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最新生物标志物biomarker检测技术进展(二)

最新生物标志物biomarker检测技术进展(二)

作者:德尔塔 日期:2022-04-22

生物标志物检测的创始:免疫组织化学 人类最早是在组织样本中实现了生物标志物的检测。组织特异性的标志物在现代医疗中被经常用来研究肿瘤等疾病中的病理变化。最经典的被转化医学成功应用于组织中标志物检测的方法是免疫组织化学(Immunohistochemistry),特别是在肺炎中的早期应用。免疫组化技术在1940年代发明时[1],初衷是证实病原体的存在部位,例如肺炎球菌II型和III型多糖在鼠中的定位。过氧化物酶标记技术在1979年成熟,免疫组化的灵敏度被显著提高。带来的直接益处是福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织切片的免疫组化检测。多数情况下免疫组化使用酶联抗体来进行显色反应,并通过显微镜镜检。尽管在医学检验中使用广泛,但这项技术仍然存在瓶颈:需要非常专业的操作人员和极为严格的标准,还仅能得到半定量的结果。近些年来专家致力于免疫组化的标准化和自动化。但要在全世界各地的实验室实现非常一致的免疫组化,并且在假阳性或假阴性等区分度方面达到一致的判别标准,还面临众多的困难,争论和挑战。人们对免疫组化应用于标志物检测的展望包括提高灵敏度以检测低丰度蛋白,较好的动态检测范围,更高的空间分辨率以判别标志物表达的细胞类型甚至是细胞器类型。另外,免疫组化在多重性,绝对定量以及特异性方面的需求还没有得到有效满足。 生物标志物的应用关键:体液样本检测 生物标志物近年来引起了极大的关注,因为有大量在血浆或血清中的蛋白标志物被鉴定。尽管这些蛋白有较高的转化医学价值,但现有技术的检测灵敏度或检测能力仍然是主要的制约因素。事实上在过去长达15年时间里,平均每年进入临床应用的新的生物标志物仅为1-2个。在平台的选择方面,灵敏度并不是唯一的考量,准确性,可重复性,动态检测范围大小以及样本通量决定标志物检测能力。由此也不难理解为什么质谱技术在体液样本检测中的应用不广:质谱最主要的缺陷是不适合复杂样品的分析,特别是体液样品,体液的样本除了成分复杂,更有巨大

最新生物标志物biomarker检测技术进展(三)

最新生物标志物biomarker检测技术进展(三)

作者:德尔塔 日期:2022-04-22

ELISA酶联免疫分析 ELISA(酶联免疫分析)是很早被应用于体液样本临床蛋白标志物检测的技术,因而也被当成“金标准”来使用,但事实上受制于较简单的实验范式和有限的优化措施,ELISA技术的灵敏度非常有限。而ELISA由于其使用抗体的不同,结果也会体现不同的检测效力。粗制多克隆抗体,亲和纯化的多克隆抗体,和单克隆抗体都在ELISA中有广泛的应用。在构建试剂盒时经常会需要对抗体的特异性,灵敏度等进行测试。应用不同的样本进行同一个抗体的Western Blot测试可以帮助我们判断抗体的特异性。对各种来源的抗体进行比较和优化,对于开发ELISA试剂盒,起到最为基础的作用。 Multiplex多重标志物检测技术 ELISA技术已经非常成熟且容易掌握,但其灵敏度和检测通量较低的问题吸引研究者的关注,并尝试开发更好的技术来替代这种传统方法。由于大量获取较廉价数据的需要,亦或是在样本量有限而需要获得较多数据时,多因子或多重分析物同时鉴定的技术对研究者意义重大。 代表性的多重生物标志物检测技术包括平面矩阵式检测和液相悬浮芯片。平面矩阵式检测以R&D等公司的固相蛋白芯片为代表,通过在固相芯片的不同位置免疫捕获不同的标准品或者样品,来利用空间位置实现不同样本的识别,而酶标二抗所产生的显色反应强弱报告了每个样本点的特定分析物含量,仪器通过简便的读卡就能判断不同分析物的含量。固相蛋白芯片分析重数较低以及动力学范围较窄的特性使得这项技术的应用受到一定限制,更适合于定性检测或者相对含量的判断。 液相悬浮芯片以Luminex平台为代表,BD等公司的CBA技术也可以归为此类。Luminex液相悬浮芯片采用的红色-红外双色/三色染料混合荧光编码,可以实现约100种/500种不同身份微球的识别。当把特定颜色的微球与检测特定指标的抗体偶联起来以后,不同微球就可以在同一份样本中独立工作,去分别捕获不同的标志物。该技术所使用的二抗仍然是标志物特异性的,上面带有生物素标记,可以同链霉亲和素-藻红蛋白显色

