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MiR-142-3p表达升高与单核细胞来源的树突状细胞在红斑狼疮病中的促炎作用相关

MiR-142-3p表达升高与单核细胞来源的树突状细胞在红斑狼疮病中的促炎作用相关

作者:德尔塔 日期:2022-04-21

树突细胞来源miRNA在红斑狼疮疾病中的重要作用 研究背景 系统性红斑狼疮(SLE)是一种复杂的自身免疫性疾病,其发病机制目前还不是很清晰。树突细胞(DCs)在免疫系统中扮演着重要的角色,与SLE的发生关系密切。来自复旦大学附属华山医院的研究人员,以树突细胞为研究对象,深入探究了miRNA在SLE疾病中的重要作用。 研究思路 研究结果 1、moDCs在SLE中的促炎症功能鉴定 产生细胞因子是DC细胞的重要功能之一,我们首先分析了SLE病人和正常人来源的单核细胞源DCs(moDCs)分泌的细胞因子和趋化因子。结果显示,在病人的moDCs中,IL-6,CCL2和CCL5表达显著升高。同时,Transwell assay也显示,moDCs培养细胞上清中富含更多的CD4+T细胞。因此,通过第一部分的实验,我们发现了SLE病人DC细胞中异常表达的炎症因子表达。 2、moDCs中的miRNA表达模式分析 由于miRNAs在DCs功能发挥中的重要作用。因此,我们通过miRNA表达谱芯片,分析了SLE病人和正常人的培养moDCs的miRNA表达模式。结果显示,一共有18个miRNAs在SLE中异常表达,其中,有8个上调,10个下调。 通过对miRNA预测靶基因的功能和通路分析,我们对富集到重要功能的7个miRNA (miR-142-3p, miR-630, miR-671-5p, miR-15b-5p, miR-181b-5p, miR-125a-5p和 miR-5703)进行了进一步的分析。针对15个病人和15个健康人样本的qRT-PCR验证,我们发现miR-142-3p, miR-630, miR-15b-5p, miR-181b-5p, miR-125a-5p, and miR-5703的表达与芯片结果一致。 在这些miRNA中,我们对miR-142-3p格外关注,因为有研究发现它是血液干细胞和造血干细胞的形成中有重要作用,且对CD8+ T细胞增殖和巨噬细胞组成由重要作用。对miR-142-3p的靶基因功能富集也显示,主要参与细胞因子和趋化因子调控。因此,miR-142-3p很有可能在SLE中有重要的免疫调控作用,我们把miR-142-3p作为后期功能验证的重点。 3、miR-142-3p生物学功能研究 那么,miR-142-3p在moDCs中扮演了什么样的角色呢?我们运用

新的PPR蛋白dek2影响线粒体内含子1的剪切和线粒体功能以及玉米籽粒的发育

新的PPR蛋白dek2影响线粒体内含子1的剪切和线粒体功能以及玉米籽粒的发育

作者:德尔塔 日期:2022-04-21

伯豪客户农林RNA测序助力玉米籽粒dek突变体研究 2017年1月1日遗传学期刊Genetics(影响因子4.6)在线发表了上海大学生命科学学院祁巍巍老师的有关玉米突变体基因克隆与功能分析新文章,题为:Mitochondrial function and maize kernel development requires Dek2, a pentatricopeptide repeat protein involved in nad1 mRNA splicing。 在开花类的植物中,很多和呼吸相关的蛋白都是受到了线粒体基因组编码基因以及细胞核编码基因协同调控。三角状五肽重复区(Pentatricopeptide repeat,PPR) 蛋白已经有报道其参与了RNA与蛋白质之间的相互作用。玉米籽粒突变体defective kernel 2 (dek2) 是一个典型的小籽粒以及发育迟缓的突变体。图位克隆以及等位测试确认dek2编码了一个新的线粒体中的P-type PPR蛋白。线粒体转录本分析表明dek2突变体引起了线粒体内nad1内含子1的剪切效率下降。dek2未成熟籽粒线粒体复合物分析表明复合物1显著缺失。转录组测序与透射电镜观察发现,由于AOXs蛋白的高表达,nad1适当的剪切对线粒体功能以及线粒体的内嵴至关重要。在该研究中,研究人员发现dek2是一个新的PPR蛋白,其影响线粒体nad1内含子1的剪切并且对于线粒体功能以及籽粒发育至关重要。 研究思路 研究结果 dek2影响籽粒正常发育 研究人员从玉米种质中心获取dek2的突变体并且对其与W22杂交,使其背景纯化,以利于表型观察。在对其表观以及细胞层面上的观察发现,dek2的突变体籽粒和野生型相比,显著变小,百粒重只有野生型32%,总蛋白含量下降4%,醇溶蛋白下降21%,非醇溶蛋白含量上升38%,淀粉粒体积显著减小,并且籽粒胚乳糊粉层发育受到显著抑制(图1,2)。 dek2的图位克隆 为了对dek2进行基因定位,研究人员使用了图位克隆的方法。经过对438粒突变体籽粒的初定位以及3358粒籽粒的精细定位发现,GRMZM2G110851的单碱基SNP导致了该表型的产生(图3)。 dek2编码了一个P-type PPR蛋白 GRMZM2G110851在基因组上含有1893个

