来，药用玻璃包装的注射剂药品因“玻屑”问题而被抽检不合格或召回的案例不断发生。2012年底，药监总局紧急叫停碳酸氢钠注射液所用的普通钠钙玻璃瓶包装，原因是这种玻璃容易与碱性物质发生反应生成硅酸盐玻屑。2015年7月，某盐酸多巴酚丁胺注射液被药监部门抽检为劣药，经调查发现药品本身没有质量问题，而是注射液玻璃瓶出了问题，检查人员在玻璃瓶里发现了玻璃颗粒和碎屑，属于可见异物。 即使在发达国家，药用玻璃与注射剂相互作用产生质量问题的案例也时有发生。如2010年及2011年，欧美药品市场发生大量涉及玻璃包装注射剂产品的召回。召回的主要原因，是药品和玻璃包材不相容，在储存期内发生非常细小的碎片剥离，导致严重安全隐患。 然而，即使选用高质量的药用玻璃包材包装合格药品，也不一定能得到合格的包装系统，注射剂与药用玻璃两者之间存在相容性的问题，只有适宜的包装系统才能保证药品质量。而药用玻璃是否“适宜”药品，关键在于二者的相容性试验研究。 综上所述，为保证药品质量，应当在选择符合各国药典标准的高质量药用玻璃包材基础上，开展充分的相容性研究。 IRAS长期低碱处理管瓶，使用日本专有技术，低碱性，无脱片，符合各国药典标准！ 二、注射剂与药用玻璃相容性研究的法规要求 相对于欧美发达国家，我国相容性研究开展的比较晚。随着因药用玻璃产生“玻屑”导致注射剂被召回的事件逐渐增多，国家食品药品监督管理局2012年11月下达了《关于加强药用玻璃包装注射剂药品监
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真空抽濾系統&废液抽吸系统操作使用说明书
作者：德尔塔 日期：2022-04-13
可攜式真空抽濾系統、废液抽吸系统 Lafil 300 - LF 30 Lafil 400 - LF 30 Lafil 300 - SF 10 / LF 32 Lafil 400 - SF 10 / LF 32 Lafil 400 - LF 5a - 500 Lafil 300 Plus Lafil 400 Plus Lafil 300 - BioDolphin Lafil 400 - BioDolphin 重要注意事項 ⚫ 使用本產品前請先詳讀本說明書。 ⚫ 請依相關的法令規範丟棄包裝材料。 ⚫ 請依主機上標示的電源規格，確認供應電源的電壓與頻率正確。 ⚫ 請於室內通風的平台上操作設備，並注意周遭不可有易燃物。 ⚫ 過濾瓶組(包含防溢保護裝置)適用大部份低濃度之酸鹼有機溶液，並非所有溶劑。 ⚫ 請先洩壓到真空錶的指針為零後，再打開電源開關。 ⚫ 本產品並非耐腐蝕幫浦，不適合應用於抽酸鹼有機氣體。 ⚫ 在每次使用後，請依保養方法，進行過濾產品、管路及外觀的清潔。 ⚫ 更詳細的產品資訊請參閱最新的型錄與官方網站。 拆裝前檢查 在拆封本產品前，請先確認包裝盒無任何損害。使用前請先比對產品型號與核對組件清表，確認所 有的配件數量相符，如有任何問題，請保留序號與包裝盒，並接洽當地經銷商以獲得處理 。 日常維護 1. 漏斗蓋、過濾杯、過濾基座、 廢液抽取轉接蓋、接收瓶蓋、防溢保護裝置與接收瓶為耐高溫 材質，請以清水沖洗乾淨， 若需要再以高溫蒸氣滅菌來消毒滅菌後，擦拭乾淨後收藏保存。 2. 不鏽鋼過濾杯與不鏽鋼過濾基座為 SS316 材質，請以清水沖洗乾淨， 若需要再以高溫蒸氣滅 菌來消毒滅菌後，擦拭乾淨後收藏保存。 3. 矽膠管與矽膠 O 型環皆可耐高溫，可用清水沖洗乾淨，再以高溫蒸氣滅菌來消毒滅菌後，擦 拭乾淨後收藏保存。 4. 高溫蒸氣滅菌建議以溫度 121 度至少滅菌 30 分鐘。 5. Lafil 400 主機內含無油式真空幫浦，無需進行保養但在使用之後，請先關閉電源，並將凹槽 中的殘流水漬以乾布擦拭乾淨後收藏保存。 6. 廢液抽吸套件組的零組件，請依其盒中提供的操作手冊進行保養。 7. 消音器與矽膠管屬消耗材，請定期檢查並更換新品，以確保流量的充足 。
