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德尔塔:联川50个肿瘤热点基因Panel上市!

德尔塔:联川50个肿瘤热点基因Panel上市!

作者:德尔塔 日期:2022-04-11

不可不防的50个基因业内享誉全球的梅奥诊所在2014年发布了一个包含了50个肿瘤基因的热点区域的Cancer Panel。这个Panel,也被称为50 Cancer Gene Hotspot Panel。常规的癌症基因测序会覆盖癌症基因在染色体上的整个区域,这个Gene Panel只是Hotspot Panel,即只包含了50个肿瘤基因的热点区域,这些区域和突变位点一般与靶向药物**有关,如小分子靶向药物、单克隆抗体等。梅奥诊所的医生通过与肿瘤学家、病理学家和分子生物学家们的密切合作,在过去的几年内已经取得了有目共睹的成就。在二代测序技术的帮助下,医生利用50 Cancer Hotspot Panel能够在时间内快速找到合适的药物。目前的研究表明,对细胞分裂起关键控制作用的基因一共约为50个左右(如下图所示)。它们中间有些是促进细胞生长、分裂的,又有一些是抑制细胞生长、增殖的。它们在我们的生命中组成一个动态、有机的平衡。当平衡被打破时,癌症或其它病症就会出现。所以这50个核心肿瘤基因至关重要,也就成为了50 Cancer Gene Hotspot Panel所检测的基因。 50个肿瘤热点基因突变检测新利器不同于传统的靶向基因捕获技术,联川VariantPro™技术是一个创新的基于多重PCR的靶向文库制备系统,实现了一步法完成靶向序列捕获和文库制备的全过程。这个系统采用了革命性的RelayPCR™和Omega Primer™技术,可以制备出超高均一性和特异性的扩增子。基于VariantPro™系统,我们已推出了人类线粒体全长突变筛查Panel——VariantPro™ Mitochondrion Panel,乳腺癌风险基因突变筛Panel——VariantPro™ BRCA1/2 Panel。现在,我们推出了VariantPro™ Cancer HotSpots Panel是按100%扩增覆盖50个肿瘤基因的热点区域设计,实现了高性价比,*少人工操作(只需5分钟),超高分辨率地分析和揭示50个肿瘤基因热点区域所有临床相关的突变。 覆盖均一性> 99%(at ≥0.2×mean coverage)到扩增子拷贝数变化在1.4个log内VariantPro™ Cancer HotSpots Panel性能参数elisa试剂盒,elisa kit,西安elis

德尔塔:无需参考的甲基化分析新方法

德尔塔:无需参考的甲基化分析新方法

作者:德尔塔 日期:2022-04-11

生物通报道 分析DNA甲基化的高通量方法大多依赖参考基因组,而许多物种不一定有。*近,奥地利的研究人员就开发出一种方法,在没有参考基因组的情况下分析DNA甲基化。这项成果于本周发表在《Cell Reports》上。 文章的作者是奥地利科学院CeMM分子医学研究中心的Johanna Klughammer。她及其同事将简化甲基化测序(reduced representation bisulfite sequencing,RRBS)与一种名为RefFreeDMA的应用程序相结合。这种程序能从RRBS读取中推断出基因组,并发现样品中差异甲基化的区域。 她们开发的这个流程依赖于脊椎动物中DNA甲基化的非随机分布,大多数甲基化都位于CpG位点。在她们这个方法中,DNA先通过限制性内切酶Mspl和/或Taql消化,这两种酶分别切割C^CGG和T^CGA,并且对甲基化不敏感。之后,这些消化后的序列被用来创建RRBS测序文库。 研究人员指出,他们利用九个物种(人、小鼠、大鼠、牛、狗、鸡、鲤鱼、鲈鱼和斑马鱼),验证和优化了96孔RRBS方法的基因组覆盖度和样品通量,将所覆盖的CpG位点数量从250万个提高到400万个。 RefFreeDMA是一个基于Linux的软件流水线,利用了RRBS读取的特点,如明确的起始和中止点。通过汇集特定物种中所有样品的RRBS读取,这个应用程序推断出每个集群的一致序列。在胞嘧啶和胸腺嘧啶同时存在的情况下,研究人员指出,胞嘧啶被保留,因为这可能反映了甲基化的胞嘧啶。 一旦生成了推导的基因组,研究人员便利用BSMAP/RRBSMPA将读取与一种自定义的DNA甲基化检出脚本相比对,以评估每个CpG位点的甲基化部分。随后,研究人员将差异甲基化的读取进行排序。那些排名靠前的读取被导出为FASTA/FASTQ文件,通过已注释的相关基因组来进行生物学解释。 为了验证这种方法,Klughammer及其同事将其应用在三个物种(人、牛和鲤鱼)的44个样品中,并比较了无参考和有参考的分析。他们发现,对于两种方法,CpG位点的平均DNA甲基化水平在很大程度上是相似的。同时,推导的基因组也大体反映了参考基