最新生物标志物biomarker检测技术进展(四)

最新生物标志物biomarker检测技术进展(四)

作者:德尔塔 日期:2022-04-22

全新的SMC单分子检测技术 虽然现有多项生物标志物检测技术已经丰富了人们对生物标志物的认识,获取了大量数据和经验,解决了很多生物学或医学问题,但如前文所述的诸多瓶颈仍限制了生物标志物的应用。尤其是对于疾病,特别是肿瘤的早期诊断或预防而言,在疾病的潜伏期或是发生早期,就能在血清/血浆这样容易获得且远离病灶的样本中发现生物标志物的存在十分必要。研究表明这些标志物的含量很可能低至每毫升亚皮克级。上述几乎所有的技术对于这一检测区间都显得无能为力。第二,据文献报道,在已知的约400,000种人类蛋白中,有大约75%,也就是300,000种被现有技术很难检测到。大量生物标志物处在现有技术的检测极限之下。第三,现有技术很多情况下受制于较低的灵敏度,仅能在疾病个体中测得某种生物标志物,而此时疾病可能已经进入实际发生阶段。在健康个体或是疾病风险的个体中尽管这些标志物含量极低,但很可能具备预测性作用,而现有技术无法有效利用这一点。第四,医学研究者在临床上获取了各种类型的体液样本,例如脑脊液、宫颈液、肺泡灌洗液、泪液、尿液等,这些体液样本中经常生物标志物含量极低,但却具备特定领域的独特研究价值,而其中蕴含的宝贵生物学信息常被现有技术忽略。因此,人们亟需开发更为灵敏且特异的生物标志物检测技术来更好地满足基础医学或转化医学的研究需要。 图5. 单分子检测技术原理 新技术的诞生为这些研究需求的实现提供了重要的机会。单分子检测技术(Single Molecule Counting, SMC),在抗体依赖的蛋白生物标志物检测方面产生了质的变化。单分子检测主流的检测技术以Erenna等单分子检测平台为代表(也被称为Singulex),基本原理在于利用毛细管进行荧光素标记分子的上样,并以激光聚焦的方式进行单个分子的激发检测。当荧光素标记分子通过高能量的激光焦点时,单个蛋白分子偶联的荧光素所发射的光闪烁信号被检测器测得。光闪烁信号的次数和强度与分子浓度呈正相关性,从而能建立标

九大测序平台对比

九大测序平台对比

作者:德尔塔 日期:2022-04-22

1.sanger 企业:Life Technology 推出时间:1977年发明,1986年第一台商业化测序仪 主流型号:3730XL 样品要求:PCR产物:浓度≥50ng/ul 体积≥10ul;质粒:含量≥5ug;菌液:体积≥1ml。 测序原理: 双脱氧链终止法:Sanger法测序的原理就是,每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP)使之扩增,并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)使之终止。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3‘-OH基团,使延长的寡聚核苷酸选择性地在G、A、T或C处终止,终止点由反应中相应的双脱氧而定。每一种dNTPs和ddNTPs的相对浓度可以调整,使反应得到一组长几个至千以上个,相差一个碱基一系列片断。它们具有共同的起始点,但终止在不同的的核苷酸上,可通过高分辨率变性凝胶电泳分离大小不同的片段,凝胶处理后可用X-光胶片放射自显影或非同位素标记进行检测。 文库制备:无需建库,提供质粒、菌液、PCR产物等均可以 模板制备:PCR扩增 读长:500-1000bp 测序通量: 四种测序方式的每天通量: 短片段测序36cm36min500bp 1,728,000bp/day; 快速测序36cm60min700bp 1,440,000bp/day; 标准测序36cm90min800bp 1,113,000bp/day; 长片段测序50cm120min1100bp 1,002,000bp/day。 (36cm指毛细管长度,36min指一次反应时间,500bp指一个反应的读长;) 时间/run:36 min-2 hours 碱基精确度:99.999% 变异检测能力(DNA重测序方面): heterozygous insertions and deletions,microsatellite, SNP, AFLP, T-RFLP,and LOH analyses AFLP:扩增片段长度多态性(Amplified Fragment Length Polymorphism),; T-RFLP:限制性片段长度多态性(terminal restriction fragment length polymorphism); LOH analyses:杂合性缺失(Loss of Heterozygosity); 成本:$95,000 per machine, about $4 per reaction, 800bp per reaction, 数据格式:*.bcf ; *.abl 分析软件: 数据收集软件Data Collection v2.0 (随机提供) Manages your inst