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Nucleofection核转处理步骤及提高电转染效率的小技巧
作者：德尔塔 日期：2022-04-13
01 Nucleofection™核转的处理 – 简单的操作方案 步骤一： 获取目标细胞 步骤二： 混合和结合 转移至Lonza认证的电转杯或电转板条中 步骤三： 选择Nucleofector™程序，放入电转耗材，按下开始按钮 步骤四： 用培养基将电转耗材的细胞转移出来 步骤五: 转移至培养皿中。Nucleofection™电转后3-8小时即可检验 02 提高Nucleofection™核转效率 小技巧： 1.准备好加了新鲜培养基的多孔板，并在实验前于37°C下预平衡。 2.使用传代次数少并具有推荐融合度或密度（对数生长）的细胞。 3.限制胰蛋白酶暴露时间，仔细监测细胞分离情况。 4.根据优化方案进行细胞计数并使用适量细胞数；所用细胞过少可能导致细胞死亡率增加。 5.采用高质量DNA，使用内毒素去除试剂盒进行纯化；请通过测定A260:A280比值检查各质粒制备液的纯度。 6.室温下以离心速度80-100×g和方案规定的时间进行离心。 7.离心后加入Nucleofector™溶液，混匀溶液/细胞沉淀制备成单细胞悬液，避免对细胞沉淀进行额外操作或用移液器枪头抽吸。 8.Nucleofection™核转后，用核转试剂盒内配的一次性移液管在电转耗材中的细胞顶部加入约500μL预热培养基。 •轻轻将一次性移液管吸头置于电转耗材底部，收集细胞 •将细胞悬液轻轻接种至制备的多孔板中 •请勿重复抽吸混合细胞
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评估化学胁迫下微藻非光化学淬灭对温度和光照相互作用的新方法
作者：德尔塔 日期：2022-04-13
基于叶绿素a荧光评估光合生物生理状态的方法是近50多年来植物和微藻研究的**技术。叶绿素荧光作为无损的探针可以直接探测细胞的光合机制，特别是光系统II（PSII），另外，一定程度上也可以探测到光系统I（PSI）。叶绿素荧光的研究结果可以用来理解光合生物体的生理过程，但也不仅限于此，因为大多数生物代谢途径直接或间接地依赖于光合作用。多年来，研究人员已经开发了大量叶绿素a荧光测量的技术和方法并得到了广泛用的应用，例如直接闪光诱导荧光，脉冲幅度调制荧光（PAM），高分辨率快速荧光诱导，快速重复频率荧光（fRRF），以及星载的地面荧光观测。所使用的仪器最初是由研究人员自己制造的，后来渐渐地商业化。其中一种仪器是德国WALZ公司生产的IMAGING-PAM，它通过CCD相机测量叶绿素a荧光并将荧光数据图像化。叶绿素荧光成像系统的优点是可以同时测量多个样品或大型光合生物的多个区域，可以轻松评估样品的异质性。 了解温度、光照、营养物质、pH值和CO2等多种非生物胁迫对光合生物生理性能的交互影响是预测和理解植物应对气候变化响应的基础。传统上，评估以上多重胁迫的相互作用既费时又费力，亟需新的方法来改善这类研究过程。近日，New BIOTECHNOLOGY (IF=5.1)杂志刊登了悉尼科技大学Andrei Herdean的最新研究文章“Phenoplate: An innovative methodfor assessing interacting effects of temperature and light on non-photochemicalquenching in microalgae under chemical stress”。