EBV所转录的miRNA BART1通过影响重要抑癌基因PTEN而促进鼻咽癌细胞的侵袭转移

EBV所转录的miRNA BART1通过影响重要抑癌基因PTEN而促进鼻咽癌细胞的侵袭转移

作者:德尔塔 日期:2022-04-21

Nature子刊揭示鼻咽癌转移新机制 鼻咽癌(Nasopharyngeal carcinoma, NPC)是我国华南地区常见的恶性肿瘤之一,主要发生于鼻咽腔顶部和侧壁,长期以来发病率一直为耳鼻咽喉恶性肿瘤之首。我国每年鼻咽癌的新发病例达2.8万例,其中广东地区鼻咽癌发病率占全国60%,死亡率超过5/10万,因此被称“广东瘤”。 目前认为鼻咽癌的发生与EB病毒(Epstein-Barr Virus, EBV )感染关系密切,其中95%以上的未分化型鼻咽癌组织中均可检出该病毒的感染,因此,EB病毒及其编码的miRNAs在鼻咽癌中的作用及机制一直是鼻咽癌研究的重点。 南方医科大学蔡隆梅博士在其导师李欣教授的指导下研究发现EBV编码的microRNA BART1(EBV-miR-BART1-3p)在鼻咽癌组织表达量明显增高(图1a),并且通过直接靶向肿瘤抑制基因PTEN而调控其依赖的多条信号通路(PI3K-Akt、FAK-p130Cas和Shc-MAPK/ERK1/2)诱导鼻咽上皮细胞发生间充质转化(EMT) (图1b),由此促进鼻咽癌细胞侵袭和转移,相关研究结果发表在《Nature Communications》(2016 IF:11.3)杂志上。 图1.芯片发现EBV-miR-BART1在鼻咽癌组织中明显高表达,并且调控多条信号通路促进鼻咽癌转移 蔡隆梅博士跟笔者分享了在进行此项研究的时候遇到的一些难题及趣事。蔡博士首先利用上海吉凯基因化学技术有限公司提供的慢病毒构建稳定过表达EBV-miR-BART1的鼻咽癌细胞株,体外实验进行的较为顺利。但是利用稳转细胞株进行动物实验(裸鼠肝包膜注射)可谓是遇到不小的挑战,如何将稳转细胞准确无误的注入裸属肝包膜下成为一个技术难点。 经过多次不懈的努力尝试,蔡隆梅博士终于顺利完成了实验(图2),并且形成了自己的裸鼠肝包膜实验方法,简称“蔡式”法。现分享如下:①固定:Pelltobarbitalum Natricum(100uL/10g)腹腔注射麻醉裸鼠,将裸鼠固定在泡沫板上。②消毒:酒精棉球、碘伏棉球分别消毒一次裸鼠胸腹腔皮肤。③注射:将 50ul 细胞悬液吸入注射器中,用注射器轻轻在肝左叶表面 10°进针至肝包膜

孢子捕捉仪的分类及在小麦条锈病的监测和预警上的作用

孢子捕捉仪的分类及在小麦条锈病的监测和预警上的作用

作者:德尔塔 日期:2022-04-21

孢子捕捉仪是当前农业植保部门用于农作物病害监测的一种专用设备,属于测报仪器,其主要的作用也就是用于捕捉那些随空气流动、传染的病害病原菌孢子及花粉尘粒等,目的就是通过监测病害孢子存量及其扩散动态,来预测和预防病害流行、传染等,是目前应用于农业领域中的新型测报仪器。就孢子捕捉仪的工作方式来看,它主要可以分为以下三大类。 1.车载式孢子捕捉仪:该仪器可放在自行车、摩托车、工具车等运动的载体上,便于流动监测孢子。 2.固定式孢子捕捉仪:该种仪器可以固定在测报区域内,定点观察特定区域孢子种类及数量。 3.便携式孢子捕捉仪:该仪器体积小、可手持、方便移动,可以随时随地监测所到区域的孢子。 这三种类型的孢子捕捉仪,可以独立使用,也可以配合使用,与固定式孢子捕捉仪不同,车载式孢子捕捉仪和便携式孢子捕捉仪可以不受地域的限制,因此使用上会比较灵活,而固定式孢子捕捉仪常用于监测固定区域的病害病原菌孢子数量等。 虽然在工作方式上,它们会有所区别,但是在功能和作用上确实统一的,孢子捕捉仪的主要用处有三大块,其一是测试区域空气中的飘浮物;其二是在孢子防、治领域,为进行病理研究提供可靠的数据;其三是收集各种花粉,以满足应用单位的研究需要。而近年来通过它的应用,也确实对植物病害的防治等方面有显著的效果。 孢子捕捉仪在小麦条锈病的监测和预警上的作用 在植保工作中,为了提高农业病害防治水平,进行科学防治病害,维护种植户的利益,很多地区都是采用孢子捕捉仪等来完成植物病害的监测和预警。 以小麦种植为例,在我国很多的地区,条锈病菌会导致小麦条锈病的发生,给小麦的生产造成了不小的损失。近年来,为了加强小麦条锈病的监测和预警,很多地区都是利用孢子捕捉仪来监测条锈病菌孢子量。 目前进行小麦条锈病防治的最有效的方式,就是利用孢子捕捉仪来搞好小麦大田普查,依据“带药侦查,发现一点,控制一片”的防控策略,对发现的病点和发病中心及其周围实