ESCO生物安全柜与超净工作台的本质差别

ESCO生物安全柜与超净工作台的本质差别

作者:德尔塔 日期:2022-04-22

Jul 27, 2016 ESCO生物安全柜是为操作原代培养物、菌毒株以及诊断性标本等具有感染性的实验材料时,用来保护操作者本人、实验室环境及实验材料,使其避免暴露于上述操作过程中可能产生的感染性气溶胶和溅出物而设计的产品。根据操作样品类型以及可能影响的空域范围的不同,ESCO生物安全柜的结构设计、排风比例也不同。据此,ESCO生物安全柜分为Ⅰ级、Ⅱ级和Ⅲ级,其中Ⅱ级又分为A1、A2、B1、B2型。 ESCO生物安全柜可分为一级、二级和三级三大类以满足不同的生物研究和防疫要求。一级ESCO生物安全柜可保护工作人员和环境而不保护样品。气流原理和实验室通风橱一样,不同之处在于排气口安装有HEPA过滤器。类型的ESCO生物安全柜都在排气和进气口使用HEPA过滤器。一级ESCO生物安全柜本身无风机,依赖外接通风管中的风机带动气流,由于不能保护柜内样品,目前已较少使用。 ESCO生物安全柜内所形成的几乎没有微生物的环境中,应避免使用明火。溢出实验室中要张贴如何处理溢出物的实验室操作规则,每一位使用实验室的成员都要阅读并理解这些规程。认证在安装时以及每隔一定时间以后,应由有资质的专业人员按照生产商的说明对每一台ESCO生物安全柜的运行性能以及完整性进行认证,以检查其是否符合国家及国际的性能标准。清洁和消毒由于剩余的培养基可能会使微生物生长繁殖,因此在实验结束时,包括仪器设备在内的ESCO生物安全柜里的物品都应清除表面污染,并移出安全柜。 ESCO生物安全柜和超净工作台具有本质的差别:超净工作台是只保护样品的设备,其通过高效过滤器的净化空气向下吹过工作区来保护样品。由于工作区是正压区,气流通过操作窗口外溢,因此,其不保护操作人员和环境。如操作样本中含有已知、未知或潜在致病菌,很可能给操作人员和环境带来危害。与之不同的是,ESCO生物安全柜是一种负压过滤排风柜,其排放的气体都经高效过滤器严格过滤,这样可以保护操作者和环境免于暴露在实验过程中产生的有害气溶胶中。正确操作