德尔塔:从miRNA快速筛选到功能分析的整体解决方案

德尔塔:从miRNA快速筛选到功能分析的整体解决方案

作者:德尔塔 日期:2022-04-11

miRNA研究的基本问题 快速发现并聚焦关键的目标组miRNAs • 创新SmartRNAplex™miRNA表达检测及筛选技术 • 无需miRNA的转录与扩增,简单快速 • 直接探针杂交,不出现扩增实验中的序列偏好性 • 同时获得多重miRNAs指标 (10-34种) • 兼容多种起始样本-提纯的RNA样本、细胞组织裂解液或石蜡包埋组织 • 灵活的样本数量(1-96个样本或更多) • 兼容多种流式细胞仪   Muse™智能触控基因分析仪设有专门的SmartRNAplex检测软件,操作简单,90秒出结果。 突破性胞内RNA活细胞检测纳米技术 • 突破性SmartFlare™灵光™技术,荣获多项2013年度十大创新技术奖(“The Scientist”及“The Analytical Scientist”) • 可以先用显微镜观测活细胞中的mRNA及miRNA在天然状态中的情况,确认后再用Muse进行定量分析 • 单细胞水平mRNA和miRNA数据,便于混杂细胞样本的细胞亚群分析 • 应用RNA的表达情况进行细胞分选和富集 • 在同一细胞样本中对miRNA,mRNA和蛋白进行同时检测,并可做多重分析 • SmartFlare™ 灵光™处理的细胞可继续用于下游培养及功能实验 Muse™智能触控细胞分析仪设有专门的Smartflare检测软件,快速获得活细胞基因分析结果。 全面监测细胞功能 • 全面监测细胞功能,包括细胞周期,细胞增殖,细胞凋亡,细胞活力等; • 采用创新触控式操作模式,在愉悦操作体验的同时,大大提高用户的研究效率; • 配备全面的预置实验方案,以及高品质预包装试剂盒,无需复杂实验参数设定,用户即可轻松把握常规流式实验; • 荣获全球产品设计大奖:2012年度德国红点设计大奖。 立即索取Muse智能触控细胞分析仪的更多资料   Muse™细胞计数和活力检测试剂盒 采用复合染料,双荧光标记,确保更精确的细胞活力状态分析   Muse™细胞周期检测试剂盒 可用于检测细胞群体的G0/G1期,S期,和G2/M期分布。该检测方法基于已验证的PI染色法   Muse™ Annexin-V死细胞检测试剂盒(细胞凋亡) 配备两种荧光染料的预包装试剂盒,可区分活细胞、早期凋