粘虫板“色诱”治虫的应用原理及使用方法

粘虫板“色诱”治虫的应用原理及使用方法

作者:德尔塔 日期:2022-04-21

昆虫在长期的进化过程中产生了对色彩的趋性,该趋性是通过其视觉器官中的感光细胞对光波产生感应而作出的趋向反应,也称为“色觉”,从本质上讲是一种趋光性。昆虫对光的感应多偏于电磁波广谱中央附近的短光波,波长为253——700(纳米),即相当于光谱中的紫外光至红外光内线部分的区域,也就是说他们既能识别色彩,也能看到人眼不能直接视觉到的短光波。昆虫对色彩的趋性分为正负性,趋向色彩的为正趋色彩性,避开色彩为负趋色彩性。各种昆虫对色彩的趋性有特定的选择和爱好,且不同性别和发育阶段均可有差异。 昆虫种类不同,他们的趋色性则不同,在农业生产实践中,植物保护科研人员利用昆虫的趋色性,制成有色粘虫板来诱捕危害农作物的害虫。如蚜虫、粉虱、叶蝉、潜叶蝇等昆虫对黄色有较强的趋性而制成黄色粘虫板;蓟马则对蓝色有较强的趋性而制成蓝色粘虫板,诱捕“好色”飞行昆虫或一些爬行“好色”昆虫,这就是我们通常说的黄蓝板“色诱”技术。另外根据蚜虫对银灰等色彩的负趋向性,设置银灰色塑料薄膜、铝箔、黑色塑料薄膜或向棉地喷洒大白粉乳液等可以起到避蚜作用。粘虫板“色诱”技术是农业部门近几年来主推的绿色防控技术之一。 一、粘虫板“色诱”害虫种类 云飞粘虫板分黄、绿、红、蓝、白、黑、紫、青、粉、灰十种颜色1、打开即用,使用方便2、特殊色谱,双面诱捕,防治效果显著。3、特定板质,平整不卷曲,防水高粘度胶,抗晒、耐雨淋,高温不老化,持久耐用。在温度10℃——70℃的环境中基板无明显变形,胶体不流化,遇水不溶解。在使用中,色泽一致,在强烈阳光照射下向光面与背光面无明显色差。粘虫板材质:PP材料,具有一定的强度、硬度、耐湿,双面涂胶、板面不卷曲,无毒环保、价格实惠耐用。 粘虫板所粘害虫主要有同翅目、双翅目、缨翅目等小型昆虫,还有极少的半翅目、鞘翅目、膜翅目等昆虫。根据不同作物进行如下分类: 蔬菜:同翅目白粉虱、蚜虫、叶蝉、飞虱等;双翅目斑潜蝇、实蝇、果蝇、寄生蝇、各种瘿蚊

孢子捕捉仪可以检测哪些病害及如何预防病害的发生?

孢子捕捉仪可以检测哪些病害及如何预防病害的发生?