tRNA相关研究背景介绍

tRNA相关研究背景介绍

作者:德尔塔 日期:2022-04-22

A. 概述 转运RNA(Transfer Ribonucleic Acid,tRNA)是生物体内含量最为丰富的短链非编码RNA分子。它携带并转运氨基酸,参与蛋白翻译,是连接mRNA与蛋白质的重要桥梁。尽管tRNA广泛存在于生物体内,但不同机体基因组对于特定密码子的偏好性不同,从而导致tRNA谱的差异。密码子偏好性会影响翻译效率和精确性[1-3]。因此,tRNA谱的改变会对多种细胞生理过程产生显著影响。Arraystar公司的nrStar™ Human tRNA Repertoire PCR Array产品包含66对细胞核tRNA引物和22对线粒体tRNA引物,使研究人员可以对tRNA谱进行方便快捷的分析。这款产品囊括了GtRNAdb和tRNAdb所提供的所有反密码子,是研究人类tRNA谱的强有力工具。 B. tRNA谱与细胞命运 研究表明,tRNA谱的变化会影响细胞发育过程中的命运决定。细胞增殖[4]、细胞分化[4, 5]和细胞凋亡[6]等一系列的生命活都伴随着tRNA水平的变化。细胞维持相关基因与细胞多态性相关基因在密码子使用上存在着明显差异。细胞增殖和细胞分化所诱导的tRNA谱变化分别与细胞维持相关基因和细胞多态性基因相对应(图1)。另外,细胞维持相关基因mRNA在增殖细胞和肿瘤细胞中特异性地诱导表达,提示转录与翻译之间存在直接的关联性[4]。过表达起始tRNA(tRNAiMet)能够显著地影响对整个tRNA表达谱,并且进一步导致细胞代谢能力的提升和增殖能力的加强[5]。tRNA还能够影响细胞色素C介导的凋亡小体形成,参与调节细胞凋亡过程[6]。通过体外显微注射tRNA,研究人员发现tRNA能够抑制细胞色素C介导的凋亡途径[7]。总而言之,tRNA谱能够以多种形式调控细胞的生理状态。 图1. tRNA谱与转录组的变化相适应。 C. tRNA谱与疾病     tRNA谱不仅能影响多种细胞生理状态,而且在各类疾病发生发展过程中起着重要作用。比如tRNA的表达紊乱可以诱导肿瘤的发生[5]。因此,tRNA表达谱研究对于揭示人类疾病的病理机制有着重要意义。 癌症     Gingold等人发现tRNA表达谱在肿瘤细胞与分化细胞之间存在着显著差异[4]

ELISA样本制备及注意事项

ELISA样本制备及注意事项

作者:德尔塔 日期:2022-04-22

ELISA样本制备及注意事项 一、血清的采集、处理和保存 1、真空采血针采集新鲜血液,加入无菌试管中; 2、采血后室温静置1小时; 3、将采集血液用离心机4℃,2500rpm离心10min; 4、取上清。分装冻存备用: 2-8℃下,可放置保存24-48小时; -20℃下,可放置保存1个月; -80℃下,可放置保存6个月; 5、根据你的实验需要,取适量上清夜进行各种ELISA测定。 大部分ELISA检测均以血清为标本。血清标本可按常规方法采集,应注意避免溶血,红细胞溶解时会释放出具有过氧化物酶活性的物质,以HRP为标记的ELISA测定中,溶血标本可能会增加非特异显色。此外还应避免细菌污染,因为菌体中可能含有含有内源性HRP,也会产生假阳性反应。血清标本宜在新鲜时检测。如在冰箱中保存过久,其中的可发生聚合,在间接法ELISA中可使本底加深。 二、ELISA 实验中血浆的采集、处理和保存 1、真空采血针采集2ml 新鲜血液,加入无菌试管中; 2、按 1:9加入抗凝剂(EDTA、草酸钠、肝素、枸橼酸钠),30分钟内于冰上分离血浆以减少血小板的污染;(也可以直接用抗凝管采集); 3、将采集血液用离心机4℃,2500rpm离心5min; 4、取上清。分装冻存备用, 2-8℃下,可放置保存24-48小时; -20℃下,可放置保存1个月; -80℃下,可放置保存6个月; 5、根据你的实验需要,取适量上清夜进行各种ELISA测定。请注意指标说明书上对于抗凝血剂是否有特殊要求,建议使用EDTA。血浆中除尚含有纤维蛋白原和抗凝剂外,其他成份均同等于血清。制备血浆标本需借助于抗凝剂EDTA,抗凝不完全的标本因纤维蛋白原干扰而造成假阳性。 三、ELISA 实验中尿液的采集、处理和保存 1、采集尿液样本500ul,加入无菌试管中; 2、将采集血液用离心机4℃,2500rpm离心10min; 3、取上清。分装冻存备用: 2-8℃下,可放置保存24-48小时; -20℃下,可放置保存1个月; -80℃下,可放置保存6个月; 4、根据你的实验需要,取适量上清夜进行各种ELISA测定。 四、ELISA

