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基于CNN的语义分割应用于沟槽轮廓图像以研究作物根系分布情况
作者：德尔塔 日期：2022-04-14
由于土壤中的养分和水分分布不均，影响作物生长和产量的根系体系是土壤根系分布的重要组成部分。耕地中的养分分布取决于耕地面积，耕作方法和施肥系统。为此，根系分布受耕作和施肥影响。 现代农业通常使用高输入设备，使位于地表附近的耕层土壤变得十分肥沃。因此，浅根作物能够较好地吸收养分，促进生长。而在干旱条件下，深根作物在缺少养分和水分的耕地中通过避免养分和水分的缺乏而表现得更好。因此，根的分布受环境条件和栽培技术的影响。 以适合农场的根分布品种为目标进行育种可以提高产量。育种的成功取决于如何在自然和人工种群中使用适合的表型方法找到有效的遗传资源。然而，当下很难培育出理想的根系分布新品种，因为用于田间根系分配的表型方法，即筛选可调节根系分布特性的遗传资源所必须的步骤，在有限的技术层面上具有一定的挑战性。 获取根部表型性状的方法大致分为四类：沟槽轮廓法、螺旋钻法、微型根管放疗法和直接挖掘法。沟槽轮廓法是在植物旁挖一个垂直沟来量化作物壁中根系分布的方法，用以观察农作物的垂直和水平根系分布。与其他田间方法相比，能够观察到根系的最大比例，该技术用于研究土壤条件与根系生长的相互作用以及作物根系分布的基本特征。 螺旋钻法是一种采样方法，主要用于量化垂直根分布。使用岩芯采样器，螺旋钻法只能评估狭窄水平面中的根分布。 微型根管放疗法是将透明圆柱体埋入土内，以定期获取根部图像来顺序观察根部发育的技术。该方法的观察区域有限，一般用于估计根生长动态，其中包括根周转率。 直接挖掘法是一种简单的根系采样方法，主要是用铲子挖根。这种方法不适用于研究土壤中的根系分布，主要用于根系分支估计和根锥角计算。尽管这些方法无法观察到整个根系分布，但其中沟槽轮廓法最适合评估土壤中的根系分布，因为其可以同时观察垂直和水平的根系分布。 沟槽轮廓法的步骤包括开沟挖槽、冲洗沟槽轮廓、测量根部长度以及计算根部分布特
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一次RNA甲基化测序的多项成果-云序RNA甲基化测序技术大公开
作者：德尔塔 日期：2022-04-14
文章导读 RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程，目前对m6A RNA修饰的研究已进行的如火如荼，而除了m6A以外仍有多种RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达，其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac4C乙酰化修饰，在这些领域的研究中也不断有高分文章的出现。云序生物是国内RNA修饰测序的领跑者，可针对mRNA和各种非编码RNA提供各类RNA修饰测序服务 (m6A﹑m1A﹑m5C﹑m7G﹑ac4C﹑2’-O-甲基化等)。目前，云序已累计支持客户发表32篇高水平文章，合计影响因子204分，是国内支持发文最多、累计影响因子最高的公司。 近日，云序客户分别在肝癌和胃癌中进行了m6A和m5C RNA甲基化的全转录组测序（circRNA、lncRNA和mRNA），其中在肝癌中进行的m5C测序数据发表了三篇表达谱的文章，实现了一次测序，三套数据，三项成果的“大满贯”；随之在胃癌中进行的m6A测序数据也发表两篇表达谱文章。真正体现了一次测序三套数据（circRNA、lncRNA和mRNA），多项成果，超高性价比，短平快发表高分文章。这里我们收集整理了这5篇云序生物提供服务的甲基化测序研究的文章，带领大家掌握常规性表达谱分析思路，给各位老师一个充分利用测序数据的思路。 项目文章 （一）云序客户m5C RNA甲基化修饰表达谱，一次测序三篇文章 疾病：肝癌 样品：肝癌组织vs癌旁组织（6 vs 6） 研究方法：m5C-MeRIP-Seq，RNA-seq 1. 人肝癌和对应临近非肿瘤组织中mRNA的差异m5C表达谱概述 发表杂志：Journal of Translational Medicine 影响因子：4.124 发表日期：2020.06.22 文章链接：Overview of distinct 5-methylcytosine profiles of messenger RNA in human hepatocellular carcinoma and paired adjacent non-tumor tissues 转录后甲基化修饰，如5-甲基胞嘧啶(m5C)修饰，与癌症的肿瘤发生密切相关。然而，肝细胞癌(HCC)中m5C修饰的mRNA表达谱尚不清楚。本文通过由云序生物提供的m5C-MeRIP-Seq鉴定人HCC组织及邻近组织mRNA上的m5C峰，