作者:德尔塔 日期:2022-04-21

孢子捕捉仪可以检测哪些病害? 作物在生长过程中,也会“生病”,是的,就像人一样,病的程度有不同,作物一旦“生病”,作物会生长缓慢生长会停止生长,其品质也会下降,普通人想到作物生病,第一反应就是各种各样的害虫,如螨类、蜗牛、鼠类等,但是危害作物生长的还有病害,如如枯萎、腐烂、斑点、霉粉等,如果不加以防治,作物品质就得不到保证,这些病虫害不仅会对农业造成破坏,也会对农业、牧业造成不良影响。病害暴发起来造成的不良后果往往比虫害要大,所谓病害,指的就是病菌的侵害,除了使用虫情测报灯来进行虫情测报之外,因为大部分作物病害都是由于病源孢子引起的,所以还需要使用孢子捕捉仪来对田间的有害孢子进行监测,那很多人会问,孢子捕捉仪都到底可以检测哪些病情,且等我一一道来。 孢子捕捉仪的功能非常强大,可以准确检测、捕捉空气中的病源孢子,利用单向逆流气旋新技术,由机体内置涡轮泵将空气垂直抽取出来,使孢子采集不受气流影响,把孢子从气流中分离,粘负于载玻片上,然后再应用显微镜进行观测。前面说了大部分作物病害都是由于病源孢子引起的,所以至于孢子捕捉仪都到底可以检测哪些病情就很容易想到了,一句话解释:只要是由于病源孢子所引起的都可以使用孢子捕捉仪检测,如疫病、锈果病、腐病、菌核病、叶斑病、疮痂病、立枯病等等,种类有成千上万种。 使用孢子捕捉仪检测出了某种作物到底是什么病害,接下来的防治工作就简单了,这样就更加有针对性,工作量降低了,工作效率和准确性却大大提高,病害的预测和预防工作都能顺利开展。孢子捕捉仪对于及时预防植物病虫害有意义重大。 孢子捕捉仪如何预测病害的发生情况?   在农业中,通过使用孢子捕捉仪捕捉孢子,可以预测病害的发生情况,因为孢子是病害传染的主要媒介,捕捉孢子可以一定程度上病害带来的农业经济损失,捕捉孢子也是现代病虫害预测预警中重要的一项工作。所以孢子捕捉仪是一款重要的植保仪器云飞科技就有一款孢子捕

常用微生物培养基配方大全

常用微生物培养基配方大全

作者:德尔塔 日期:2022-04-21

(1)分离细菌时,在培养基中加入浓度为50U/ml制霉菌素,可以抑制霉菌和酵母菌的生长。 (2)分离放线菌时,在样品中加入0.05%十二烷基磺酸钠(SDS)不仅可以抑制细菌的生长,还能激活放线菌孢子的萌发。加入氟哌酸(5mg/L)+制霉菌素(50mg/L)+青霉素(0.8mg/L)也可以有效地抑制细菌和真菌,而不影响放线菌的生长。 (3)分离霉菌和酵母菌时,在培养基中加入青霉素、链霉素和四环素各30U/ml,可以抑制细菌和放线菌生长。 (4)分离根霉和毛霉时,由于这些微生物的菌丝易蔓延成片,难以得到纯化的菌落,通常在培养基中添加0.1%去氧胆酸钠或山梨醇防止菌丝蔓延,使菌落长得小而紧密。   一般用于分离单一目的微生物的培养基中均含有抑制其他微生物的抑制剂,这些专用的抑制剂在小型实验室配制较麻烦,现已有成品供应,只要直接加入基础培养基即可。如氨苄西林,主要用于分离亲水气单孢菌。 1、细菌培养基 配方一 牛肉膏琼脂培养基 牛肉膏0.3克 ,蛋白胨1.0克,氯化钠 0.5克,琼脂 1.5克, 水 1000毫升 在烧杯内加水100毫升,放入牛肉膏、蛋白胨和氯化钠,用蜡笔在烧杯外作上记号后,放在火上加热。待烧杯内各组分溶解后,加入琼脂,不断搅拌以免粘底。等琼脂完全溶解后补足失水,用10%盐酸或10%的氢氧化钠调整pH值到7.2~7.6,分装在各个试管里,加棉花塞,用高压蒸汽灭菌30分钟。 配方二 马铃薯培养基 取新鲜牛心(除去脂肪和血管)250克,用刀细细剁成肉末后,加入500毫升蒸馏水和5克蛋白胨。在烧杯上做好记号,煮沸,转用文火炖2小时。过滤,滤出的肉末干燥处理,滤液pH值调到7.5左右。每支试管内加入10毫升肉汤和少量碎末状的干牛心,灭菌,备用。 配方四 根瘤菌培养基 葡萄糖 10克 磷酸氢二钾 0.5克 碳酸钙 3克 硫酸镁 0.2克 酵母粉 0.4克 琼脂 20克 水 1000毫升 1%结晶紫溶液 1毫升 先把琼脂加水煮沸溶解,然后分别加入其他组分,搅拌使溶解后,分装,灭菌,备用。   2、放线菌培养基 配方一 淀粉琼脂培养