南京德尔塔:RNA干扰也要由内而外

南京德尔塔:RNA干扰也要由内而外

作者:德尔塔 日期:2022-04-11

TransOMIC shRNA-mir载体结构整合的理念设计shRNA,独特的基于microRNA设计结构,强效低毒的载体作用方式,多种筛选标记可以满足瞬时研究和长期研究的需要。• 病毒启动子高效启动 shRNA-mir 的表达• 嘌呤霉素筛选可获得长期稳定沉默的细胞株• turboGFP 标签可通过荧光观测转染效率 TransOMIC shRNA-mir来源于冷泉港的技术依托冷泉港的shERWOOD算法和强大的细胞功能验证系统,保证每一条设计出来的干扰载体都能达到70%以上的干扰效率,具有100%的干扰潜能。除了针对单个基因的干扰克隆产品,transOMIC还为研究者们精心准备了多种干扰单克隆套装产品,满足您对信号通路、基因家族及表观遗传学家族关联蛋白的研究需要!• 设计的干扰载体套装包含多个基因家族和信号通路成员。• 基于shERWOOD算法设计的shRNA-mir具有高干扰潜能,特异性和100%干扰能力。• 单拷贝质粒也可以实现干扰,从而减轻了脱靶效应并保证了多重筛选时更高的可信度。• 载体的个性设计及其单拷贝也能有效实现干扰的潜能使其特别适用于混合筛选!*Let Professionals Serve Professionals基因有限公司 www.genecompany.com*信号通路和基因家族干扰产品套装  物种!--?xml:namespace prefix = o ns = "urn:schemas-microsoft-com:office:office" /-- 基因家族和通路 物种 基因家族和通路 人 B cell activation 人 Extracellular matrix 人 Breast Cancer specific angiogenesis genes 人

德尔塔:微生物组研究手册

德尔塔:微生物组研究手册

作者:德尔塔 日期:2022-04-11

生物通报道:时下不少爱猫人士自封为“铲屎官”,不过相信很少有“铲屎官”会收集猫主子的便便吧。加州大学戴维斯分校的Jonathan Eisen教授正在从事这样的工作,他和同事恳请各位“铲屎官”把便便送给他们进行微生物组测序。 Eisen和Holly Ganz去年五月共同创立了Kittybiome计划,该计划旨在通过DNA测序探索猫咪身上的细菌。他们由此希望了解猫咪之间的微生物组差异,解析这些差异与猫咪行为和健康的关系。 这项工作听起来简单,做起来却并不容易。猫咪微生物组测序的样品制备和DNA提取不同于传统的海水或土壤微生物研究。选择错误的方法会改变微生物的丰度,甚至遗漏关键的菌种。此外,测序的文库制备和数据分析都容易引入序列偏好,影响微生物组研究的结论。 微生物组研究面临的挑战并没有浇灭研究者们的热情。近年来,人类和模式动物的微生物组研究进行得如火如荼。去年年底Science和Nature两大期刊发文,倡议对全球微生物群落开展大规模的系统性研究,以改善人类健康、农业、生物能源和环境。(更多信息请参见:Science、Nature发文倡议微生物组研究) 工欲善其事,必先利其器。我们在这里介绍一些*新的微生物组研究工具和相关技术,包括基因组和转录组的纯化、生物信息学工具、质谱分析、微生物组操纵方法等等。 基因组和转录组纯化 测序可以说是微生物组研究者手头*有用的工具。不过纯微生物组样品一般很难取得,NEB公司的G. Brett Robb指出。在微生物组样品中,宿主DNA占了绝大部分,有时甚至高达99%。 “在实际样品中,微生物组DNA往往跟我们不想测序的东西裹在一起。” NEB公司的NEBNext® Microbiome DNA Enrichment Kit解决了这个问题。该试剂盒使用一个甲基化DNA结合蛋白,选择性结合并过滤宿主基因组序列。细菌(和细胞器)基因组一般缺乏真核基因组DNA的甲基化标签,因此一个简单的纯化步骤就足以将其区分开。 这个试剂盒也可以用来纯化宿主DNA,剔除细菌(或细胞器)DNA,Robb指出。举例来说,华盛顿大学和