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血糖研究热门靶标：糖化白蛋白研究
作者：德尔塔 日期：2022-04-14
白蛋白是一类球蛋白，最常见的是血清白蛋白。白蛋白家族的所有蛋白质都是水溶性的，在浓盐溶液中有一定的溶解性。白蛋白通常存在于血浆中，与其他血液蛋白的不同之处在于它们没有糖基化。含有白蛋白的物质，如蛋清，称为类白蛋白。许多血液转运蛋白是进化相关的，包括血清白蛋白，甲胎蛋白，维生素D结合蛋白等。糖化白蛋白是白蛋白通过糖基化作用与糖分子结合，例如葡萄糖。血糖低时糖化白蛋白含量降低，血糖高时糖化白蛋白含量升高。 人体内的葡萄糖会与血清蛋白的N-末端发生糖基化反应, 其90%与血清蛋白结合, 生成糖化血清蛋白。在糖化血清蛋白中，超过90%以上的就都是糖化血清白蛋白（GA）了。糖化血清白蛋白可以反映糖化血清蛋白的总体水平。由于白蛋白半衰期为17-20天，因此糖化白蛋白能反映过去2-3周的平均血糖水平；而红细胞的寿命则长达120天，故而糖化血红蛋白反映的是过去120天的平均血糖水平。相比之下，糖化白蛋白要比糖化血红蛋白更能反映近期的血糖情况，更能准确的评估糖尿病近期的**效果，也有助于对未确诊的糖尿病或应激性高血糖进行诊断和鉴别诊断。 糖化血红蛋白很容易受到血红蛋白更新速度和数值的影响。当存在糖尿病肾病肾性贫血、血液透析、溶血性贫血、脾功能亢进、脾脏切除或者促红细胞生成药物等因素的影响时，这一指标就会产生变化。而糖化白蛋白则主要受血清中蛋白水平影响。但从总体来说，糖化白蛋白相对不容易被外界因素影响，在分析中更有优势。 糖化白蛋白（GA）的测定方法有酶法、高效液相色谱法法（HPLC）、亲和层析法、放射免疫法、酶联免疫法 ( ELISA) 和酶联免疫硼酸盐法、电泳法、比色法、电化学发光法等。糖化白蛋白的应用领域已经逐渐拓展至筛查糖尿病、预测慢性并发症风险、辅助鉴别应激性高血糖、妊娠期血糖监测等，成为一个具有临床应用价值的血糖新指标。 艾美捷科技作为专业的生命科学领域解决方案供应商，为您推荐Abbexa品牌的糖化白蛋白和人糖化白
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冷冻断裂与冷冻蚀刻基础介绍
作者：德尔塔 日期：2022-04-14
揭示生物学样本和材料样本原本无法观察到的内部结构 冷冻断裂是一种将冰冻样本劈裂以露出其内部结构的技术。冷冻蚀刻是指让样本表面的冰在真空中升华，以便露出原本无法观察到的断裂面细节。金属/碳复合镀膜能够实现样本在SEM（块面）或TEM（复型）中的成像，主要用于研究如细胞器、细胞膜，细胞层和乳胶。这项技术传统上用于生物学应用，但现在逐渐在物理学和材料科学中展现出重要意义。近年来，研究人员通过冷冻断裂电子显微镜，尤其是冷冻复型免疫标记（FRIL），对膜蛋白在动态细胞过程中所发挥的作用有了新的见解。 作者：Gisela Höflinger 图1：麦叶上的蚜虫 适合于电子显微镜的环境 电子显微镜的样品室通过抽真空处理降至极低压力。置于这种环境下的活细胞无法有效保全结构，因为细胞构成中的大部分水分会快速蒸发。 生物样本的制备方法有很多种。样品材料被（固定）保存，这样后续脱水对原位结构的破坏最小，同时可以使用环境扫描电镜（SEM）或者将水冷冻。高压冷冻是观察自然状态下含水结构的唯一方法。高压冷冻所形成的冰不是六边形冰（从水变为六边形冰时体积会增加）而是无定形冰，因此体积保持不变。所以，对渗透和温度变化敏感的结构得以保留（见文章“高压冷冻基础介绍”）。 要观察诸如细胞器、细胞膜、乳胶或液体的表面界面等结构，冷冻断裂是唯一的方法。通过刀片（或类似物）或释放弹簧负载的外力来破开冷冻样本，并沿着最小阻力线断裂样本。 图2：冷冻断裂（来源：http://en.wikibooks.org/wiki/Structural_Biochemistry/Lipids/Membrane_Fluidity） 水的升华与凝结 – 冷冻蚀刻与污染 要暴露冷冻断裂面，需要把冰去除。这就需要通过把断裂面的冰升华去除以保存样品的结构。升华的过程是冰不经过液态过程直接转化为气态。而液态过程会导致样品体积和结构的破坏。 图3：ES，细胞外表面；PF，细胞膜冷冻断裂面；EF，细胞膜外层冷冻断裂面；FS，细胞膜内表面；Cyt，细胞质 水的