文章中作者展示了一个新的实验方案，用于同时沿多个胁迫梯度进行高通量光生理测量。具体方案的细节是通过将IMAGING-PAM与实验室PCR实验中广泛使用的热循环仪相结合来实现的。 图1 Phenoplate方案及示例数据：IMAGING-PAM+热循环仪，示例数据 上述文章的实验旨在研究微藻对多种环境胁迫相互作用的短期响应，从而揭示其部分表型。改变不同样品中磷（P）的含量，目的是为了限制其对类囊体膜ATP合酶的可用性，以观察这种限
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Cell Metabolism | 中国代谢研究：现在与未来
作者：德尔塔 日期：2022-04-13
在过去的几十年里，中国见证了经济增长和社会福利的巨大飞跃。与此同时，中国人也受到了营养过剩、缺乏体育锻炼以及代谢紊乱（包括肥胖、糖尿病、非酒精性脂肪肝和心血管疾病）的影响。国家统计局调查结果显示，老龄化进一步加剧了代谢紊乱。另一方面，代谢领域的研究进展也取得了重大进步。清华大学生命科学学院的李蓬院士团队对中国代谢领域研究进行了全面梳理，旨在加深对从实验室研究到临床实践代谢应用的进一步理解，相关成果发表于《Cell Metabolism》。 中国代谢领域发表文章现状 以“代谢”和相关术语作为关键词，对2011-2020年中国代谢研究发表的论文进行检索，要求第一作者的第一单位是中国研究机构。结果（图1）显示，与代谢相关出版物总数稳步增长了600%以上（2011年为1,447篇，而2020年为9,034篇）。同时，在PubMed中以“代谢”为关键词的国际出版物总数比例显著增加（从2011年的8%到 2020年的25%；图 1A）。以“糖代谢”或“脂代谢”为关键词的出版物也增加了800% 以上（图1B）。以关键词“免疫代谢”或“癌症代谢”定义的跨学科研究工作也显著增长（图1C）。作者还调查了发表在《Cell Metabolism》杂志的文章（图1D），在过去十年，《Cell Metabolism》杂志每年发表220篇文章。根据第一作者或最后一位通讯作者的单位定义，中国的出版物在过去十年的前五年保持稳定，而在 2017-2020 年期间出现显著增长，从 5 篇/年增加到15 篇/年。对代表性期刊的调查表明，中国代谢领域研究在质量上也有显著提高。 由于代谢调节涵盖了从分子、细胞和生理到群体水平的所有领域，本文总结了中国在代谢传感、亚细胞器网络、组织间交互作用和人类临床队列研究领域的代谢研究进展。 图1. 根据NCBI PubMed数据库，2011-2020年中国学者在代谢领域的年度出版物统计 代谢物传感和转运 葡萄糖在不同生物界能量代谢中占据中心位置：在分解代谢中充当丰富的燃料分子，在合成代谢中充当多功能生物合成前体。作为葡萄糖的细胞通
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FluorCam叶绿素荧光成像技术：采后生理学—采后保鲜与品质鉴定
作者：德尔塔 日期：2022-04-13
易科泰FluorCam叶绿素荧光成像技术：采后生理学—采后保鲜与品质鉴定 水果、蔬菜、鲜花等鲜活农产品采摘后生理过程会有明显的变化。收获的鲜活农产品在呼吸作用、蒸发作用等变化影响下，导致其组织衰老、水分损失，甚至腐败变质。相关采后生理学的研究与与其贮藏、保鲜、运输有着密切的联系。而鲜活农产品又不同于作物，不能进行干燥保存，必须使用物理或化学方法的保鲜技术延缓农产品新鲜度下降并防止腐败变质，保持其良好鲜度和品质。