德尔塔:单细胞水平的miRNA表达谱分析

德尔塔:单细胞水平的miRNA表达谱分析

作者:德尔塔 日期:2022-04-11

生物通报道  Fluidigm公司近日宣布在其C1™ 单细胞自动制备系统上添加miRNA表达谱分析方案,有助于揭开单细胞中miRNA的秘密。这一方案为研究人员带来了简单、快速且灵活的流程,可扩增单个细胞中数百个miRNA,同时平行处理96个细胞。 这也是Fluidigm在C1系统上实现的第三个单细胞基因组学应用。之前,它推出了单细胞mRNA测序和单细胞基因表达分析。C1系统在去年上市,基于Fluidigm创新的微流体技术,能够让研究人员快速可靠地分离单个细胞并进行基因组分析。 免费索取*新一代细胞增殖检测技术资料信息,无需抗体,轻松获取更加准确的实验数据 microRNA(miRNA)这个小小的非编码RNA分子,行使着重要的调控功能。研究表明,miRNA可调控数千个蛋白编码基因,从而参与了多个生物学过程,包括分化、发育和细胞周期管理。miRNA还与许多常见病存在关联,如癌症和心血管疾病。 研究人员都希望揭开miRNA的更多秘密,然而,miRNA表达谱分析也存在两方面的挑战。首先,单个miRNA可靶定多个mRNA靶点,从而调控多个生物学系统。这种生物学现象是细胞间差异的一个促进因素,让miRNA靶点的解释变得困难。在单细胞水平研究miRNA的表达让研究人员可测定同一群体中某些细胞所发生的快速、动态变化。其次,传统的芯片分析费时费力,灵敏度不高,且内容不够灵活。而定量PCR虽提供了比芯片更高的灵敏度,但在大规模研究时成本高、时间长。 如今有了C1系统和miRNA表达谱分析方案,研究人员可在不到24小时的时间内,平行处理96个单细胞,在一张GE 96.96芯片对每个单细胞分别检测多达96种miRNA。配套的SINGuLAR™ 2.0分析软件可以对数据进行非监督式聚类分析及PCA分析,有效地根据miRNA表达类型在单细胞水平揭示细胞群体的异质性,为研究miRNA调控提供更多数据。 C1单细胞全自动制备系统是全世界*先推出的全自动单细胞分离和制备系统。C1系统为每次运行处理96个单细胞提供了简单轻松、高度重复的流程,而手工操作所需的时间极少。它前所未有

德尔塔:细胞凋亡检测之选择指南

德尔塔:细胞凋亡检测之选择指南

作者:德尔塔 日期:2022-04-11

当细胞死亡时,研究人员往往会奋力排查死亡原因。他们采用各种分析,来确定细胞是经历了凋亡(apoptosis)、坏死(necrosis),还是程序性坏死(necroptosis),从而判断特定环境是否有毒,或者确定药物的作用机制。 凋亡是个复杂的过程,至少有两种主要途径 – 内在和外在 – 导致了程序性细胞死亡。它们汇集于caspase蛋白酶级联反应,*终破坏重要的细胞蛋白。确定哪条途径被触发,在哪个步骤被阻断,以及抑制剂是否能够抑制,催生了各式各样的凋亡检测。 它凋亡了吗? 人们以不同的凋亡标志物为基础,开发了通用的凋亡检测,这些产品可单独或联合使用。形态变化,如细胞皱缩和细胞膜起泡,可在显微镜下观察。磷脂酰丝氨酸从内测翻转到细胞膜外侧,则可以通过Annexin V来检测。通过TUNEL检测来标记带切口的DNA,可观察染色体降解。caspase级联反应的激活则通过caspase及其产物的分析来实现。具体选择哪一种,这取决于多个因素,包括细胞类型和样品量、现有的设备和经验。 医生通常并不关心哪些途径或分子被触发或阻断,因为在开药之前,研究工作已经做了。而这些细节正是研究人员想要确定的。 caspase检测 caspase作为酶原,始终存在于细胞中。一些酶,如执行者caspase 3和caspase 7,是组成型的二聚体,必须经过切割和重排,才能形成活性位点。另一些酶,如启动者caspase 8、9和10,是组成型单体,它们只有二聚化并招募到多蛋白复合物之后才激活1。 针对大多数感兴趣的caspase,市场上已经有了抗体。不过,由于caspase是组成型的,必须利用试剂来辨别活性和非活性形式,才能判断它们是否参与了凋亡。抗体这种关键的试剂可用于各种检测,包括流式分析、免疫组化、ELISA、Western blot和免疫荧光。 许多分析检测caspase酶的活性,而不是酶本身。“有一些底物被caspase酶普遍切割,如PARP和核纤层蛋白,而我们有特异针对那些切割产物的抗体,”Cell Signaling Technology(CST)的产品开发专员Gary Kasof说。其他底物