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SUMO化促进YTHDF2结合m6A修饰的mRNA对癌症研究的进展与影响
作者：德尔塔 日期：2022-04-14
前言 2021年2月12日上海交通大学医学院余健秀课题组再次携手云序生物MeRIP-seq，RIP-seq等技术在Nucleic Acids Research上发表了文章SUMOylation of YTHDF2 promotes mRNA degradation and cancer progression by increasing its binding affinity with m6A-modified mRNAs，针对YTHDF2与m6A修饰展开研究，发现YTHDF2阅读蛋白SUMO化会影响其结合m6A修饰mRNA的能力，促进mRNA降解，从而调控癌细胞的生长。这是继2018年余健秀课题组首次通过云序生物MeRIP-seq技术在Nucleic Acids Research上发表了文章SUMOylation of the m6A-RNA methyltransferase METTL3 modulates its function，以及2020年通过云序生物MeRIP技术以及microRNA测序技术在Oncogene上面发表了文章Deoxycholic acid modulates the progression of gallbladder cancer through N6-methyladenosine-dependent microRNA maturation之后又一新力作。下面我们一起来看看这篇文章的研究思路和成果。 文章导读 m6A是真核生物中广泛存在的RNA修饰，至今发现的其作用包括了调控RNA的稳定性、运输、mRNA翻译等。m6A修饰水平的调控离不开甲基化酶（writer）和去甲基化酶（eraser），而阅读蛋白（reader）则通过结合受到m6A修饰的RNA对其进行调控。YTH结构域蛋白是被研究较多的m6A识别蛋白，其中YTHDF1和YTHDF3主要功能是增强mRNA翻译效率，而YTHDF2被发现有介导RNA降解的功能。本文深入研究了YTHDF2调控mRNA降解的一种机制。 发表日期：2020.2.12 发表杂志：Nucleic Acids Research 应用技术：RIP-seq, m6A-MeRIP-seq,mRNA-seq 文章链接：SUMOylation of YTHDF2 promotes mRNA degradation and cancer progression by increasing its binding affinity with m6A-modified mRNAs 文章内容 1. m6A阅读蛋白YTHDF2上的SUMO化修饰 作者通过多种SUMO化检验和WB, 验证了YTHCF2阅读蛋白在细胞内发生SUMO化修饰。并且这种SUMO化修饰主要发生在K571上，在缺氧条
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新冠疫苗接种者体内RBD抗体及中和抗体检测方法和结果分析
作者：德尔塔 日期：2022-04-14
新冠疫苗保护性能评估 为了应对新冠疫情威胁，目前已经有很多国家开始了疫苗接种工作，但接种新冠疫苗后，产生的保护效果并不确定，评估新冠疫苗有效性的重要指标之一就是接种者体内中和抗体的含量。针对大规模疫苗接种后的人群，使用简单、快速的胶体金免疫层析法，可快速评估每个接种者体内的抗RBD抗体及中和抗体的水平。 RBD结合抗体 采用胶体金免疫层析技术，通过双抗原夹心法测试RBD结合抗体：取接种疫苗后的血清滴在试纸条加样区，血清会在毛细作用下向前层析，结合垫上的胶体金会溶解，然后和血清一起向前移动。血清到达检测区后，胶体金标记的S-RBD、血清中的抗体与检测线上包被的S-RBD形成复合物，表现为检测线显色，血清中的抗体含量与检测线显色强度成正相关。反应结束后，直接肉眼观察显**况或采用胶体金检测仪进行测试。通过检测线和质控线上胶体金显色强弱，可判断RBD抗体的含量。该方法可检测血清、血浆及其他分泌物中含有可与RBD相互作用的任何抗体，并且此方法不受样本种属及抗体型别的限制。 