社会失败应激致抑郁样行为动物模型的研究

社会失败应激致抑郁样行为动物模型的研究

作者:德尔塔 日期:2022-04-21

社会失败应激致抑郁样行为动物模型的研究 摘要: 目的探讨社会失贬应激抑郁模型建立的可行性及有效性。 方法连续给予C57BL/6小鼠社会失败心理应激21 d,应激结束24 h后依次通过社会交互实脸、开场实脸、糖水偏爱实脸等评价手段,对小鼠进行抑郁行为评价。结果与对照组相比,社会失效应激导致C57BL/6小鼠出现显著焦虑样行为,而仅有50% -60%的社会失败应激小鼠出现社会逃避及兴趣缺失的抑郁样行为,表现为应激易感。其他应激小鼠评价结果与时照组无差异,未出现抑郁样行为,表现出应激杭性。结论通过社会失致应激,为建立一种新的抑郁动物模型提供了实脸依据。 关键词:社会失败;易感表型;抑郁;模型;动物;应激;杭抑郁药 抑郁症是个体遗传素质与生存环境共同作用所导致的慢性多因性精神疾病之一,全球发病率高达20%,具有高复发率特征。患者不但生活质量受到严重影响,还可能导致自杀等极端行为,给社会带来巨大的医疗和经济负担。目前,对抑郁症的病理生理机制还了解甚少。生活中应激事件作为诱发抑郁症的重要原因之一是公认的事实。然而,群体中大部分个体在遭遇不幸或者重大应激事件后,仍然能保持正常的心理和认知功能,对应激表现出回复性,并不诱发抑郁症。从这个角度上来看,研究个体本身对应激抗性的分子和细胞机制,可能为亟待阐明的抑郁症和抗抑郁作用病理生理学提供重要途径和思路。目前,国内外对于应激抗性的分子机制研究相对较少,其中原因之一就在于当前通常采用的抑郁动物模型具有一定的局限性。 本研究中,通过对C57BL/6小鼠施加社会失败心理应激并经行为学评估,可将应激群体筛分为应激易感和非易感两个亚群。在应激易感亚群中,小鼠出现显著社会逃避和兴趣缺失的抑郁样行为,同时伴有显著焦虑行为;在应激非易感亚群中,小鼠仅出现显著焦虑行为,并没有出现社会逃避和兴趣缺失的抑郁样行为,行为上表现出显著应激抗性。究竟是何种原因导致相同应激所产生的行为水平的差异还有待深入探讨。近来

STAT1有助于通过调节脊髓小胶质细胞内MHC II表达缓解骨癌疼痛

STAT1有助于通过调节脊髓小胶质细胞内MHC II表达缓解骨癌疼痛

作者:德尔塔 日期:2022-04-21

骨癌痛新机制待你考证,艾美捷助力推荐研究工具 俗话说,牙痛不是病,痛起来要人命。医学上定义疼痛(pain)是一种复杂的生理心理活动,是临床上最常见的症状之一。它包括伤害性刺激作用于机体所引起的痛感觉,以及机体对伤害性刺激的痛反应(躯体运动性反应和/或内脏植物性反应,常伴随有强烈的情绪色彩)。痛觉可作为机体受到伤害的一种警告,引起机体一系列防御性保护反应。但另一方面,疼痛作为报警也有其局限性(如癌症等出现疼痛时)。 今年2月,Brain, Behavior, and Immunity杂志出版了华中科技大学同济医学院田玉科教授课题组名为STAT1 as a downstream mediator of ERK signaling contributes to bone cancer pain by regulating MHC II expression in spinal microglia的文章,该文章阐述了骨癌痛的相关机制。 许多恶性肿瘤会导致严重的癌症诱导的骨痛,而骨癌痛的机制目前人不是很清楚,这使得对骨癌痛(bone cancer pain, BCP)的**也不是很理想。许多关于脊髓背小神经胶质细胞的影响的研究表明MHC II可能是慢性神经性疼痛和自身免疫性疾病中的关键分子,因此,作者认为调节脊髓小胶质细胞中MHC II的表达以抑制适应不良的神经免疫反应可能是疼痛缓解的潜在**策略。因此,作者研究了MHC II在BCP中的作用。 在作者2015年的研究中发现,ERK信号通路参与了BCP的发病机制,而已有研究表明ERK信号通路的激活加强STAT1磷酸化。有意思的是,STAT1信号通路是通过调节II类反式激活因子(CIITA)的表达的MHC II表达的关键调节剂。因为,作者在研究中特别的分析了在调节MHC II表达的信号通路中,ERK和STAT1之间的关系。 作者通过大鼠BCP模型展开研究,从多方面入手阐述BCP的机制。对BCP模型进行的放射性研究显示,在同侧胫骨(红色箭头)的近端骨会出现时间依赖性溶骨性破坏的迹象,一些癌细胞也在第21天从胫骨腔迁移出并损伤外周软组织。 而HE染色切片显示正常骨髓细胞被接种的Walker 256癌细胞代替,并且健康的骨结构从第14天