德尔塔:R&D Systems Animal-Free™ 重组蛋白

德尔塔:R&D Systems Animal-Free™ 重组蛋白

作者:德尔塔 日期:2022-04-11

√ 使用不含动物成分的专门设备生产 √ 现有产品包括细胞因子、生长因子及其他 √ 在我们专门的不含动物成分的工厂中制造 √ 在生产过程中未暴露于动物来源的成分 √ 生物活性与标准实验室条件下生产的蛋白相当 √ 内毒素水平低 √ 科研或生物生产的绝佳选择 √ 可提供更多证明文件 R&D Systems的Animal-Free制造工序 自2002年以来,我们一直在引进制造工艺,以便在无动物成分或副产物的环境下生产高品质的重组蛋白。在2008年,我们开始在访问受控的工厂中制造不含动物成分的产品。这一工厂专门用于不含动物成分蛋白的生产、纯化和灌装。我们的Animal-Free制造工序有下列主要特征: 同样的高品质,如今有了Animal-Free R&D Systems为研究界生产高品质蛋白已有超过25年的历史。为了支持科研和生物生产的要求,我们提供了在无动物成分的条件下生产和纯化重组蛋白的专门实验室中制造的产品。对于顾虑因痕量动物成分或哺乳动物病原体而引起的实验变量的研究人员来说,不含动物成分的蛋白尤为重要。我们在无动物成分条件下制造的产品与利用传统实验室技术生产的产品拥有相同的生物活性。 了解R&D Systems Animal-Free重组蛋白的更多信息 以下数据证实了Animal-Free 蛋白拥有与标准蛋白相当的高生物活性。 elisa试剂盒,elisa kit,西安elisa实验代测,SOD试剂盒,IgG试剂盒,IgM试剂盒,WB实验代做,免疫组化实验代做,放免实验代测,GIBCO,AMRESCO-德尔塔 原创作者:德尔塔

德尔塔:让蛋白纯化像提质粒一样简单

德尔塔:让蛋白纯化像提质粒一样简单

作者:德尔塔 日期:2022-04-11

与核酸纯化相比,蛋白纯化可是一项相当艰苦的工作。纯化时间长,操作步骤繁琐。有时,在实验室呆了一整天,换来的却是让人伤心的结果,蛋白得率低,纯度差。这时你也许会想,如果纯化蛋白像提质粒一样简单就好了。如今,你的梦想成真了。Clontech(Takara旗下)推出了新一代的蛋白纯化试剂盒 – His-Tagged Purification Miniprep Kit。真的就像质粒纯化一样,加样、结合、清洗、溶出,几次离心,5分钟即可纯化出100 μg His-tag融合蛋白。 这个系统在纯化柱中安装了尼龙膜,能够在室温下快速操作,无需等待,并且与哺乳动物和细菌的细胞兼容。细胞裂解液中通常有各种添加剂存在,比如β-巯基乙醇、EDTA、DTT、甘油等,没关系,这个系统也能稳定发挥高性能。纯化柱中的尼龙膜经过改良,膜的表面积大,能产生高纯度、浓缩的蛋白质。通过这种技术,尼龙膜的蛋白结合能力可媲美树脂,甚至更强。与树脂相比,膜的滴下速度快,可在短时间内进行纯化。柱床体积小,可进行少量、高浓度的溶出。从2-5 ml培养液中制备出200-800 μl细胞裂解液,加入纯化柱后经过平衡、结合、洗涤和溶出,5分钟即可完成纯化,*多获得100 μg His-tag融合蛋白。浓度大约在0.3-1 mg/ml。操作流程简便,时间短,可降低蛋白质降解或活性损失的风险,让下游应用的成功率更高。elisa试剂盒,elisa kit,西安elisa实验代测,SOD试剂盒,IgG试剂盒,IgM试剂盒,WB实验代做,免疫组化实验代做,放免实验代测,GIBCO,AMRESCO-德尔塔  原创作者:德尔塔