胶体金免疫层析检测RBD结合抗体 应用场景 血清中RBD抗体筛查、早期患者血清学诊断及疫苗临床效果评价—抗RBD总抗体检测。 测试结果 标记: 胶体金标记S-RBD (b46003P)和胶体金标记兔IgG (0295P)包被: C线为羊抗兔IgG (0295G)，T线为S-RBD (46003P/46005P) 备注：“+++”表示反应很强；“++”表示反应较强；“+”表示反应较弱；“±”反应很弱；“-”表示无反应。 RBD中和抗体 采用胶体金免疫层析法的竞争法测试RBD中和抗体：取接种疫苗后的血清滴在试纸条加样区，血清会在毛细作用下向前层析，结合垫上的胶体金会溶解，然后和血清一起向前移动。血清到达检测区后，胶体金标记的S-RBD与检测线上包被的ACE2结合，并被固定在检测线上，表现为检测线显色，而血清中的中和抗体会与检测线上的ACE2竞争结合S-RBD，从而导致固定在检测线上的S-RBD减少，检测线显色下降。反应结束后，直接肉眼观察显**况
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福布斯：视觉技术驱动下一代育种
作者：德尔塔 日期：2022-04-14
根据世界银行的数据，到2025年，地球上将有80亿人。为了维持这一人口，我们需要智慧农业来帮助我们实现每公顷种植更多的粮食。视觉技术将帮助我们实现这一目标。 几个世纪以来，农民一直在培育口味好、耐逆、高产的植物品种。视觉技术的一种——下一代测序技术——利用荧光成像技术来探索和理解基因组，大大改善了育种过程。科学家使用诸如基因修饰和编辑之类的技术来实现特定的性状，例如改善口感、大小、抗性或产量等。 但是，大自然也不是善茬。育种者必须找出基因在其生长环境中的表达方式。为此，他们使用表型分析来测量植物的不同部分（包括颜色、茎粗、高度和叶角等），旨在将这些性状与植物内的特定基因相关联。 育种家根据色卡比对来确定施加氮肥的量 （Trends Plant Sci.,2019, 24, 10） 视觉传感器和机器学习正在打破植物表型的瓶颈 植物育种和表型并不是新鲜事。1856年一个叫孟德尔的人就通过表型阐明了遗传学的核心问题。但遗憾的是，直到最近测量植物表型的过程仍然十分繁琐。“目前，所有植物的特征都是由人类来衡量的，因此是主观的”，Agricomseeds的莉亚·帕雷德斯·萨尔托斯说。 科学家，育种家和其他技术娴熟的操作员用手测量植物性状，这是一个缓慢/昂贵且不精确的过程，通常被称为表型瓶颈。实际上，完成一个新的植物品种可能需要长达10年的时间。 视觉技术是采集、分析、过滤（噪音）、显示或分发视觉数据的任何技术。它通常利用计算机视觉、机器学习或人工智能。视觉数据包括图片、视频、热图像、X射线图像、高光谱图像、LiDAR等等。 令人兴奋的是，视觉技术正在改变表型，打破瓶颈，驱动我们进入下一代植物育种。相机和传感器技术的进步正在通过多种成像传感器（包括多角度、2D、3D、RGB、荧光、近红外（NIR）、热红外和高光谱）实现更快，更可靠的室内表型分析。 这些技术正在快速使表型过程自动化，从而使育种者不仅可以获取更快，更准确的表型数据，还可以检查
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盘点2020年度FDA审批通过的其他抗肿瘤药物
作者：德尔塔 日期：2022-04-14
前言 截止至2020年12月31日，美国食品药品监督管理局（FDA）已经正式审批通过了10个除小分子抑制剂和单抗的抗肿瘤药物（包括首次通过审批、扩大适应症）的批文，详见附表。临床上这些抗肿瘤药物分别用于卡波西肉瘤、淋巴瘤、骨髓瘤、尿路上皮癌、乳腺癌、肺癌、白血病、前列腺癌等。下面详细盘点2020年度FDA审批通过的其他抗肿瘤药物。 #联合用药 *扩大适应症 Mitomycin (JELMYTO) UroGen Pharma FDA正式批准了UroGen制药公司的JELMYTO，用于**患有低度上尿路上皮癌（LG-UTUC）的成年患者。 Sacituzumab govitecan-hziy (TRODELVY) Immunomedics,Inc. FDA加速批准了Immunomedics公司的TRODELVY，用于先前至少接受了两种转移性疾病**的转移性三阴性乳腺癌的成年患者。 Pomalidomide (POMALYST) Celgene Corporation FDA扩大了新基公司的POMALYST适应症，用于**艾滋病相关卡波西肉瘤的成年患者和HIV阴性的卡波西肉瘤成年患者。 