酸枣仁汤对高架十字迷宫大鼠行为学影响的量效关系评价

酸枣仁汤对高架十字迷宫大鼠行为学影响的量效关系评价

作者:德尔塔 日期:2022-04-22

摘要:采用国际通用的高架十字迷宫焦虑动物模型(EPM),从行为学角度观察了四个不同给药剂量酸枣仁汤对EPM大鼠的抗焦虑作用。结果显示,酸枣仁汤确有抗焦虑作用,但此效应不随给药剂量的增加而增强,与一般化学药物所遵循的量效关系规律不同。   关键词:酸枣仁汤;EPM;行为学;量效关系   酸枣仁汤是临床**肝血不足、虚热内扰之“虚劳虚烦不得眠”的著名古方,有关本方药理实验方面的研究目前多局限于镇静催眠作用的初步观察。针对本方临床可用于**焦虚症的经验事实,本文采用国际上通用的焦虑动物模型—(EPM,高架十字迷宫模型),从行为学角度观察了酸枣仁汤的抗焦虑作用,并对其量效关系特点进行了初步总结。   1材料   1.1动物健康雄性Wistar大鼠90只,级别SPF/VAF,体重180±10g,许可证号:SCXK(京)2002.0003,北京维通利华实验动物中心提供。所有动物提前一周购入,本实验室常规饲养。   1.2药物   1.2.1酸枣仁汤(SZRT):由酸枣仁18g、知母10g、茯苓10g、川芎5g、甘草3g组成(参考高等中医院校五版《方剂学》教材),全部药材购自北京同仁堂有限公司。常规方法煎煮后经水提制成150%浓度,分装灭菌后4摄氏度保存备用。   1.2.2DZP(DiazepamTablets,地西泮片):京卫药准字(1996)第154011号,北京益民制药厂出品。地西泮36片,研钵粉碎后以双蒸水溶解,加入2%羧甲基纤维素钠1~2滴充分混匀,配成10%浓度。4摄氏度保存,使用前混摇均匀。   1.3行为学测试仪器大鼠高架十字迷宫(EPM):采用国际通用方法制作。由两个相对的开放臂(openaim,长X宽分别为50cmX10cm)、两个相对的封闭臂(enclosedarm,closeaITI1,长X宽×高分别为50cm×10cm×40cm)、一个连接四只臂的中央平台(centralplatform,10cm×10cm)(即:开放臂一中央平台一开放臂或封闭臂一中央平台一封闭臂,此二者互相垂直成为“十”(plus)形状)和围绕在开放臂边缘的1cm高的矮挡板组成(目的是防止动物在探究过程中不慎滑下迷宫)。本迷宫由国产有机玻璃制作(8mm厚

新购真空干燥箱7大注意事项

新购真空干燥箱7大注意事项

作者:德尔塔 日期:2022-04-22

如果您新购了一台真空干燥箱,等货到了之后先不要急着使用,看完以下7大操作事项,让您使用无忧。     1.真空干燥箱应在相对湿度≤85%RH,周围无腐蚀性气体、无强烈震动源及强电磁场存在的环境中使用。     2.真空干燥箱不得放易然、易爆、易产生腐蚀性气体的物品进行干燥。     3.真空干燥箱外壳必须有效接地,以保证使用安全。     4.真空泵不能长时期工作,因此当真空度达到干燥物品要求时,应先关闭真空阀,再关闭真空泵电源,待真空度小于干燥物品要求时,再打开真空阀及真空泵电源,继续抽真空,这样可延长真空泵使用寿命。     5.真空干燥箱经多次使用后,会产生不能抽真空的现象,此时应更换门封条或调整箱体上的门扣伸出距离来解决。当真空干燥箱干燥温度高于200℃时,会产生慢漏气现象,此时拆开箱体背后盖板用内六角扳手拧松加热器底座,调换密封圈或拧紧加热器底座来解决。     6.干燥的物品如干燥后改变为重量轻,体积小(为小颗粒状),应在工作室内抽真空口加隔阻网,以防干燥物吸入而损坏真空泵(或电磁阀)。     7.干燥的物品如潮湿,则在真空干燥箱与真空泵之间**加入过滤器,防止潮湿气体进入真空泵,造成真空泵故障。     本文出自北京雅士林试验设备有限公司   转载请注明出处