德尔塔:赛默飞推出新一代的膜蛋白提取产品

德尔塔:赛默飞推出新一代的膜蛋白提取产品

作者:德尔塔 日期:2022-04-11

膜蛋白对许多细胞功能而言至关重要,如信号转导、物质运输和细胞间通讯。膜蛋白和受体也是制药行业中研究*多的一类药物靶点。目前约2/3的**分子靶定一个或多个膜蛋白。大家都知道,膜蛋白的晶体结构能帮助阐明其功能,并发现其与药物分子相互作用的机制。然而,尽管膜蛋白在细胞蛋白质组中的丰度很高(20-30%),但迄今为止仅有0.1%的晶体结构被确定。瓶颈在哪里?缺乏提取试剂和方案,无法从各种细胞类型中获得足够量的膜蛋白用于结晶。目前从真核细胞系和组织中提取膜蛋白的策略有很多,包括亚细胞分步分离(蔗糖密度梯度离心)、Triton™ X-114去污剂法、高盐或高pH缓冲液等。但大部分方法都费时费力,并且需要昂贵的超速离心设备。赛默飞世尔旗下Pierce之前推出的Mem-PER试剂盒也是基于Triton™ X-114,但操作较繁琐,且提取出的疏水片段需要进一步处理,才能用于下游操作。为此,Pierce*近推出新一代的膜蛋白提取试剂盒——Mem-PER Plus试剂盒。它能简单高效地富集内在膜蛋白和膜相关蛋白,且只需要一台小型离心机。内在膜蛋白(integral membrane proteins )与外周膜蛋白相对,区别在于与膜的结合强度不同。内在膜蛋白有一个或两个跨膜区,需要有效地溶解并与细胞内蛋白分离。此试剂盒既适用于培养的哺乳动物细胞,也适合硬或软的组织。与之前的Mem-PER试剂盒相比,Plus有不少好处,操作更简单,其组分可与许多下游应用直接兼容,如SDS-PAGE、Western blot、BCA和免疫沉淀等。Mem-PER Plus是利用一种温和的去污剂来选择性富集内在膜蛋白和膜相关蛋白。通过这种选择性的提取方法,避免了基于疏水性的相分离法的繁琐,也实现了更好的重复性和更高的通量。首先用一种温和的去污剂溶解细胞,让细胞内的可溶蛋白释放出来,之后用第二种去污剂来溶解膜蛋白。整个过程可在一小时内完成,不需要特殊的设备,只要有台式离心机、匀浆器和移液器就行了。当然,提取效率和产量要因细胞类型而异,也与跨膜次数相关。据介绍,带有一

德尔塔:在活细胞水平监控蛋白相互作用

德尔塔:在活细胞水平监控蛋白相互作用

作者:德尔塔 日期:2022-04-11

研究蛋白相互作用的传统方法通常是在体外开展的,只使用了蛋白片段,无法在细胞环境的背景下提供数据。然而,检测结果欠缺在细胞水平的验证而缺乏说服力,还需要进行细胞学检测来验证。而对于NanoBRET™ 蛋白相互作用分析,研究人员能够利用全长的蛋白质,在活细胞水平研究蛋白相互作用的诱导和抑制。BRET的原理是:当两个蛋白分子相互作用,一个蛋白融合表达的供体萤光素酶蛋白(传统使用Renilla 海肾萤光素酶)酶学反应所产生的发光信号光谱与另一个蛋白标记的受体荧光基团的激发光谱相重叠,诱发受体分子发出荧光。与荧光共振能量转移(FRET)相比,BRET不需要激发光,背景更低。NanoBRET™ 分析是大幅度改良的BRET 分析平台,使用NanoLuc® 萤光素酶作为能量供体,而HaloTag蛋白标记的NanoBRET™ 618 荧光基团作为受体。来自NanoLuc 供体的明亮蓝移发光信号耦合到远红移的HaloTag 受体上后,光谱叠加更佳、信号更强,背景更低。与传统的BRET方法相比,NanoBRET™ 分析中作为供体的型NanoLuc® 萤光素酶蛋白光信号更强,与受体荧光基团的波长配对更理想。它使用的Flexi载体技术进行克隆,更简单省时。同时,Promega提供商品化预构建载体,可节省自行构建载体的时间,应用更方便。Flexi 载体克隆系统是基于两个稀有酶切位点的限制性内切酶,SgfI和PmeI,这种技术能够快速、高效、高保真性地在不同 Flexi. 载体间转移蛋白编码区,而无需重新测序。NanoBRET™ PPI Flexi Starter System 提供了以Flexi 载体系统为基础进行蛋白相互检测的解决方案,包括载体,检测试剂及阳性对照。另外一个自行构建载体的解决方案是NanoBRET™ PPI MCS Starter System。这个试剂盒提供带多克隆位点的NanoLuc® 融合蛋白克隆载体和HaloTag® 融合蛋白载体,检测试剂以及阳性对照。当然,你也可以选择预构建载体。NanoBRET™ 预构建载体融合了已知相互作用的蛋白的基因,无需你自行再构建载体,可直接用于转染构建细胞模型,配合检测试剂即可进行药物作