Lurbinectedin (ZEPZELCA) Pharma Mar S.A. FDA正式批准了Pharma Mar公司的ZEPZELCA，用于**在铂类化疗后病情恶化的转移性小细胞肺癌（SCLC）的成年患者。 Combination of decitabine and cedazuridine (INQOVI) Astex Pharmaceuticals, Inc. FDA正式批准了Astex制药公司的INQOVI，用于**患有骨髓增生异常综合症（MDS）和慢性骨髓单核细胞白血病（CMML）的成人患者，包括既往**和未**，新发和继发性的MDS。Inqovi是美国首个被批准**MDS和CMML的口服低甲基化制剂。 Brexucabtagene autoleucel (TECARTUS) Kite, a Gilead Company FDA加速批准了Kite公司的TECARTUS，是一种靶向CD19的自体CAR-T疗法，用于**复发性或难治性套细胞淋巴瘤（MCL）的成人患者。TECARTUS是全球第三款CAR-T疗法。 Belantamab mafodotin-blmf (BLENREP) GlaxoSmithKline FDA加速批准了葛兰素史克公司的Blenrep，用于**复发性或难治性的多发性骨髓瘤的成人患者，这些患者至少
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太赫兹光谱技术在基于西洋参标志物F11检测分析上的应用及发展潜力
作者：德尔塔 日期：2022-04-14
Plant Phenomics | 上海理工大学庄松林院士团队开发了一种基于西洋参标志物F11的无损快速分析方法 西洋参是一种名贵的药用草本植物，具有诸多的药理学价值。传统的西洋参鉴定方法存在费时、费力、消耗大等问题，而太赫兹光谱技术在定性和定量鉴定药草的关键物质方面具有巨大潜力。而今，特异性标志物标记分析法已变成物质分析的最重要手段。 近日，Plant Phenomics在线发表了上海理工大学庄松林院士团队题为Terahertz Spectroscopy for Accurate Identification of Panax quinquefolium Basing on Nonconjugated 24(R)-Pseudoginsenoside F11的研究论文。 本研究开发了一种基于西洋参的特异性物质拟人参皂苷F11为标志物的分析方法，详细研究了太赫兹光谱技术在药草西洋参定性和定量上的相关工作，分析对比了太赫兹和多种方法对西洋参的测试结果以及不同产地西洋参的光谱差异。本研究证明了以拟人参皂苷F11为出发点检测西洋参的高效性，也为后续太赫兹技术在药草鉴定领域的应用做出总结和展望。 首先，相较于其他光谱法展示物质分子的跃迁方式、官能团信息，太赫兹光谱法可以表征分子整体的信息，更快速精准的展示西洋参特异性标志物F11的信息。 第二，与《中国药典》的权威方法高效液相色谱法分析对比，两种方法的归一化误差小于5%，线性拟合度高达0.975。但太赫兹光谱法速度更快，经济实惠，提高了西洋参的检测效率，降低了检测成本。 第三，基于主成分分析法，通过分析不同样本的主成分得分的差异，不但实现了西洋参与同属于五加科人参属的其它药草、其它非草药物质的鉴别，而且可以鉴别西洋参的产地。这种通过光谱信息与算法程序的结合手段，使得西洋参检测更加智能化。 在本研究中，我们开发了一种拟人参皂苷F11准确、快速和经济有效的鉴别和定量分析新方法。研究中的理论模拟和实验数据证明了F11可以作为西洋参的生物标志物，其吸收峰面积可以准确地定量西洋参样品中F11的含量。
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3类阴性对照对确定细胞的非特异性荧光的差异
作者：德尔塔 日期：2022-04-14