基因芯片与RNA-seq的比较分析

基因芯片与RNA-seq的比较分析

作者:德尔塔 日期:2022-04-21

基因芯片 vs RNA-seq哪个好 ? 最近几年二代测序(又叫NGS)很火,而且价格越来越便宜,原来都用芯片检测mRNA、miRNA、LncRNA表达量的,好像不少都换用RNA-seq了。那么,到底选择哪种更好呢?今天就来回答下这个问题。一句话—— 看研究目的。 常见误区一: 测序的准确性高,获得的信息更丰富 对,但又不对。  首先,大家需要明确,检测到和准确分析基因表达量的概念是不同的,只有mapping到基因上的reads达到一定数量,才能得到相对准确的分析结果。因此RNA-Seq能检测到多少可靠的信息完全取决于测序深度,测序深度,测序深度!不同于芯片的杂交法,RNA-seq是通过读数来检测,读数多(即测序深度深)代表着RNA-seq的采样率高。采样率低了准确度自然就低了。 那么有没有一个实验能说明芯片和RNA-seq之间数据准确度的差异呢? 发表在PNAS上面的这篇文章就帮大家做了一个对比(PNAS 2011, 108(9):3707-3712.)。图中绿色点/黑色线是测序得到的数据,红色点/红色线是芯片得到的数据。在~50M reads数据量的情况下,当基因表达丰度较高时(横坐标RPKM较大时),两者之间的数据质量都是非常好的(纵坐标CoV即变异系数越小,数据质量越高),但当基因表达丰度变低时(横坐标RPKM较小时),RNA-seq的数据质量就急剧下降了,而芯片则仍然维持着高水准。这篇文章得到的结论是:~80%以上的基因,RNA-seq的数据质量/可信度都低于芯片。市场上最流行的的6G数据量的RNA-seq,其实就是40M reads或者20M paired reads,对于研究高表达丰度的基因来说,差不多是够用了。但是对于中、低表达丰度转录本就不够用了。 常见误区二: RNA-seq可以同时检测已知和未知基因,基因芯片只能检测已知基因,这是一个巨大的局限。 首先,这个观点的一个潜在假设是,每次测序都能够发现一些未知分子。但对于人、大鼠、小鼠以及其他一些模式生物,该发现的基因基本上都已经发现完了。因此基因是否已知,在很多情况下并非重点,重点在于该基因在您

肉灌肠中亚硝酸盐的检测方案

肉灌肠中亚硝酸盐的检测方案

作者:德尔塔 日期:2022-04-21

一、概述 亚硝酸盐在肉类制品中作为发色剂限量使用,让肉制品看起来红红的好看,但是人类食入0.3~0.5克的亚硝酸盐即可引起中毒甚至死亡。由亚硝酸盐引起食物中毒的机率较高,中毒事件也经常发生。 肉灌肠中亚硝酸盐检测可以用离子色谱法和分光光度法,本文主要说明分光光度法。 二、方案介绍 1、测定标准及方法 GB 5009.33-2016,分光光度法 2、所需仪器及试剂 722S可见分光光度计、十分之一电子天平、电炉、水浴锅、常用玻璃仪器等, 饱和硼砂溶液、亚铁氰化钾溶液、乙酸锌溶液、亚硝酸钠标准使用液、氨基苯磺酸溶液、盐酸萘乙二胺溶液等。 3、实验步骤 试样经沉淀蛋白质、除去脂肪后,在弱酸条件下亚硝酸盐与对氨基苯磺酸重氮化后,再与盐酸萘乙二胺偶合形成紫红色染料,外标法测得亚硝酸盐含量。具体如下: (1)前期准备 用烧杯盛水并用电炉加热至沸腾,备用(制备70度左右的水); 水浴锅打开电源,让水沸腾,备用; 取出肉灌肠切开,并剁碎,用电子天平称取5g试样置于500 mL容量瓶中,加12.5 mL 饱和硼砂溶液,搅拌均匀,加入70℃左右的水约300 mL,于沸水浴中加热 15 min,取出置冷水浴中冷却,并放置至室温。 (2)提取净化 往样品瓶中加入5 mL 亚铁氰化钾溶液,摇匀,再加入 5 mL 乙酸锌溶液,混匀并振荡提取液,加水至刻度,摇匀,放置30 min,除去上层脂肪,上清液用滤纸过滤,弃去初滤液30mL,滤液备用。 (3)样品测定 吸取40.0 mL 上述滤液于50 mL 带塞比色管中,另吸取0.00 mL、0.20 mL、0.40 mL、0.60 mL、0.80mL、1.00 mL、1.50 mL、2.00 mL、2.50 mL 亚硝酸钠标准使用液(相当于0.0μg、1.0μg、2.0 μg、3.0 μg、4.0 μg、5.0 μg、7.5 μg、10.0 μg、12.5 μg亚硝酸钠),分别置于50 mL 带塞比色管中。 于标准管与试样管中分别加入2 mL 对氨基苯磺酸溶液,混匀,静置3 min~5 min 后各加入1 mL盐酸萘乙二胺溶液,加水至刻度,混匀,静置15 min,用2 cm 比色杯,以零管调节零点

中药检测项目有哪些?