而对相关采后保鲜技术开发就必须有一种可靠、简便、直观的技术能对处理后的鲜活农产品进行快速品质鉴定，FluorCam叶绿素荧光成像技术就恰好能完全满足这方面的需求，因此在相关的研究中有大量的应用。同时，高光谱成像技术也经常与FluorCam联用，获取更全面的品质检测数据。 案例1：水果蔬菜储存与温湿度的关系 早在2014年，韩国韩京大学的科学家就使用FluorCam叶绿素荧光成像系统测量西红柿、辣椒、苹果、猕猴桃等水果蔬菜在不同储存条件下（室温、低温、高温、高湿）的品质变化，通过最小荧光Fo、最大荧光Fm、最大光化学效率Fv/Fm和非光化学淬灭系数NPQ，从光合生理的角度证实低温是最佳的常规水果蔬菜保鲜技术。 案例2：甜椒的最佳低温保存条件 低温保存也有可能对储存的农产品造成冷害。因此匈牙利圣伊斯特万大学使用FluorCam研究了甜椒在不同低温储存后保存期的变化。结果显示5℃低温储存延缓了甜椒果实的采后成熟，即使甜椒进入保存期，对其保鲜也有作用。而2.5℃低温储存下，叶绿素荧光参数表明甜椒极可能出现了低温损伤，因此在储存中如果有类似低温情况需要进行快速的处理以免甜椒变质。 案例3：苹果热水保鲜处理后的品质评估 在进行鲜切沙拉生产时，热水处理也是一种常用的保鲜技术。同样的，处理温度、时机与持续时间也是至关重要的。德国莱布尼茨农业工程和生物经济研究所（ATB）运用FluorCam和高光谱技术对不同苹果品种的热水处理进
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RORγ反向激动剂-XY101小分子化合物发现过程
作者：德尔塔 日期：2022-04-13
早在 2016 年，中国科学院广州生物医药与健康研究院许永教授团队就曾与加州大学戴维斯分校的陈宏武教授合作，首次发现核激素受体 RORγ 是作用于雄激素受体 AR 上游的关键驱动因子，直接调控雄激素受体 AR 的表达。因此，RORγ 成为前列腺癌**的新靶标。2019 年 4 月 9 日，许永教授课题组发现新型 RORγ 受体反向激动剂—XY101，并将该研究成果发表在新药研发知名国际期刊《Journal of Medicinal Chemistry》上。新型小分子化合物的研发过程总是历经千辛万苦，接下来就和小编一起拜读一下大作吧~ 图1. 新型RORγ 反向激动剂—XY101 视黄酸受体-孤儿受体γ(RORγ)，是核受体超家族中的一员,是一种配基依赖型的转录因子。RORγ 调节 Th17 免疫细胞产生促炎细胞因子白介素-17（IL-17；interleukin-17）和白介素-22（IL-22；interleukin-22）的功能。由于 RORγ 在多种重要炎症通路都发挥着相应的生物学功能。因此，现已开发了多种 RORγ 受体反向激动剂。 Zhang Y等，利用组合片段、替换基团的方式优化化合物结构，共合成了 36 种相关小分子化合物。在众多化合物中，发现了 XY101（化合物 27），能够显著的抑制 RORγ 的转录活性（ IC50 = 30 nM），并对其他的核受体无明显抑制作用（如图2.所示）。 图2.RORγ 反向激动剂—XY101 结构图 据体外细胞实验结果显示，化合物 XY101 可以抑制多种前列腺癌细胞的增殖与克隆形成，同时可有效抑制前列腺癌细胞中 AR、AR-v7 和 AR 调控的下游基因 PSA 等以及 ERG 和 MYC 等癌基因的表达（如图3.所示）。 图3.XY101 体外细胞实验结果 随后，研究人员对化合物 27 的体内生物学效力进行了检测。在前列腺癌异种移植裸鼠（由 22Rv1 细胞诱导）模型中，以口服 XY101（10 mg/kg）和静脉注射 XY101（2 mg/kg）的方式给予小鼠处理。实验结果表明，XY101 对前列腺癌小鼠表现出良好的药效，能够显著抑制异种移植前列腺癌模型裸鼠中的肿瘤生长。研究人员还发现，XY101 具有优越的选择性、良好的代谢