实验方案设计的第一步就是设置对照组，如何保证实验操作的可行性以及实验结果的可靠性，设置合理的对照组是关键。特别是阴性对照，不同的实验类型阴性对照都包括好几种，分分钟让你晕头转向，今天我们就来说说流式实验的阴性对照。 我们都知道流式实验是利用流式细胞仪激发细胞上结合的荧光素发射荧光，进一步通过对荧光信号的分析就可以间接反映样品细胞的物理化学特征。但是产生的荧光都是靶标特异性的吗？当然不是。发射荧光不仅荧光素能够在激光的激发下产生荧光，细胞表面的某些分子或者结构也能够产生类光，这种荧光相对于荧光素产生的荧光较弱，而且与细胞表面的特异抗原分子没有相关性，被称为非特异性荧光。在特定的激光激发下，细胞表面不结合流式荧光素时也会产生荧光信号。 通常地，每一种细胞都会产生非特异性荧光，流式检测时得到的荧光信号是细胞本身的非特异性荧光和来自于细胞表面结合的荧光素的特异性荧光叠加得到的结果。所以分析流式结果时，不能因为得到了荧光信号就判断细胞表面肯定结合有相应的荧光素，从而得出细胞表达相应的抗原分子的结论，而应该比较该荧光信号与细胞的非特异性荧光，如果得到的荧光信号大于非特异性荧光，说明得到的荧光信号部分来源于荧光素的特异性荧光，就可以得出细胞表达相应的抗原分子的结论。 所以，确定与荧光素无关的细胞自身的非特异性类光的强弱非常重要，而设立阴性对照就是为了确定细胞的非特异性荧光。 话不多说，看图，如上图这3类阴性对照是流式分析比较全面的阴性对照： 第1类“negative”表示的是不加任何荧光素偶联抗体时得到的荧光信号，因为没有标记任何类光素，所以这组得到的荧光信号与荧光素无关，与细胞抗原分子CD69是否表达无关，得到的荧光信号代表的是非特异性荧光信号； 第2类“抗CD69”表示的是用抗CD69抗体标记样品细胞后得到的类光信号，虽然抗CD69抗体能修与细胞表面的CD69抗原分子结合，但是抗CD9抗体没有偶联荧光素，所以
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肥胖型糖尿病免疫缺陷鼠的表型信息与应用
作者：德尔塔 日期：2022-04-14
免疫缺陷小鼠是指由于先天遗传突变或者用人工方法造成的免疫系统上一种或者多种免疫成分（B细胞、T细胞、NK细胞等）存在缺陷或者缺失的小鼠。随着基因编辑技术的不断发展，免疫缺陷程度更高的小鼠品系不断被开发出来，并在免疫、肿瘤、干细胞研究和基因**等方面发挥着巨大的作用。尽管如此，传统的免疫缺陷小鼠，如裸鼠、NOD scid，由于其饲养繁育条件要求较低、对特定的肿瘤成瘤效率高等优势仍被广泛应用。赛业生物药物筛选评价小鼠模型平台可以提供系列免疫缺陷小鼠，如BALB/c nude（裸鼠）、NOD scid、重度免疫缺陷鼠BRGSF和C-NKG等。 NOD scid（非肥胖型糖尿病/重症联合免疫缺陷鼠）是在非肥胖型糖尿病小鼠（NOD）背景品系的基础上引入scid突变的先天性T和B淋巴细胞免疫缺陷小鼠。NOD scid免疫缺陷鼠独有的多种免疫缺陷为人类造血细胞的重建提供了一个极好的系统，是HIV-1研究、肿瘤研究和基因**的重要模型。 NOD scid小鼠表型信息和应用 1. NOD scid（非肥胖型糖尿病/重症联合免疫缺陷鼠）是在非肥胖型糖尿病小鼠（NOD）背景品系的基础上引入scid突变的先天性T和B淋巴细胞免疫缺陷小鼠。独有的多种免疫缺陷为人类造血细胞的重建提供了一个极好的系统，是HIV-1研究和基因**的重要模型。 2. 肿瘤研究的重要工具，可增加肿瘤的发生率，尤其是淋巴瘤和胸腺瘤。 3. 移植致死性胸腺淋巴瘤的情况下寿命短，约为8-9个月。 BRGSF小鼠表型信息和应用 1. BRGSF小鼠是技术成熟、免疫缺陷程度最大的一种免疫缺陷小鼠，相比于目前常见的N*G小鼠，BRGSF小鼠的免疫细胞中不仅淋系细胞完全缺失，其髓系细胞（如巨噬细胞）功能也严重缺失，因此其用于肿瘤CDX、PDX模型建立的效果更为优秀，适合抗肿瘤药物的药理和药效学研究。 2. 在基因**领域，BRGSF小鼠同样具有其独特的优势，例如CAR-T**领域，由于BRGSF小鼠为BALB/c背景，其体内存在补体依赖性细胞毒性（CDC）机制，因此我们可研发或寻找利用CDC机制来消除**结束
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PCR鉴定试剂盒使用方法与特点
作者：德尔塔 日期：2022-04-14
PCR鉴定试剂盒特点： 1. 一管式操作，用户只需要提供样品即可。 2. 根据大豆热休克蛋白基因保守区域设计引物，能专一性检测出样品中的大豆成分，但不能检测其他非大豆成分。 3. 快速，整个检测过程（按一个样品计）所需时间仅为 2.0 小时。 4. 只需要普通 PCR 仪和凝胶电泳仪，无需配置贵重仪器设备。 5. 对混合样品中大豆成分的检测下限为 0.1%，对样品中大豆成分的核酸检测下限为 1.0ng/μL。 6. 本只能用于科研，足够 50 次 40uL 体系的常规 PCR。 PCR鉴定试剂盒使用方法: 一、稀释标准曲线样品（以 10E2-10E7 拷贝/μL 这 6 个 10 倍稀释度为例）。