德尔塔:形形色色的蛋白标签

德尔塔:形形色色的蛋白标签

作者:德尔塔 日期:2022-04-11

体内标记 对于in vivo标记,人们通常用化学标记的营养物喂养细胞,让它们掺入新合成的蛋白、核酸或代谢物。之后收获细胞,分离出这些分子,从整体上查看细胞行为,或利用抗体或其他捕获试剂来研究某个蛋白。 蛋白质组研究人员常用的方法是SILAC,即细胞培养中氨基酸的稳定同位素标记。两组细胞同时培养,A组是在包含正常氨基酸(light)的培养基中;B组的培养基则含有“重型(heavy)”的氨基酸,即稳定同位素标记的氨基酸。然后将两组细胞混合,提取出蛋白质组,并交给质谱去测定,从而评估两种条件下的蛋白丰度差异。生物通之前对此技术有详细介绍,请看《定量蛋白质组学之SILAC技术》。 而非质谱研究人员则使用所谓的生物正交(bioorthogonal)化学反应。在生物正交系统中,人们使用带有化学基团的分子来喂养细胞,这些化学基团与天然的生物活性基团(如胺基或羧基)不起反应。外源化合物(包含该基团的反应partner)的添加引发化学反应,从而将带标签的生物分子与功能基团偶联。 赛默飞世尔提供试剂,让叠氮化物与膦基团(phosphine group)偶联。在实验中,您可以用带有叠氮化物的分子来喂养细胞,然后,用含有膦基团的试剂处理细胞,它们就会发生反应。这两种化学基团一般不存在于生物系统中,因此这些分子是惰性的。 举个例子,在培养HK-2细胞时,您可以用N-azidoacetylmannosamine来标记新合成的糖蛋白。之后,用DyLight 650-phosphine处理,观察这些蛋白。 赛默飞世尔目前提供三种不同颜色的膦基团(DyLight 488-Phosphine、DyLight 550-Phosphine和DyLight 650-Phosphine),以及生物素标记的膦基团,用于蛋白分离。 Life Technologies也有类似的点击化学试剂,名曰Click-iT,相当形象,不过它是基于铜催化的叠氮化物和炔烃之间的共价反应。当然,它也提供不含铜的试剂版本,用于活细胞应用,因为铜对于活细胞是有毒性的。 叠氮化物和炔烃都是惰性、稳定的,而且相当小。这些基团可交换,也就是说您可以

德尔塔:核糖体生产蛋白质的关键因子

德尔塔:核糖体生产蛋白质的关键因子

作者:德尔塔 日期:2022-04-11

在所有的活细胞中,DNA转录为RNA,然后RNA翻译成蛋白质。将RNA上的信息翻译为蛋白质的分子工厂被称为“核糖体”(在所附的影片显示)。这是一个庞大而复杂的实体,由RNA和蛋白质组成。 采用一种新的方法,耶鲁大学分子生物物理与生物化学系诺贝尔得奖主托马斯·施泰茨实验室的研究人员描述了,与称为延长因子4(EF4/LepA,图中为深蓝色)的新蛋白结合的核糖体的晶体结构,该蛋白在蛋白质的生产中发挥一个重要和迄今未知的作用。蛋白质的生产是所有生命中必不可少的过程。 该结构的获得新揭示了生产蛋白质的复杂过程,以及为创造更专门的药物铺平了道路。elisa试剂盒,elisa kit,西安elisa实验代测,SOD试剂盒,IgG试剂盒,IgM试剂盒,WB实验代做,免疫组化实验代做,放免实验代测,GIBCO,AMRESCO-德尔塔 原创作者:德尔塔