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利用鲍伊-迪克测试法测试饱和蒸汽以确保适当灭菌消毒
作者：德尔塔 日期：2022-04-13
1.鲍伊-迪克蒸汽渗透测试的起源 最初的鲍伊-迪克测试是由J. Bowie博士和J. Dick开发的，并在1963年的一篇文章中首次进行描述。该测试旨在监测预真空的空气去除效率，以及高压灭菌器的压力脉冲系统，以确保适当的灭菌。 最初的设计是基于29-36条哈克巴克毛巾，每条折叠并堆放到10-11英寸高。然后在毛巾堆的中心贴上一张纸，上面装有圣安德鲁十字形状的化学指示带。一旦准备好，毛巾堆将被放在一个金属敷料箱或类似的容器内。 这个想法是通过测试蒸汽是否能够准确地到达和穿透毛巾，来模拟多孔负载的消毒过程。如果成功，化学指示带将相应地改变颜色，如果不成功，指示带将保持不变。这将表明高压锅内的蒸汽渗透水平是否足以进行消毒。 2.替换鲍伊-迪克测试的原始组件 在20世纪70年代，鲍伊-迪克测试包经历了几种不同的变化，部分原因是由于材料的缺乏。哈克巴克毛巾首先被100%的纯棉手术毛巾所取代，十字图案的指示带被预印的化学指示片所取代。最后，金属匣被无纺布手术包材料所取代。 3.成为鲍伊-迪克测试的参考方法 随着EN285标准的发布，揭示了鲍伊-迪克测试包新修订的定义，该标准规定了制造大于60L的灭菌器的测试程序和验收标准。现在，温度测量被引入测试包的外部和内部的定义模式，需要热电偶传感器来适当地收集数。EN285中定义的这种新的鲍伊-迪克测试方法，可以更深入地分析灭菌器的蒸汽渗透和空气去除能力。如今，它被用作ISO/EN 11140-4中规定的化学指示器和电子鲍伊-迪克测试系统的合格测试的一般参考方法。 传感器的位置必须遵循EN285第16.1.3节中的定义:• 1个传感器必须放置在调节传感器（参考测量点） • 1个传感器放在测试包上方50毫米处 • 测试包内的5个传感器按以下方式分布: - 3个传感器作为圆形图案放置在中心位置 - 1个传感器放置在中心上方20毫米处 - 1个传感器放置在中心以下10毫米处 通过同时测量所有七个温度，可以形成一个完整的图表，显示每个传感器的 “发展”。从而评估灭菌
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乙酰化修饰蛋白组学技术介绍及案例分享
作者：德尔塔 日期：2022-04-13
蛋白质乙酰化(Acetylation)是蛋白在乙酰基转移酶(或非酶)的催化下，将乙酰基团转移并添加在蛋白赖氨酸残基或蛋白N端上的过程，在调控蛋白质功能、染色质结构和基因表达中起重要作用。 乙酰化修饰主要分为两类：蛋白N端的乙酰化修饰和蛋白赖氨酸上的乙酰化修饰。N端乙酰化修饰大部分发生在真核生物的蛋白上，由N乙酰转移酶(NATs)催化；赖氨酸上的乙酰化修饰是一个可逆的过程，主要由赖氨酸乙酰化酶(KATs)和赖氨酸去乙酰化酶(KDACs)催化。 应用方向 乙酰化修饰与细胞基因表达调控、表观调控、细胞凋亡、细胞代谢、信号转导、蛋白质稳定性等生理过程研究； 乙酰化引起的代谢疾病、代谢紊乱，肿瘤发生等疾病机理研究。 乙酰化生物学意义 调节DNA-蛋白、蛋白-蛋白相互作用； 与其他PTMs发生crosstalk； 调节酶活性； 调控蛋白亚细胞定位。 