由于标准品浓度非常高，因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行，千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分）。 1. 标记 6 个离心管，分别为 7，6，5，4，3，2。 2. 用带芯枪头分别加入 45 μL 荧光 PCR 模板稀释液，*用带芯枪头，下同）。 3. 在 7 号管中加入 5 μL 阳性对照（浓度为 1×10E8 拷贝/μL，试剂盒提供)，充分震荡 1 分钟，得 1×10E7 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。 4. 换枪头，在 6 号管中加入 5 μL 1×10E7 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得)，充分震荡 1 分钟，得 1×10E6 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。 5. 换枪头，在 5 号管中加入 5 μL 1×10E6 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得)，充分震荡 1 分 钟，得 1×10E5 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。 6. 重复上面的操作直到得到 6 个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。 二、样品 DNA 的制备 7. 用自选方法纯化样品的 DNA，本产品跟市场上绝大多数核酸纯化产品兼容。 8. 如果有 N 个样品，则需要进行 N+2 个样品提取，多出的一个用作样品制备阳性对照管、另一个用作样品制备阴性对照管。 三、设置 qPCR 反应（20μL 体系，在样品制备室进行） 9. 如果做定量分析并且只做 1 次重复，则标记 N+9 个 PCR 管，其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个样品，1 个用于 PCR 阴性对照（用
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肿瘤基因功能研究思路解析
作者：德尔塔 日期：2022-04-14
国自然热点是近几年国自然申请的风向标，结合国自然热点为课题方向，能有效提高国自然申请的中标率。肿瘤学是医学科学研究中最为活跃的领域之一，随着细胞生物学、发育生物学、遗传学、免疫学等迅速发展，科学研究范式的改变以及多学科的交叉融合，肿瘤学基础研究取得了一定进展，肿瘤学科申请项目数量及质量也逐渐提高。 肿瘤基因功能研究思路 虽然肿瘤研究的细分领域众多，但不同的领域均会涉及很多基因功能的研究，例如与肿瘤发生、发展、转移、耐药分子机制相关的致癌基因、抑癌基因、转移相关基因和耐药相关基因等。肿瘤基因功能的研究是一个整体性的过程，从开始的基因筛选、到细胞水平（体外）和动物水平（体内）的功能性验证，再到机制探讨及验证，形成一个完整的研究逻辑。 ☑ 基因筛选：通常采用组学的方法进行分析，根据研究目标的不同，可分为基因组、转录组、蛋白组和代谢组分析。 ☑ 细胞水平功能性验证：细胞水平的调控则需要建立基因表达调控的细胞模型，如通过病毒载体或电转等方式，实现对目标基因的过表达、敲低表达、敲除表达和点突变等。 ☑ 动物水平功能性验证：肿瘤研究最常用的动物模型则为免疫缺陷小鼠，如最基础也是最常用的裸鼠，可通过移植肿瘤细胞建立CDX模型，对于重度联合免疫缺陷小鼠则可用于建立PDX模型或人源免疫系统的重建，此外还有各种定制化的基因修饰动物也应用于肿瘤的研究中。 ☑ 机制探讨和验证：而对于肿瘤机制的研究则各有不同，常规的思路是寻找目标基因上下游的调控分子或信号通路，并采用蛋白与DNA、RNA与蛋白、蛋白与蛋白等相互作用进行验证。 图1. 肿瘤基因功能研究思路 研究案例解析 精选案例一：DUSP1 inhibits cell proliferation, metastasis and invasion and angiogenesis in gallbladder cancer 研究目的：研究DUSP1在胆囊癌进程中的作用机制。 技术路线：对胆囊癌患者肿瘤细胞的DUSP1水平定量检测→建立两种GBC细胞系的DUSP1过表达细