样本抽提中RNA降解的解决方法

样本抽提中RNA降解的解决方法

作者:德尔塔 日期:2022-04-22

从临床样本出发进行芯片、测序等高通量生物学研究是最常用的思路,但样本采集过程受制于病理特征、病例数量等因素,耗时费力。无数期盼等来了期待中的临床样本,做个RNA抽提还常常…… 降解样本的RNA完整度低,长链RNA变成了短链,在常规的扩增过程中会发生探针检测的目的片段的丢失,导致芯片结果的不准确。 遇到RNA降解了怎么办? 有条件的话,重新收样一定是更佳选择。样本取材时注意操作迅速稳定,尽快液氮速冻。也可以选用RNAlater等RNA保存试剂,但也需要严格按照此类试剂的操作规范进行,否则也达不到对RNA的保护效果。比如浸泡RNAlater前,组织样本尽量切割成任一方向小于0.5cm的小块,以保证浸泡尽可能充分。 但是珍贵样本怎么可能轻易重新取到呢?降解的珍贵样本真的只能扔了么?No! 针对降解样本Affymetrix官方推出了一款表现优秀的降解RNA扩增标记试剂盒:SensationPlus™ FFPE Amplification and 3’ IVT Labeling Kit。该试剂盒使用随机引物和OligodT引物混合使用的策略,可以有效扩增20-200ng的降解样本RNA,甚至FFPE样本的RNA,让这些低量降解的样本活过来,为研究者节约了大量样本收集端的时间付出。 测试一下这个试剂盒。针对同一细胞进行不同基因操作处理,进行3vs3的芯片表达谱检测。收样后因某种处理,抽提产物2100质检RIN值在2左右。经过SensationPlus试剂盒扩增标记后杂交芯片,得到的结果非常漂亮。   数据质量优秀,差异基因(2倍以上差异)上调的有600多,下调的500多。后续GO/Pathway富集分析结果也很赞。 附分析流程: 保存良好的FFPE样本抽提产物RIN值通常在1.8-2.8,所以FFPE样本用这个试剂盒也能满血复活。不过FFPE样本会受保存条件和时间的影响,造成一定的数据不稳定,因此推荐上芯片要对FFPE样本做有针对性的筛选,优先选择时间更近的样本。当然**是整理出批量样本后试抽提几个,看看RNA的降解情况。 还等什么,样本库里睡着的石蜡块,来让它们发挥更大的作用吧~~~

反应釜的用途及使用要点

反应釜的用途及使用要点

作者:德尔塔 日期:2022-04-22

通过对容器的结构设计与参数配置,实现工艺要求的加热、蒸发、冷却及低高速的混配功能,产品具有使用灵活、操作简便、使用安全可靠等优点。今天我们就来具体介绍一下反应釜的用途及使用要点,希望可以帮助到大家。 反应釜的用途 反应釜材质一般有碳锰钢、不锈钢、锆、镍基(哈氏、蒙乃尔)合金及其它复合材料。反应釜可采用SUS304、SUS316L等不锈钢材料制造。搅拌器有锚式、框式、桨式、涡轮式,刮板式,组合式,转动机构可采用摆线针轮减速机、无级变速减速机或变频调速等,可满足各种物料的特殊反应要求。密封装置可采用机械密封、填料密封等密封结构。加热、冷却可采用夹套、半管、盘管、米勒板等结构,加热方式有:蒸汽、电加热、导热油,以满足耐酸、耐高温、耐磨损、抗腐蚀等不同工作环境的工艺需要。而且可根据用户工艺要求进行设计、制造。 反应釜的使用要点 反应釜由釜体、釜盖、夹套、搅拌器、传动装置、轴封装置、支承等组成。搅拌装置在高径比较大时,可用多层搅拌桨叶,也可根据用户的要求任意选配。釜壁外设置夹套,或在器内设置换热面,也可通过外循环进行换热。支承座有支承式或耳式支座等。转速超过160转以上宜使用齿轮减速机.开孔数量、规格或其它要求可根据用户要求设计、制作。 1.通常在常压或低压条件下采用填料密封,一般使用压力小于2公斤。 2.在一般中等压力或抽真空情况会采用机械密封,一般压力为负压或4公斤。 3.在高压或介质挥发性高得情况下会采用磁力密封,一般压力超过14公斤以上。除了磁力密封均采用水降温外,其他密封形式在超过120度以上会增加冷却水套。