德尔塔 :科学家发现控制细胞微管组织的特殊蛋白

德尔塔 :科学家发现控制细胞微管组织的特殊蛋白

作者:德尔塔 日期:2022-04-11

在研究细胞结构时,可以根据形状来推测其功能。植物细胞中有一个动态的骨架,负责引导细胞的生长、发育、运动和分裂。随着时间推移,骨架的变化造就了细胞的形状和行为,*终形成整个生物体的结构和功能。微管由微管蛋白聚合而成,形成细胞骨架。微管蛋白和类微管蛋白在进化过程中是极为“保守”的,许多细菌、真菌、高等植物和动物中都有,在生物细胞的生长和分裂中起着关键作用。人们对微管在动物细胞分裂中的作用已经相当了解。细胞的“有丝分裂”过程分为多个阶段,其中包括复制一套细胞的DNA染色体,并分裂为两个独立的细胞。由微管构成的支架把复制那一半染色体拉开,并引导它们进入两个新的子细胞。但植物和动物的“微管辅助细胞分裂”之间还有一个重要区别。在动物细胞(以及酵母菌细胞)中,一般情况下,负责在分裂过程中分开染色体的微管围绕着一个中心结构来组织;而在植物细胞中,微管阵列并没有一个中心体。在没有中心体帮助定位的情况下,微管是怎样找准位置并履行自身功能的?人们对此还知之甚少elisa试剂盒,elisa kit,西安elisa实验代测,SOD试剂盒,IgG试剂盒,IgM试剂盒,WB实验代做,免疫组化实验代做,放免实验代测,GIBCO,AMRESCO-德尔塔  原创作者:德尔塔

德尔塔:TUNEL检测选择指南

德尔塔:TUNEL检测选择指南

作者:德尔塔 日期:2022-04-11

细胞凋亡一直都是细胞生物学研究的热点,这个复杂的过程涉及多条通路,可以用多种方法在不同的阶段进行检测。细胞凋亡晚期,细胞核发生形态变化、染色质凝聚、核膜降解、DN段化。TUNEL(脱氧核糖核苷酸末端转移酶(TdT)介导的缺口末端标记法)是检测DN段化的成熟方法,自1992年首次发表以来经过不断改进,纵横实验室逾20年,至今仍然是广泛采用的凋亡检测方法,这是因为TUNEL能够与其他细胞学技术很好的契合。比如,使用TUNEL分析进行凋亡研究有一个好处,研究人员在TUNEL法标记细胞之后,在直接检测和定位凋亡信号的同时,还可以通过抗体在同一个样本上检测细胞表面和细胞内的生物学指标。TUNEL的基本原理:DNA断裂时会产生大量的粘性3'-OH末端,在脱氧核糖核苷酸末端转移酶(TdT)的作用下,将生物素或荧光素或digaoxin标记的dUTP掺入到DNA的3'-末端,可通过一定的显色系统使之显示出来。过去,TUNEL算得上是个值得“用心摸索”的试剂盒,因为有点技术难度。如今市场上的TUNEL检测产品有了哪些改进和新选择呢? 考虑通透性和标记TUNEL检测的一个关键要素是把握好细胞透化的时间。透化的目的是通透细胞膜和核膜,通俗说就是在膜上打孔,让反应试剂得以充分进入细胞核进行反应,提高检测效果。门开小了大家俬不好进场,若透化不足可能检测不到凋亡的特征,造成假阴性。可开孔太过又影响形态,透化时间太长还容易脱片。 DNA的标记是另一个重要的影响因素。标记分子太大则不利于TdT将其掺入DN段。早期的分析中dUTP通常用生物素或荧光素标记,由于荧光基团的“大块头”,使得其标记的dUTP掺入DNA的效率要低于预期。后来改进为利用Br-dUTP来取代生物素或荧光素标记的dUTP,因为溴分子比荧光素、生物素等标记物要小得多,因此Br-dUTP更容易被掺入凋亡细胞的DN段中,再经过Br-dUTP抗体识别、以及抗体上偶联的生物素或荧光素放大或显色,使得*后的检测信号也更强。但是,Br-dUTP要用抗体检测,要求严谨的反应条件。更好的选择是Ed