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如何清除食物过敏原污染（蛋白质污染）及如何选择合适的清洗剂
作者：德尔塔 日期：2022-04-14
摘要 在过去的15年中，过敏反应在人口中的数量已增加了一倍，并且主要影响儿童人口。 食物过敏的患病率约为成年人口的1-4％，婴儿人口的7-10％。 食物不良反应，过敏和食物不耐受是一个正在出现的健康问题。 预防它们的唯一方法是从敏感人群的饮食中清除过敏原。 在食品行业中，适当且科学的原料管理必须确保在标签上显示其是否存在，并避免无意的过敏原存在。 食物过敏原 食物过敏原是可以在我们食用的食物中发现的蛋白质，会损害对它们敏感的人们的健康。 它们本身是无害的物质，但会导致某些消费者的免疫系统反应加剧。 过敏原（抗原）通过免疫球蛋白E（IgE）介导的免疫反应引起超敏反应（过敏症）。 对过敏原的反应可能具有不同的严重程度，包括嘴唇，嘴巴和喉咙发痒，对更严重的反应（如过敏反应）可能导致死亡。 监管框架 近年来，食物过敏原和不耐受性的增加导致了广泛的监管框架的发展，旨在提供最严格的信息和消费者保护。 根据关于欧盟食品规范框架的（EU）1169/2011法规，生产包装食品的食品行业以及所有专门用于招待客人或向其客户提供非包装食品和饮料的机构（餐厅，酒吧 ，餐饮，公共食堂（例如学校，医院，住宅等）和自动售货机等有义务告知消费者是否含有法规中规定的14种强制性声明过敏原中的任何一种。 企业/机构可以通过各种媒体（报纸，计算机或口头）向消费者提供这些食品信息，尽管建议以书面形式和视觉形式出现在菜单上。 遗漏此信息和/或侵权可能会导致该公司受到3000至600000欧元的罚款。 尽管有超过150种可引起人体不良反应的过敏原，但法规1169/2011列出了14种强制性声明过敏原的表格。 食物过敏原管理 为了遵守法律和食品安全要求，重要的是，食品公司在其HACCP自控系统中纳入对这种新风险（食品过敏原的存在）的管理是非常重要的。 在食物加工的不同阶段都可能发生食物过敏原污染。 在制造过程中的交叉接触可能是造成
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动物育种研究终端技术方案
作者：德尔塔 日期：2022-04-14
在传统动物呼吸测热(能量代谢)头箱基础上，易科泰生态技术有限公司推出动物育种研究终端技术方案： 1.动物代谢舱群平台技术：饲料转化效率、育种表型有效的能量消耗、动物环境影响等 2.Thermo-RGB双光红外热成像技术：呼吸模式、动物疾病筛查等 3.动物活动状态、生理指标监测技术：姿态行为时间长度、温度、心率、活动等 4.动物脂肪含量高光谱监测技术：脂肪深度含量分布监测、饲料标准建立等 5.动物设施环境气象监测技术：气象因子监测、客户定制等 动物代谢舱群可以更大空间、更符合动物福利标准、更高精确度研究动物实时的细微有效能量消耗，其优势远远高于传统的呼吸测热头箱。作为动物育种表型开放平台，舱体内可配置双光红外热成像、动物活动、生理指标监测传感器、高光谱成像单元、环境气象监测等技术组成动物育种研究表型平台，全方位评估育种动物的生产性能和表型特征等。 案例1 牛的进食、热应激、甲烷排放、育种表型有效能量消耗监测设施构建 作为拉美最大的农业研究机构、巴西农业可持续发展支柱的国家农业研究Embrapa上市公司于2015年启动的集成大动物呼吸代谢（能量代谢）等技术构建的动物大表型平台，助力该国农场动物可持续生产、粮食安全、气候变化和消费者接受等全球性竞争课题，在近年来的农业、生物科技、食物与健康等领域产生了国际带动性产业影响力。 案例2 一套创新型的群养猪能量代谢舱群描述 作为公立常春藤名校的伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校于2019年启动了群养猪能量代谢舱群，进行猪全部生产阶段进食的净能评估。该舱群由6个舱体组成，每个舱体大小为1.8×2.1×2.7米，可放置4-10头（取决个体大小）猪进行实验，以比较个体饲养和群体饲养猪的净能差异。 参考文献： Fan Y X , Wang Z B , Nie H T , et al. Determination of energy and protein requirements for maintenance and lactation of Dorper × Hu crossbred shee
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