CULTEX® RFS细胞暴露实验程序的验证及颗粒物急性暴露毒性评价预测模型的优化

CULTEX® RFS细胞暴露实验程序的验证及颗粒物急性暴露毒性评价预测模型的优化

作者:德尔塔 日期:2022-04-22

CULTEX® RFS细胞暴露实验程序的验证及一个颗粒物急性暴露毒性评价预测模型的优化 项目合作单位德国军队药理学和毒理学研究所,慕尼黑 SEH咨询服务,帕德博恩施特劳瓦尔特药理学与毒理学研究所,慕尼黑 Cultex实验室有限公司,汉诺威 由于工业和制药领域中对于松散固体颗粒的普遍使用使得空气中悬浮颗粒物的影响越来越重要。这些影响因可吸入颗粒物质的种类、粒径和浓度、以及疾病(甚至死亡)严重程度而不同。 在欧盟范围内,欧盟REACH法规用以管理化学品的注册、评估、授权和限制(如有必要)。人们预先定义了一个测试策略,用于毒理学评价,该评估对可吸入物质(气体、气溶胶和颗粒物)暴露染毒实验的操作有较高的要求。 然而,吸入暴露染毒毒性方面的数据往往不存在,或主要是基于动物实验的。人们对用于动物试验的动物数量的估计值差别很大(多达1000万只动物),其中大约1-2%(即10至20万只动物)用于急性吸入毒性试验。现在,REACH及其他监管措施急需动物实验的替代方法,但是在肺毒理学领域,这种替代方法目前并不存在。 尽管以人类细胞为基础的实验系统已经大量应用于对各种颗粒物质的毒理学评价研究,但是它们对空气中颗粒物评价的有效性因其非生理暴露形态(浸没培养)而受限。Cultex®RFS-辐射流系统(气液界面颗粒物直接暴露)填补了这个空白,它的实验基础是将人肺上皮细胞在空气-液体界面直接暴露于各种颗粒物气溶胶实验物质。这种方法允许颗粒物直接暴露于细胞表面,真实模拟颗粒物在人呼吸道细胞表面沉积生理过程。 在一个由德国联邦教研部 (BMBF,Bundesministerium für Bildung und Forschung)资助的研究项目(BMBF 0315710)中,这种方法在不同的实验室得到了验证,包括其技术搭建及操作。这种测试方法定义于标准操作程序(SOP)中(ECVAM模块1),而且被成功的转移至两个独立且陌生的实验室(ECVAM模块3)。该方法在实验室的重现性(ECVAM模块2)和在实验室之间的重现性(ECVAM模块4)可以得

关于离心机轴承的选购注意事项

关于离心机轴承的选购注意事项

作者:德尔塔 日期:2022-04-22

我们在选购离心机轴承时,一定要注意一下几点:   1、离心机属于高转速设备,这就要求轴承的质量要可靠,低劣的轴承不但会影响离心机的正常运作,严重者还会发生安全事故,所以在一开始选购,我们就要选择那些进口轴承,优质的轴承能够保证离心机长期正常的运转。   2、第二,在离心机运行过程中,要选用优质的润滑剂,坚持机械的润滑工作,一般情况下我们可以选择高温锂基脂,高温锂基脂的好坏也会影响到离心机轴承的运转,此外,如果离心机在运行过程中有噪声产生,或是机械部件有明显的磨损,那就是轴承的原因,这时候需要改换轴承。   3、第三,在很多情况下,人们都会忽视主轴和轴承座加工过程中同心度是否准确,殊不知主轴同心度倾向大也会影响到轴承发热,这一点在使用过程中尤其要注意。   4、第四,在主轴和轴承座加工过程中,公差不到位,轴承内圈(外圈)和滚珠(柱)的间隙太小。此外,再设计时,可以增加加油装置,这不会影响离心机轴承的强度。 此文章由实验室仪器--湖南吉尔森科技发展有限公司编辑整理。