中药检测项目有哪些?

作者:德尔塔 日期:2022-04-21

中药包括中药材、中药饮片和中成药,我国药典规定,加强对重金属及有害元素、毒性成分、残留溶剂、真菌毒素及生物安全等检测。中药的检测项目有很多,主要有化学、物理、微生物等方面,检测项目的完备有助于中药的质量保证。本文主要介绍中药化学成分的分析以及微生物检测项目。 一、中药化学成分分析 1、指标性成分定量分析 如多糖、皂苷、儿茶素、三萜类等。 2、马兜铃酸 3、黄曲霉毒素(Aflatoxin B1、B2、G1、G2)、赭曲霉毒素及霉菌毒素等 4、防腐剂(苯甲酸、己二烯酸、去水醋酸)等 5、硫磺(二氧化硫,SO2)及其他漂白剂等 6、矿物质及重金属 ♦人体必须矿物质:钠(Na)、钾(K)、钙(Ca)、镁(Mg)、铁(Fe)、锌(Zn)、磷(P)等 ♦有害重金属分析:砷(As)、铅(Pb)、镉(Cd)、汞(Hg)、铜(Cu)等 7、农药残留 ♦定性分析:有机磷、胺基甲酸盐 ♦定量分析:有机磷、胺基甲酸盐、有机氯 8、类固醇、激素 9、抗生素残留 10、含水量、水溶性浸出物含量、醇溶性浸出物含量、酸不溶性灰份、总灰分、精油含量等。 二、中药微生物检测项目 各种口服药剂、一般外用药剂以及中草药属于非规定无菌之药品,故污染微生物之机会较多,这些药品都必须进行微生物之检验及监控。检验项目包括: 1、规定无菌的药品 ♦无菌试验 ♦抑细菌性及抑真菌性确效试验 2、非规定无菌之药品及中药材(微生物限量试验) 菌落总数、霉菌、酵母菌、大肠菌群、真菌、梭状芽孢杆菌、肠杆菌/革兰氏阴性菌 三、常用中药哪些检验项目经常不合格 1、红花经常染色,一般染色金橙里面会混一些黄沙 2、金银花混有山银花 3、酸枣仁中掺有理枣仁 4、海金沙掺有沙子,用显微镜很容易鉴别出 5、地龙经常总灰分、酸不溶性灰分不合格 6、天竺黄体积比经常不合格 7、川贝母经常掺有小平贝母 8、白芍、白及、黄精经常二氧化硫超标 9、钩藤经常有不带钩的杆子多,而且有很多黑色的钩藤,属于死了的钩藤 四、中药有害物质的检查中必须要检测的项目有哪些 中

实验室仪器设备采购管理规定

实验室仪器设备采购管理规定

作者:德尔塔 日期:2022-04-21

概述 实验室采购的东西很多,包括检测设备、仪器硬件、软件、流程性材料(即与检测有关的试剂和消耗材料)和服务以及他们的组合。 为了确保采购过程处于受控状态,保证所采购的产品满足规定的质量要求。因此制定相应的采购管理规定很重要。 一般采购管理需要有相关人员负责,首先是实验室相关部门负责采购的提出,实验室技术负责人负责供应商的评价及采购文件的审核,办公室负责供应商的调查及采购的实施,然后实验室主任或者第一负责人负责采购的批准,进料由相关检测室负责检验。 一、供应商的选择 选择和购买重要的消耗品、供应品,通过ISO9001认证的供应商应优先考虑。检测设备则需有CMA标志。 对提供影响检测质量的重要消耗品和计量服务的供应商,需由办公室负责人对其进行调查,并将调查结果记录于《供应商评价表》,经技术负责人评价后,由主任决定是否列为合格供应商。 供应商评价包括以下内容: 1、被提名供应商的资信能力; 2、供应商的供货业绩; 3、供应商的质量保证能力; 4、价格;交货情况;服务情况等。 对于提供计量服务的供应商除须进行评价外,还应符合以下要求: 1、资格:该项目已通过国家实验室认可或有计量授权。 2、测量能力:其测量不确定度满足校准链的规定要求。 3、溯源性:测量结果能溯源到国际或国家基准。 办公室负责人将合格的供应商登录于《供应商一览表》。 二、采购流程 购买实验室分析仪器或其他供应品时,由相关部门负责人填写《委托采购申请表》,并交技术负责人对其内容进行审核,报主任批准后由办公室负责执行。 1、询价和比价 办公室负责人应向合格供应商询价,比价时要求两家以上的供应商提供价格,选择品质、成本、交货日期及售后服务等符合本单位要求的供应商。若供应品和技术独占市场则不在此限之内。 2、订购 当办公室负责人采购对检测结果有影响的物品或设备时,需向供应商清楚、详细地描述技术要求,包括型式、类别、等级、规格、数量、图纸等信