实验流程 定量乙酰化修饰组学实验流程 技术参数 寄样要求 动物及临床组织标本：200 mg/sample 血清、血浆：500 uL/sample 细胞﹑微生物：1× 108cells/sample 植物嫩叶、嫩芽：10g/sample 植物种子、果实：10g/sample 液氮或-80℃保存 足量干冰运输，避免反复冻融 案例分享 Title(标题):Fungal-induced protein hyperacetylation in maize identified by acetylome profiling 发表期刊:PNAS 影响因子:9.504 技术方法:iTRAQ、乙酰化修饰定量蛋白组 研究内容 赖氨酸乙酰化是一种关键的翻译后修饰，调节一系列生物过程中涉及的多种蛋白质。已知编码乙酰转移酶的病原体效应蛋白可以直接乙酰化宿主蛋白从而改变免疫过程。胭脂虫毒素(HCT),一种由真菌玉米圆斑病菌种1(C. carbonum race 1)产生的组蛋白去乙酰化酶抑制剂,可以增强病原体感染玉米植物的能力。 组蛋白乙酰化状态的改变在宿主-病原体相互作用中起着核心作用。关于HCT如何实际促进毒性的机理仍然未知。因此作者选择hmlA玉米突变株作为
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光强对栅藻叶黄素和β胡萝卜素合成的影响
作者：德尔塔 日期：2022-04-13
藻类光生物学研究案例（二）---光强对栅藻叶黄素和β胡萝卜素合成的影响 2021年，印度化学技术研究所等单位联合在Bioresource Technology发表了Lutein and β-carotene biosynthesis in Scenedesmus sp. SVMIICT1 through differential light intensities，探究了5种光强对栅藻叶黄素和β胡萝卜素合成的影响，结果发现，不同强度白光对栅藻的叶黄素和β胡萝卜素合成有显著影响，在50 µE光强下叶黄素和β胡萝卜素产量较高，最大光量子效率（Fv/Fm）也较好。 研究人员将栅藻培养在MC 1000 8通道藻类培养与在线监测系统中，通过MC 1000设置5种光强（50，250，500，750，1000 µE/m2/s），且在光源常亮条件下连续培养20天，之后测量了叶黄素、β胡萝卜素等色素含量。 同时使用AquaPen手持式藻类荧光测量仪测量了不同光强对光系统的影响，通过对快速荧光动力学OJIP和最大光量子效率Fv/Fm的研究，发现在50 µE光强下，Fv/Fm最大；在750和1000 µE光强下，Fv/Fm降低至0.3左右，OJIP曲线也没有出现任何上升。 参考文献： Kona R, et al. 2021. Lutein and β-carotene biosynthesis in Scenedesmus sp. SVMIICT1 through differential light intensities. Bioresource technology 341. MC1000 多通道藻类培养与在线监测系统由8个100ml藻类培养试管、水浴控温系统、LEDs光源控制系统（每个培养试管均可单独调控）及光密度在线监测系统等组成，在藻类培养与控制实验、梯度对比实验等方面极具优势。 AquaPen手持式藻类荧光测量仪是一款用于快速、精确测量藻类叶绿素荧光参数的手持式荧光仪，同时具备PAM脉冲调制和直接激发（OJIP）测量技术，可以测量几乎所有常用叶绿素荧光参数，功能强大，测量精度高，性价比极高。 易科泰提供藻类光生物学研究全面解决方案: FMT150/MC1000藻类培养与在线监测系统 AquaPen/FL6000藻类叶绿素荧光测量仪 Fluorcam叶绿素荧光/多光谱荧光成像系统 FKM多
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