叶绿素的检测方法进程介绍

叶绿素的检测方法进程介绍

作者:德尔塔 日期:2022-04-22

在植物细胞中,叶绿素镶嵌在叶绿体的类囊体膜中,是植物进行光合作用的重要物质。高等植物中主要含叶绿素A和叶绿素B,在褐藻、硅藻类中含叶绿素A、C1、C2;红藻中含叶绿素D等。 早在1818年,Berzelius就开始了对叶绿素方面的研究。1941年Mackinney直接以80%丙酮为溶剂用分光光度法定量测定叶绿素a和b,同时还可以测定其他叶绿素和其他衍生物。1952年Richard和Thompson首次将分光光度法用于海洋学的多色素的同时分析。1963年Parson和Strickland认为Richard和Thompson的结果有许多矛盾之处,并对叶绿素和类胡萝卜素的计算公式进行了修订。由于此法简单方便、准确度高、可同时测定多种色素、便于处理大量样品等优点,至今分光光度发还被广泛应用。1966年,Lorenzen率先提出了利用荧光法连续测量活体叶绿素含量分方法,对于测定海水叶绿素含量奠定了基础,当然还存在着不足,如设备体积庞大、测量准确性低等缺点。随着高效液相色谱在色谱分离方面的发展,使高效液相色谱在20世纪80年代得到快速发展,从此时起叶绿素就可以不受其降解产物影响进行准确的定量分析。 综合几类普遍的测定方法,分光光度法是测量叶绿素最广泛的一种方法,但操作过程复杂,提取时间长。高效液相色谱法具有分析速度快,精确测定各种光合色素含量,但由于仪器昂贵,分析步骤繁多,一般不能用于野外大量样品的快速分析。应用荧光法测定法测定叶绿素分为实验室荧光法和现场荧光法。荧光法测定具有灵敏度度高,检出限低等优点。 同时随着人们对水环境进行更多的检测工作,采用荧光法测定水体中浮游植物叶绿素的含量,进而达到测量藻类含量目的,从而预测水体污染程度,这就要求仪器有更好的便携性、更高的准确性。上海赛普环保科技发展有限公司代理的美国安诺实验室的手持式叶绿素测定仪,采用荧光光度检测技术,具有便携,灵活,操作简便,无需萃取等特点,其ChloroTech121A这一型号可以检测水中叶绿素含量,同时具有浊度修正功能,内部还设有GPS定位

质谱流式技术及组织细胞群体深度解析方法概述

质谱流式技术及组织细胞群体深度解析方法概述

作者:德尔塔 日期:2022-04-22

Data Driven Research: 组织细胞群体的深度解析 ——神奇的质谱流式技术 质谱流式是单细胞分析技术的一大突破,目前应用于血液、免疫、干细胞以及肿瘤等诸多研究领域。它创造性地使用了金属元素做为抗体的标签,利用ICP质谱实现了单细胞多参数的检测。金属标签具有极低的背景信号以及很好的标签化学稳定,结合ICP检测器的超高信号分辨能力,保证了质谱流式可以获得高质量的数据。由于检测通道数量已经达到几十个,质谱流式的数据中包含很大的信息量。 那么利用质谱流式平台获得的数据,我们究竟可以从中得到哪些信息呢?有该如何充分利用这些数据结果进行分析,提高单次实验的效率呢?事实上,不同的数据分析方法赋予了质谱流式不同的功能。这里,本文将就目前常见的一些数据分析方法及结果类型为大家进行简要的总结概述。 一、系统展示组织亚群构成以及功能、状态信息——Data Visualization 质谱流式数据包含所有被测细胞方方面面的信息,是地地道道的高维数据;这种数据的复杂性实际上是组织细胞本身异质性的忠实写照。获得这些数据后,科研人员首先想了解的其实就是组织的亚群构成情况。虽然数据中已经包含这样的信息,但是仍然需要经过加工处理才能转变为直观、易懂的图表,这一过程就是数据的可视化。 SPADE是一种常用的数据可视化方法。它首先将表型类似的细胞聚成小群,然后依照各小群的表型相似度进行聚类分析,最后得到一个树形图。SPADE树形图上每个节点(Node)都是由一群表型相似的细胞构成的,节点相对位置不同也体现了其表型的差异。因此,SPADE树形图直观展示出了组织细胞的亚群构成。 图一中展示的是不同时期的小鼠黑色素瘤中浸润的免疫细胞SPADE图谱,可以明显的看出单核细胞比例明显增大。 图一、小鼠黑色素瘤浸润淋巴细胞的亚群组成(利用32个表面标志分子进行SPADE分析图谱,数据来源:Salmon et al., 2016, Immunity 44, 924–938) 降维分析是另一类经常使用的数据处理方法,在尽可能保持信息