色谱基础理论平均速度与速度方程的介绍

色谱基础理论平均速度与速度方程的介绍

作者:德尔塔 日期:2022-04-21

一、平均速度 色谱又称色层法或层析法,是一种物理化学分析方法,它利用不同溶质(样品)与固定相和流动相之间的作用力(分配、吸附、离子交换等)的差别,当两相做相对移动时,各溶质在两相间进行多次平衡,使各溶质达到相互分离。 也就是说,当样品中某组分进入色谱柱内,将在固定相和流动相中达到一定的分配。流动相总是以一定的速度流动,而固定相则固定不动。那么在流动相中的组分分子将以流动相流速u向前行进,而固定相中的组分分子则和固定相一起停留不动。那么这个组分,它的平均运动速度是多少呢? 组分能够在色谱柱上得到分离,就是说他们在色谱柱上的流出时间不同。我们知道流出时间t = 色谱柱长度L / 组分平均运动速度v。色谱柱长度L对所有组分都是一样的,那么之所以能够被分开,关键就在于不同组分,他们的平均运动速度不同。为什么相同载气条件下,不同组分平均运动速度会不同?这就说出了色谱分离的内因:不同组分在固定相和流动相之间的分配系数K不相同。那么什么是色谱分离的外因?当然是存在流动相与固定相之间的相对运动。 由于不同组分的分配系数K不同,因此平衡状态下,在固定相和流动相中的分子个数比就出现了差异,平均移动速度因此出现了差异,于是他们从色谱柱中流出的时间也就出现了差异了。 由于色谱分离靠的是不同的分配系数,因此我们说色谱分离方法是一种物理分离方法。 二、速度方程 色谱法能够分离不同组分的内因是分配系数K的差异。 什么是分配系数呢?分配系数是物质在两相之间达到平衡时,在两相中浓度的比值。两相之间,并不是专指气体、液体、固体之间呢,我们用汽油萃取水中的碘,水和汽油都是液相,但由于并不混溶,因此也是两相。分配系数是一个重要物理化学参数,与组分在两相中的溶解度密切相关,影响因素除了组分和两相的组成外,还包括温度、压力等。这个压力并不是外界压力,而是组分的分压。在理想气体情况下,其他气体分子的压力对组分在两相中的平衡没有影响。

锐博生物:Genome Research丨lncRNA在精子发生过程中的关键作用

锐博生物:Genome Research丨lncRNA在精子发生过程中的关键作用

作者:德尔塔 日期:2022-04-21

Genome Research丨lncRNA在精子发生过程中发挥重要作用 一直被很多科学家认为是真核生物基因组进化中“垃圾”信息的非编码RNA(ncRNA),既不编码蛋白质,又缺乏生物学功能的遗传学证据,近几年得到了“平反”,越来越多的研究表明ncRNA 在剂量补偿效应(Dosage compensationeffect)、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用,成为遗传学研究热点。 随着高通量测序技术发展,越来越多的lncRNA被证明在睾丸和脑组织中呈现高度特异性表达,这暗示着在精子发生与神经调控两个基础生命学过程中,lncRNA的功能机制具有代表性。  清华大学高冠军实验室于2016年9月1号在Genome Research正式刊发题为《Critical roles of long noncoding RNAs in Drosophila spermatogenesis》的文章。此文章详细阐述了lncRNA在精子发生过程中的重要作用,为揭示“暗物质lncRNA”具有重要生物学功能提供了大量的遗传学证据。 高冠军研究小组选择基因强净化的模式生物果蝇为代表,通过高通量遗传动物模型的建立,鉴定了128个睾丸特异性表达的lncRNA。然后运用优化后的CRISPR技术建立了105个lncRNA基因敲除体。通过观察并分析雄性果蝇精子发生、发育、活力等,发现近1/3的lncRNA基因的缺失会导致精子发育异常甚至完全不育。 图1 剔除研究的睾丸特异性lncRNA的鉴定和选择的流程图。使用生物信息学和在FlyBase中注释的lncRNA的分析的新型lncRNA组合以构建lncRNA起始库。然后,通过睾丸特异性表达筛选和RNA原位杂交,选择128种睾丸特异性lncRNA候选物用于靶向敲除。这些lncRNA位于三个不同的染色体上,包括染色体2的左臂和右臂,染色体3的左臂和右臂和染色体X。 图2 lncRNA突变体导致雄性特异性生育缺陷。 (A)105个lncRNA突变体的生育概况。 (B)删除lncRNA CR44455 / 6导致雄性不育,而CR44455 / 6 - / - 雌性完全能育。 (C)对CR42858 - / - 的雄性和雌性突变果蝇进行定性生育力测定。 删除CR42858大大降低了